Geri Dön

Keratokonjonktivit ön tanılı hastalardan izole edilen adenovirüs suşlarının alt tiplendirilmesi

Subtyping of adenovirus strains isolated from patients pre-diagnosed with keratoconjunctivitis

PDF İndir

  1. Tez No: 624070
  2. Yazar: AYFER GÜNER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. AYŞEGÜL KARAHASAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

AMAÇ: Bu çalışmanın amacı klinik olarak keratokonjonktivit ön tanılı hastalardan alınan konjonktival sürüntü örneklerinde insan adenovirüsü (hAdV) varlığını araştırmak ve alt tiplerini belirlemektir. GEREÇ ve YÖNTEM: Ocak 2018 ve Kasım 2019 tarihleri arasında, AdenoPlus ™ (Rapid Pathogen Screening Inc., ABD) hızlı tanı kiti ile pozitif sonuç veren keratokonjonktivit ön tanılı 82 hasta çalışmaya dahil edildi. Nükleik asit ekstraksiyonu ve kantitasyonu, kantitatif gerçek zamanlı PCR yöntemi kullanılarak ELITe InGenius (ELITechGroup, İtalya) cihazı ile gerçekleştirildi. DNA dizi analizi ABI PRISM® 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, USA) cihazı ile yapıldı. Elde edilen hADV DNA dizileri BLAST analizi ile tiplendirildi ve genotipler NCBI'nin referans hADV dizileri kullanılarak tanımlandı. Oftalmoloji polikliniğinde uygulanan dezenfeksiyon etkinliğini değerlendirmek ve farkındalığı arttırmak amacıyla çevresel sürüntü örnekleri alarak adenovirüsün varlığı araştırıldı. BULGULAR: Keratokonjonktivit ön tanılı 82 hastada hADV pozitifliği doğrulandı. Hekzon geni pozitif 72 örnekte üç genotip tanımlandı: hAdV-8 (n: 69, %95.8), hAdV-4 (n: 2, % 2.8), hAdV-19 (n: 1, % 1.4). Viral yük ortanca değeri 7,1 log 10 kopya / mL (4,7-7,4) saptandı. Filogenetik ağaçta baskın genetik yakınlık gözlemlenmedi. Çevresel örneklerde dezenfeksiyon sonrasında dahi hADV pozitifliği saptandı. SONUÇLAR: Çalışmamız oküler enfeksiyonlarda adenovirüslerin genotiplendirilmesine yönelik ilimiz ve bölgemizde yapılan ilk çalışmadır ve bulgularımız ilgili ulusal moleküler epidemiyolojik verilere katkıda bulunacaktır.

Özet (Çeviri)

AIM: The aim of this study was to investigate the presence and determine the subtypes of human adenovirus (hAdV) in conjunctival swab samples taken from patients clinically pre-diagnosed as keratoconjunctivitis. MATERIALS/METHODS: Between January 2018 and November 2019, 82 patients with pre-diagnosed keratoconjunctivitis who had positive results with the AdenoPlus ™ (Rapid Pathogen Screening Inc., USA) rapid diagnostic kit were included in the study. The nucleic acid extraction and quantitation were performed by ELITe InGenius® (ELITechGroup, Italy) instrument using quantitative real-time PCR method. DNA sequence analysis was performed with ABI PRISM® 3100 Genetic Analyzer (Applied Biosystems, USA). The obtained hAdV DNA sequences were typed by BLAST analysis and the genotypes were identified by using the reference hAdV sequences of the NCBI. In order to evaluate the disinfection effectiveness applied in the ophthalmology outpatient clinic and to raise awareness, we investigated the presence of adenovirus by taking environmental swab samples. RESULTS: hADV positivity was confirmed in 82 patients with pre-diagnosis of keratoconjunctivitis. Three genotypes were identified from 72 hexon gene positive samples: hAdV-8 (n: 69, 95.8%), hAdV-4 (n: 2, 2.8%), hAdV-19 (n: 1, 1.4%). The median viral load was 7,1 log 10 copies/mL (4,7- 7,4). No predominant genetic relation was observed from the phylogenetic tree. hADV positivity was detected even after disinfection procedures in environmental samples. CONCLUSIONS: Our study is the first study in our province and region for the genotyping of adenoviruses in ocular infections, and our findings will contribute to relevant national molecular epidemiological data.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    846274

    The role of oxidative stress factors in the pathophysiology of Ocular Rosacea, analysis of tears and other materials

    Oküler Rosacea patofizyolojisinde oksidatif stres faktörlerinin rolü, gözyaşı ve diğer materyallerin analizi

    NİLÜFER YEŞİLIRMAK

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyokimyaGazi Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NESLİHAN BUKAN

    PROF. DR. JEAN-LOUIS BOURGES

  2. Tez No

    520962

    Konjonktivitli olgularda adenovirus sıklığının araştırılması

    Investigation of adenovirus fluctuation in conjunctivitis cases

    ASLIHAN BEKCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SEDA TEZCAN ÜLGER

  3. Tez No

    54659

    Allerjik konjonktivitlerin tedavisinde topikal antiallerjik ilaçların etkinliklerinin klinik ve deneysel olarak araştırılması

    Başlık çevirisi yok

    AVNİ ULUDAĞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1996

    Göz HastalıklarıGATA

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. EROL YILDIRIM

  4. Tez No

    434447

    Vernal keratokonjonktivit hastalarındaki korneal değişikliklerin korneal topografi ile değerlendirilmesi

    Evaluation of Corneal Changes of Patients Diagnosed with Vernal Keratoconjunctivitis with Corneal Topography

    ALİ HAKİM REYHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Göz HastalıklarıAdıyaman Üniversitesi

    Göz Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ŞEMSETTİN BİLAK

  5. Tez No

    310028

    Keratokonjonktivit yapan adenovirusların genotip prevalansı

    Genotype prevalance of adenoviruses causing keratoconjunctivitis

    BEGÜM NALÇA ERDİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYÇA ARZU SAYINER

Geri Dön