T Hücreli Non-Hodgkin lenfomalarda MikroRNA ifade profillendirmesi ve ayırıcı tanıdaki önemi
MicroRNA profiling in the T Cell lymphomas and significance of differential diagnosis
- Tez No: 625648
- Danışmanlar: PROF. DR. IŞINSU KUZU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2015
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
T/NK hücreli non-Hodgkin lenfomalar (T/NKHNHL) patogenezleri ile ilgili sınırlı bilgi, ayırıcı tanıları ve tedavi başarılarında güçlükler bulunduran neoplazilerdir. MikroRNA'lar (miRNA) gen ifadelerini“post-transkripsiyonel”olarak regüle eden ve lenfoma dahil çoğu neoplazide anormal olarak ifade olan küçük RNA'lardır. Ayırıcı tanı ve hedefe yönelik tedaviler için önemli aday moleküllerdir. T/NKHNHL'lerda miRNA ifade profili ve patogenezdeki rolleri hakkında sınırlı bilgi bulunmaktadır. Bu çalışmada, birbiriyle ayırım güçlüğü bulunduran Anjioimmünoblastik T hücreli lenfomalar (AİTHL), CD30+ ve CD30- Periferik T hücreli lenfoma-NOS (PTHL-NOS) ve reaktif hiperplazi olgularının miRNA ifade profilli belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi (AÜTF) Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı'nda 2006-2013 yılları arasında CD30-/CD30+ PTHL-NOS, AİTHL ve benign reaktif hiperplazi tanısı almış olgular Dünya Sağlık Örgütü (WHO) kriterlerine göre iki patolog (GK ve IK) tarafından yeniden değerlendirilmiştir. Çalışmamızda, 6 CD30-, 6 CD30+ olmak üzere toplamda 12 PTHL-NOS ve 8 AİTHL ile 10 reaktif hiperplazi formalin tespitli parafine gömülü (FTPG) lenf nodu örneklerinde mikrodizin analizi gerçekleştirilmiştir. Nodal tip T/NK hücreli lenfomalar ile reaktif hiperplazi olguları arasında 62 miRNA'nın farklı şekilde ifade olduğu ve bunların çoğunluğunun T/NK hücreli lenfomalarda ifadesinin azaldığı belirlenmiştir (MannWhitneyU, p<0.001). hsa-miR-4746-3p'nin en fazla artış, hsa-miR-144-3p'nin ise en fazla azalış gösteren miRNA'lar olduğu bulunmuştur. Hasta alt gruplarından AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında 1, AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında 7, CD30- PTHL-NOS ile CD30+ PTHL-NOS arasında 12 miRNA'nın farklı olarak ifade oldukları görülmüştür (Kruskal Wallis, p<0.05). AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında en fazla farklılık gösteren miRNA hsa-miR-99b-5p, AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında hsa-miR-222-3p, CD30- ile CD30+ PTHL-NOS arasında hsa-miR-221-3p dır. Farklı şekilde ifade olduğu belirlenen 9 miRNA'nın 5'i QRT-PZR analizi ile doğrulanmıştır. Bu çalışma ile AİTHL, CD30+ ile CD30- PTHL-NOS hasta altgrupları ve reaktif hiperplazi örneklerinin birbirlerinden farklı miRNA ifadeleri sergiledikleri gösterilmiştir. Bunlar lenfoma antitelerinin gelişim biyolojisinin açıklanmasında kullanılabilecek aday belirteçler olabilirler.
Özet (Çeviri)
T/NK cell non-Hodgkin lymphomas (T/NKCNHL) are mature T cell neoplasia, which have not been very well understood with their pathogenesis. There are difficulties on their differential diagnosis and poor success on therapy. MicroRNA's (miRNA) are group of non cooding RNA molecules regulating gene expression at postranscriptional level. These small RNA molecules are usually abnormally expressed in various neoplasia including lymphomas. They are important candidate molecules to solve the problem of differential diagnosis between T cell lymphoma subgroups, as well as promising therapy targets. The miRNA expression profile of T/NKCNHL is not very well documented. In this study our aim is to examine the miRNA profile of Angioimmunoblastic T cell lymphomas (AITCL), CD30+ and CD30- Peripheral T cell lymphomas not otherwise specified (PTCL-NOS) and compare with reactive lymphoid hyperplasia. In this study T cell lymphomas diagnosed between 2006-2013 in the Department of Pathology School of Medicine University of Ankara were reexamined by the two Pathologists (IK and GK) and classified according to the 2008 WHO criteria. The formalin fixed parafine embeded lymph node tissue samples were used for miRNA microarray analysis. Six cases of CD30+, 6 cases of CD30- PTCL-NOS, 8 AITCL and 10 reactive lymphoid hyperplasia were selected. There were 62 miRNA's siginificantly different between PTCL and reactive hyperplasia, mostly presenting downregulated expression (MannWhitneyU, p<0.001) in PTCL group. Hsa-miR-4746-3p was the most increased and hsa-miR-144- was the most decreased distingtive miRNA's in PTCL. Microarray results revealed 1 distingtive miRNA between AITCL and CD30- PTHL-NOS, 7 miRNA's between AITCL and CD30+ PTHL-NOS, 12 miRNA's between CD30- PTHL-NOS and CD30+ PTHL-NOS (Kruskal Wallis, p<0.05). Hsa-miR-99b-5q in AITCL and CD30+ PTHLNOS, hsa-miR-222-3p in AITCL and CD30- PTHL-NOS, hsa-miR-221-3p in CD30- PTHL-NOS and CD30+ PTHL-NOS were the distingtive miRNA's. We confirmed the expression of the 5 of 9 miRNA's by QRT-PZR. The result of this study revealed that, disease groups AITCL, CD30+ PTHL-NOS, CD30- PTHL-NOS and the reactive lymphoid hyperplasia have different miRNA expression which can be promising candidate markers for explaining the biology of the lymphoma entities.
Benzer Tezler
- Non-hodgkin lenfomalarda T ve B hücre tipini belirlemede immünhistokimyanın yeri
Başlık çevirisi yok
LEVENT ÇAKMAKLI
- Matür T ve B hücreli lenfoproliferatif hastalıklarda tanı anında kemik iliği tutulumunun immünohistokimya ve akım sitometri yöntemi ile karşılaştırılması
Comparison of bone marrow involvement at the time of diagnosis in mature T and B cell lymphoproliferative diseases with immunohistochemistry and FLOW cytometric methods
AYLİN YILMAZ AYGÜN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
HematolojiAnkara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELTEM YÜKSEL
- Non-hodgkin lenfomalarda gen düzenlemelerinin araştırılması
Detection of gene rearrangements in non-hodgkin's lymphoma
HÜLYA YAZICI
- Non-hodgkin ve hodgkin lenfoma hastalarında tanı ile tedavi arasındaki sürenin ve tedavideki gecikmelerin nüks ve mortalite ile ilişkisi
Associations of time from diagnosis to treatment and intercycle delays with mortality and recurrence in non-hodgkin lymphoma and hodgkin lymphoma patients
DENİZ DÖNMEZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
HematolojiHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERKAN AKIN
- Düşük ve ara gradeli non-hodgkin lenfomalar: 278 olgunun geriye yönelik klinikopatolojik analizi
Başlık çevirisi yok
NESRİN UYGUN