Türkiye'de yayılış gösteren bazı otbiçen (Arachnida: Opiliones) türlerinin 16S rRNA ve mitokondriyal sitokrom oksidaz I (COI) genlerine dayalı moleküler analizi
Molecular analysis of the some species of harvestmen distiributed in Turkey based on 16S rRNA and mitochondrial cytochrome oxidase I (COI) genes
- Tez No: 607839
- Danışmanlar: PROF. DR. NALAN YILDIRIM DOĞAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Moleküler analiz, Moleküler biyoloji, Moleküler sistematik, Moleküler analysis, Molecular biology, Molecular systematic
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erzincan Binali Yıldırım Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Moleküler yöntemler, farklı taksonlara ait organizmaların tanımlanmasında ve filogenetik ilişkilerinin belirlenmesinde kullanılmaktadır. Mitokondriyal genoma ait olan SOI ve 16S rRNA genleri, DNA barkod bölgelerindendir. Çalışmada; Türkiye'de yayılış gösteren Nemastomatidae, Sclerosomatidae ve Phalangiidae familyalarına ait bazı otbiçen türlerinin moleküler özellikleri, SOI ve 16S rRNA genleri kullanılarak araştırıldı. Çalışmada, 17 türe ait 127 birey incelendi. Sanger-Coulson metodu ile elde edilen nükleotid dizileri Finch TV 1.4 programında görüntülendi. Diziler, Codon Code Aligner V.8.0:2 programı ile analiz edildi. Çift yönlü olarak dizilenen bilgiler Fasta formatında kaydedildi. Mega 7.0.26 programında Neighbor joining yöntemi kullanılarak soy ağaçları oluşturuldu ve genetik mesafe belirlendi. Nelima pontica Charitonov, 1941 türüne ait haplotipler için median joining Network analizi yapıldı. 16S rRNA gen bölgesi için çalışılan 9 bireye ait 5 haplotip ve SOI gen bölgesi için ise çalışılan 4 bireye ait 3 haplotip belirlendi. Filogenetik analiz sonuçlarına göre 16S rRNA gen bölgesine ait verilerin, SOI gen bölgesine ait verilerden daha fazla morfolojik verileri desteklediği görüldü.
Özet (Çeviri)
Molecular methods are used to identify organisms belonging to different taxa and to determine their phylogenetic relationships. SOI and 16S rRNA genes in the mitochondrial genome are DNA barcode regions. In this study, molecular characterization of some opiliones species distributed in Turkey belonging to Nemastomatidae, Sclerosomatidae and Phalangiidae families were investigated using the SO and 16S rRNA genes. 127 individuals belonging to 17 species were examined in the study. The nucleotide sequences obtained by the Sanger-Coulson method were viewed in the Finch TV 1.4 program. Sequences were analyzed with Codon Code Aligner V.8.0: 2 program. The datas of two-way sequence was recorded in Fasta format. Genealogical trees were constructed by using Neighbor joining method in Mega 7.0.26 program and genetic distance was determined. Median joining Network analysis was performed for haplotypes belonging to Nelima pontica Charitonov, 1941 species. Five haplotypes of 9 individuals studied for 16S rRNA gene region and three haplotypes of 4 individuals studied for SOI gene region were determined. According to the results of phylogenetic analysis, 16S rRNA gene region datas supported morphological characters in opilioned taxonomy than SOI gene region datas.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yayılış gösteren bazı otbiçen (Arachnida: Opiliones) türlerinin element analizi
Element analysis of some harvsetmen (Arachnida: Opiliones)species in Turkey by XRF method
ADEM ALTINTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyolojiGümüşhane ÜniversitesiOrmancılık ve Çevre Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. KEMAL KURT
- Türkiye'de yayılış gösteren bazı çekirge türlerinde (insecta:orthoptera) karyolojik incelemeler
Karyological investigations of some orthoptera (insecta:orthoptera) species living in Turkey
ŞİFA TÜRKOĞLU
- Türkiye'de yayılış gösteren bazı Lecidea liken türlerinin rDNA ITS bölgelerinin dizi analizi yöntemi ile tanımlanması
Identification of some lecidea lichen species disributed in Turkey by sequence analysis of rDNA ITS region
ESİN BAŞARAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. E. SÜMER ARAS
- Türkiye'de yayılış gösteren bazı Gagea salisb. (Liliaceae) türleri üzerinde morfolojik ve anatomik bir araştırma
A morphological and anatomical investigation on some gagea salisb. (Liliaceae) species in the Turkey
UĞUR ŞEN
- Türkiye'de yayılış gösteren bazı Lactuca L. (Asteraceae)taksonlarının moleküler sistematik analizi
Molecular systematic analysis of some Lactuca L. (Asteraceae) taxa distributed in Turkey
VEYSEL UZUN