Geri Dön

Anti-THC fab fragmanının psikoaktif bileşik THC' nin metaboliti THC-cooh' ye olan affinitesinin arttırılması için moleküler dinamik simulasyonları ile optimizasyonu

Optimization of anti-THC fab fragment with molecular dynamic simulations for increasing the affinity of the psychoactive compound THC to the metabolite thc-cooh.

PDF İndir

  1. Tez No: 614483
  2. Yazar: NURCAN GÖKKAYA
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMET CAN TİMUÇİN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Adli Tıp, Forensic Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Üsküdar Üniversitesi
  10. Enstitü: Bağımlılık ve Adli Bilimler Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Adli Bilimler Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

Cannabis bitkisinde (Cannabis sativa), 60`tan fazla yapısal olarak benzer terpenofenolik içerik mevcut olup, bunlar kannabinoidler olarak adlandırılmaktadır. Bu bitkiden hazırlananan preparatların dünya genelinde yaşadışı kullanımı çok yaygındır. Cannabis bitkisinin içinde bulunan ana psikoaktif bileşik Δ9-tetrahidrokannabinol ((-)-Δ9-THC )`dir. THC`nin düşük su çözünürlüğü, tüketim sonrası adipoz dokuda hızlıca birikmesine neden olur. İnsan vücudunda, iki tip kannabinoid reseptörü var olup, ilki çoğunlukla nöral dokuda ve beyinde var olup, CB1 (Cannabinoid receptor 1) olarak adlandırılmakta, diğeri ise çoğunlukla immun sistemde var olup, CB2 (Cannabinoid receptor 2) olarak adlandırılmaktadır. THC`nin ana metabolitleri, hidroksilasyon ile ortaya çıkan 11-hidroksi-Δ9- tetrahidrokannabinol (11-OH-THC) ve 11-nor-9-karboksi-Δ9- tetrahidrokannabinol (THC-COOH)`dür. Hidroksil metabolit, reseptör üzerinde aktivitesini devam ettirebilirken, carboksi metabolit bu aktiviteyi yitirmektedir. THC ve metabolitlerinin dağılımı, örneğe göre değişmekle birlikte, THC-COOH metaboliti, kanda ve idrarda yüksek konsantrasyonda bulunduğu için, uyuşturucu testlerinde analizi yaygındır. Tanı için diğer bir alternatif biyolojik örnek ise tükürük sıvısında analizdir. THC kullanım sonrası tükürükte yoğun olarak gözlemlenmekte ve bu dokuda zaman bağlı bir azalma göstermektedir. Amerika Birleşik Devletleri Madde Bağımlılığı ve Ruh Sağlığı Hizmet Dairesi (Substance Abuse and Mental Health Services Administration), oral sıvıda yakalanacak en düşük THC değerini 2 ng/ml olarak tavsiye etmektedir. THC`nin de oral sıvıda 24 saat ölçülebilir olarak kaldığı bilinmektedir. Tüm bu arkaplan dahilinde, yüksek spesifisiteye ve hassasiyete sahip, THC` yi tükürükten tespit edebilen platformlara ihtiyaç olduğu açıktır. Bu bağlamda, daha önce THC tanıyabilen anti-THC antikorunun Fab (Fragment antigen-binding) fragmanının yapısı bulunmuş (1) ve bu antikorun THC' yi yakalayabildiği gösterilmiştir (PDB (Protein Data Bank) Kodu: 3LS4). Çalışmamızda, bu yapısı belirlenmiş Fab fragmanının THC`ye bağlanmadan sorumlu olan amino asitlerini, diğer amino asitlere değiştirerek, THC-COOH bağlanma affinitesinin yükseltilme olasılığı araştırılmıştır. SER52HLYS tasarlanmış mutasyon grubunun hem esneklik açısından, hem de hidrojen bağları açısından THC-COOH affinitesinin arttırılması için yararlı bir mutasyon olabileceği gösterilmiştir. Böylece, gelecekte bu tezde önerilen amino asit değişiklikleri kullanılarak sentezlenecek bir anti-THC Fab fragmanı ile daha düşük miktarda THC moleküllerini yakalaması ve potansiyel olarak afinitesinin artırılması öngörülmektedir.

