Molecular docking study of some modified natural products as potential anticancer agents
Bazı değiştirilmiş doğal ürünlerin potansiyel antikanser ajanlar olarak moleküler yerleştirme çalışması
- Tez No: 795292
- Danışmanlar: PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU, DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED MAHAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyokimya Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 53
Özet
Bu araştırma, göğüs kanserine karşı önerilen bazı tetrahidrokurkumin türevlerinin (1-6) Docking ve DFT çalışmaları ile öngörülmesini içermektedir. Discovery Studio Visualizer (DSV) ve MGL (Moleküler Grafik Laboratuvarı) Autodock işlemini gerçekleştirmiştir. Moleküllerin adsorpsiyon alanları, Toplam Elektron Yoğunluğu (TED) ölçülerek ortaya çıkarılmıştır. Hangi moleküllerin diğerlerinden daha verimli olduğunu saptamak için kullanılan çok daha fazla değişken bulunmaktadır. Tetrahidrokurkumin türevlerinin bağlanma enerjisi (Eb), tetrahidrokurkumin türevlerinin inhibitör kabiliyetini araştırmak için docking simülasyonlarında kullanılmıştır. DFT ve docking, C, THC ve THCN3 en etkili inhibitör pozisyonları olduğunu göstermiştir, ve en az etkili inhibitör pozisyonlar THCN,THCN1 and THCN2.
Özet (Çeviri)
The current work comprised the prediction of a few tetrahydrocurcumin derivatives (1-6) that Docking and DFT investigations suggest may be anti-breast cancer. The Autodock technique was carried out by MGL (Molecular Graphic Laboratory) and Discovery Studio Visualizer (DSV). Total Electron Density (TED) measurements were used to identify the adsorption sites for molecules . To identify which compounds were more effective than others, numerous factors were taken into consideration. In order to examine the inhibitory potential of tetrahydrocurcumin derivatives, the binding energy (Eb) of these compounds was used in docking simulations. DFT and docking revealed that C, THC, and THCN3 were the most effective inhibitory positions, and the least effective inhibitory positions it is THCN,THCN1 and THCN2.
Benzer Tezler
- In Silico and experimental determination of IL1β-receptor inhibitor peptides
Bilgisayar ortamında ve deneysel olarak IL1-β reseptör inhibitörü peptitlerin belirlenmesi
FULYA AKŞİT
Yüksek Lisans
İngilizce
2020
Kimya MühendisliğiKoç ÜniversitesiKimya ve Biyoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CEM ALBAYRAK
PROF. DR. BURAK ERMAN
- Testing the activity of biguanide derivatives and some novel molecules against SARS-CoV-2, in silico study
Bıguanide türevleri ve bazı yeni moleküllerin SARS-CoV-2'ye karşı etkinliklerinin siliko çalışmasında test edilmesi
MOHAMMED EFENDİ
- Modeling protein assemblies in the proteome
Proteomdaki protein tümleşiklerini modellemek
GÜRAY KUZU
Doktora
İngilizce
2014
Mühendislik BilimleriKoç ÜniversitesiHesaplamalı Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEHRA ÖZLEM KESKİN ÖZKAYA
PROF. DR. ATTİLA GÜRSOY
- The in vitro and in silico inhibition mechanism of glutathione reductase by some small molecules
Bazı küçük moleküller tarafından glutatyon redüktazın in vitro ve in silico inhibisyon mekanizması
AHMED SABAH SHAMI MOSLEH
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyokimyaÇankırı Karatekin ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. VOLKAN EYÜPOĞLU
- Docking study of resveratrol like molecules on histone deacetylase 8
Docking Study of Resveratrol like Molecules on Histone Deacetylase 8
FATMA M.AB. ALNEMSİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyomühendislikKadir Has ÜniversitesiHesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEMAL YELEKÇİ
YRD. DOÇ. DR. ŞEBNEM EŞSİZ GÖKHAN