Genome and chromosome properties of bambara groundnut, Vigna subterranea
Bambara yerfıstığının genom ve kromozom özellikleri, Vigna subterranea
- Tez No: 620390
- Danışmanlar: ASSOC. DR. AHMET LATİF TEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Ziraat, Genetics, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Bambara yer fıstığı, DAPI boyama, klonlam, sentromerik DNA, tandem tekrarlara doldurulacaktır, Bambara groundnut, centromeric DNA, cloning, DAPI staining, tandem repeatscaktır
- Yıl: 2020
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genetik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bambara yer fıstığı (Vigna subterranea, 2n = 2x = 22), çoğunlukla Afrika'nın kurak ve yarı kurak bölgelerinde yetiştirilen yerli baklagil bitkisidir. Yüksek miktarda protein içerdiğinden dolayı çok besleyici bir üründür. Bununla birlikte, bu baklagil bitkisi üzerindeki çalışmalar son derece sınırlıdır. Bu çalışma, ayrıntılı kromozom çalışmalarına temel teşkil etmek amacıyla bambara yer fıstığı sentromer DNA dizisi hakkında temel bilgiler sağlamayı amaçlamaktadır. Bu araştırma için Nijerya'dan tohumlar kullanıldı. Elde ettiğimiz sonuçlar bambara yer fıstığının, börülce (V. unguiculata)'de tespit edilen 455 bazçifti (bç) sentromerik DNA tekrarları ile yüksek DNA dizi benzerliğine sahip olduğunu göstermektedir. DNA sekans sonuçlarından, klonların boyutlarının börülce genomundaki 455 bç sentromerik DNA tekrarlarından daha az olduğunu göstermiştir. Ayrıca DNA dizi sonuçları içerisinde hiçbir alt motif veya tekrar tespit edilmemiştir. Metafaz kromozom hazırlanmasından, metasentrik ve submetasentrik kromozomlar daha az yapısal değişkenlik ile gözlenmiştir. Bu çalışma sonucunda, DAPI boyaması ve sentromerik DNA klonlanmasıyla dizi analizi yapılarak somatik metafaz kromozomlarının hazırlanması için etkili bir yöntem geliştirmiştir.
Özet (Çeviri)
Bambara groundnut (Vigna subterranea, 2n = 2x = 22) is an indigenous leguminous crop cultivated mostly in the arid and semi-arid regions of Africa. It is a very nutritious crop since it contains a high amount of protein. However, studies on this pulse crop are very limited. This study is aimed at providing fundamental knowledge on bambara groundnut centromere DNA sequence for further chromosome studies. In this regard, seeds of bambara groundnut were obtained from Nigeria for the research. The results indicate that bambara groundnut has a higher pairwise similar identity with that of 455 bp centromeric DNA repeats of cowpea. There was no internal motif/repetition from the DNA sequencing indicating that the sizes of the clones were lesser than the 455 bp centromeric DNA repeats in cowpea. From the metaphase chromosome preparation, metacentric and sub-metacentric chromosomes were observed with less structural variability. The sizes of the chromosomes were smaller making it relatively impossible to identify the homologous pairs. This study has successfully developed an efficient method for the preparation of somatic metaphase chromosomes using DAPI staining and sequence analysis by cloning of centromeric DNA.
Benzer Tezler
- Comparative whole genome sequencing and bioinformatic analysis of afreeze-thaw stress-resistant, industrial Saccharomyces cerevisiae strain
Donma-erime stresine dirençli bir endüstriyel Saccharomyces cerevisiae suşunun karşılaştırmalı tüm genom dizileme ve biyoinformatik analizi
BURCU TUĞBA ŞİMŞEK
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Drosophila melanogaster'de parkin geni ile etkileşen ve lokomotor davranışı etkileyen genlerin genomik ilişkilendirme modeliyle saptanması
Determination of the genes underlying locomotor behavior and interacting with the parkin gene by using a genom wide association model of Drosophila melanogaster
DAMLA AYGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
GenetikHacettepe ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERGİ DENİZ ÖZSOY
- Patojen ilişkili protein 1 (pr-1) genlerinin karpuz bitkisinde (Citrullus lanatus (Thumb.) Matsum. & Nakai) genom çapında in-silico analizi
Genome-wide in-silico evaluation of pathogen-related protein 1 (pr-1) genes in watermelon (Citrullus lanatus (Thumb.) Matsum. & Nakai)
TAMELLA SULEYMANOVA
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
GenetikHaliç ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET EMİN URAS
DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSTAFA ZAFER KARAGÖZLÜ
- Sentetik buğdaylardan nişasta eldesi ve karakterizasyonu
Isolation and characterization of starch from synthetic hexaploid wheat samples
AHMET ŞENOL
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Gıda MühendisliğiSakarya ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERPİL ÖZTÜRK MUTİ