Özet (Çeviri)

Cannabis sativa has more than 60 structurally similar terpene phenolic contents, which is named cannabinoids. Illegal use of prepared from this plant is very common all over the world. The main psychoactive compound is, in the cannabis plant is, Δ9-tetrahydrocannabinol (THC). The low water solubility of THC lead to rapid deposition in adipose tissue after consumption. There are two types of cannabinoid receptors in the human body, the first is mostly in neural tissue and brain, which is called CB1 (Cannabinoid receptor 1), and the other is, mostly in the immune system, CB2 (Cannabinoid receptor 2). The main metabolites of THC are 11-hydroxy-Δ-9-tetrahydrocannabinol (11-OH-THC) and 11-nor-9-carboxy-Δ9-tetrahydrocannabinol (THC-COOH) which are formed by hydroxylation. While the hydroxyl metabolite can maintain activity on the receptor, the carboxy metabolite loses this activity. Although the distribution of THC and its metabolites change according to the sample, the THC-COOH metabolite is found with high concentrations in the blood and urine, so its analysis is common in drug tests . Another alternative biological sample is analyse of salivary fluid for diagnosis. THC usually is observed in saliva after use and shows a time-dependent decreasing in this biological sample. The United States Substance Abuse and Mental Health Services Administration recommend the lowest THC value is to be diagnosed in the oral fluid at 2 ng / ml. THC is known to remain measurable in oral fluid for 24 hours. Within all this background, it is clear that there is a need for platforms with high specificity and sensitivity, which can detect THC from saliva. In this background, the structure of the Fab fragment of the anti-THC antibody capable of detecting THC previously was found (1) and was shown to be able to capture THC (PDB (Protein Data Bank) Code: 3LS4). In our study, the possibility of increasing the THC-COOH binding affinity was investigated by changing the amino acids which is responsible for binding to THC of this Fab fragment determined. The SER52HLYS mutation design group has been shown to be a useful mutation to increase THC-COOH affinity, both in terms of flexibility and hydrogen bonds. Thus, it is predicted that in the future an anti-THC Fab fragment will be synthesized using the amino acid changes proposed in this thesis to capture lower amounts of THC molecules and potentially increase their affinity.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    867841

    Tetrahidrocurcumin'in (THC) anaplastik tiroid kanserinde doxorubicine ve paclitaksel direnç mekanizmalarına anti-kanser parametrelere etkinliğinin incelenmesi

    Investigation of the effectiveness of tetrahydrocurcumin (THC) on doxorubicine and paclitaksel resistance mechanisms and anti-cancer parameters in anaplastic thyroid cancer

    MEHMET ALİ KOÇDOR

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    Moleküler TıpDokuz Eylül Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NUR ARSLAN

  2. Tez No

    437529

    İnsan larinks yassı hücreli kanseri hücre dizisinde endokannabinoidlerin ve kannabinoid reseptörlerinin varlığının ve düzeyinin araştırılması

    The existence and level investigation of endocannabinoids and cannabinoid receptors in human laryngeal squamous cell carcinoma cell line

    ÖVSEN ÖNAY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Kulak Burun ve BoğazHacettepe Üniversitesi

    Kulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NİLDA SÜSLÜ

  3. Tez No

    795292

    Molecular docking study of some modified natural products as potential anticancer agents

    Bazı değiştirilmiş doğal ürünlerin potansiyel antikanser ajanlar olarak moleküler yerleştirme çalışması

    MARWAN ADNAN AHMED AL-JANABI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED MAHAL

  4. Tez No

    66641

    O-Disiyano sübstitüe yeni bir dioksim türevi sentezi ve komplekslerinin incelenmesi

    Synthesis and complexation of novel o-disubstituted vic-dioximes

    BÜLENT ELMA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Kimyaİstanbul Teknik Üniversitesi

    Anorganik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET GÜL

  5. Tez No

    720218

    Rg-flows, ads/cft correspondence and stability of non-dilatonic branes

    Başlık çevirisi yok

    ARKADAS INAN OZAKİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2004

    İstatistikCalifornia Institute of Technology

    PROF. STEVEN GUBSER

Geri Dön