Geri Dön

T Hücreli Non-Hodgkin lenfomalarda MikroRNA ifade profillendirmesi ve ayırıcı tanıdaki önemi

MicroRNA profiling in the T Cell lymphomas and significance of differential diagnosis

  1. Tez No: 625648
  2. Yazar: YASEMİN ŞAHİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. IŞINSU KUZU
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2015
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

T/NK hücreli non-Hodgkin lenfomalar (T/NKHNHL) patogenezleri ile ilgili sınırlı bilgi, ayırıcı tanıları ve tedavi başarılarında güçlükler bulunduran neoplazilerdir. MikroRNA'lar (miRNA) gen ifadelerini“post-transkripsiyonel”olarak regüle eden ve lenfoma dahil çoğu neoplazide anormal olarak ifade olan küçük RNA'lardır. Ayırıcı tanı ve hedefe yönelik tedaviler için önemli aday moleküllerdir. T/NKHNHL'lerda miRNA ifade profili ve patogenezdeki rolleri hakkında sınırlı bilgi bulunmaktadır. Bu çalışmada, birbiriyle ayırım güçlüğü bulunduran Anjioimmünoblastik T hücreli lenfomalar (AİTHL), CD30+ ve CD30- Periferik T hücreli lenfoma-NOS (PTHL-NOS) ve reaktif hiperplazi olgularının miRNA ifade profilli belirlenmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi (AÜTF) Tıbbi Patoloji Anabilim Dalı'nda 2006-2013 yılları arasında CD30-/CD30+ PTHL-NOS, AİTHL ve benign reaktif hiperplazi tanısı almış olgular Dünya Sağlık Örgütü (WHO) kriterlerine göre iki patolog (GK ve IK) tarafından yeniden değerlendirilmiştir. Çalışmamızda, 6 CD30-, 6 CD30+ olmak üzere toplamda 12 PTHL-NOS ve 8 AİTHL ile 10 reaktif hiperplazi formalin tespitli parafine gömülü (FTPG) lenf nodu örneklerinde mikrodizin analizi gerçekleştirilmiştir. Nodal tip T/NK hücreli lenfomalar ile reaktif hiperplazi olguları arasında 62 miRNA'nın farklı şekilde ifade olduğu ve bunların çoğunluğunun T/NK hücreli lenfomalarda ifadesinin azaldığı belirlenmiştir (MannWhitneyU, p<0.001). hsa-miR-4746-3p'nin en fazla artış, hsa-miR-144-3p'nin ise en fazla azalış gösteren miRNA'lar olduğu bulunmuştur. Hasta alt gruplarından AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında 1, AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında 7, CD30- PTHL-NOS ile CD30+ PTHL-NOS arasında 12 miRNA'nın farklı olarak ifade oldukları görülmüştür (Kruskal Wallis, p<0.05). AİTHL ile CD30+ PTHL-NOS arasında en fazla farklılık gösteren miRNA hsa-miR-99b-5p, AİTHL ile CD30- PTHL-NOS arasında hsa-miR-222-3p, CD30- ile CD30+ PTHL-NOS arasında hsa-miR-221-3p dır. Farklı şekilde ifade olduğu belirlenen 9 miRNA'nın 5'i QRT-PZR analizi ile doğrulanmıştır. Bu çalışma ile AİTHL, CD30+ ile CD30- PTHL-NOS hasta altgrupları ve reaktif hiperplazi örneklerinin birbirlerinden farklı miRNA ifadeleri sergiledikleri gösterilmiştir. Bunlar lenfoma antitelerinin gelişim biyolojisinin açıklanmasında kullanılabilecek aday belirteçler olabilirler.

Özet (Çeviri)

T/NK cell non-Hodgkin lymphomas (T/NKCNHL) are mature T cell neoplasia, which have not been very well understood with their pathogenesis. There are difficulties on their differential diagnosis and poor success on therapy. MicroRNA's (miRNA) are group of non cooding RNA molecules regulating gene expression at postranscriptional level. These small RNA molecules are usually abnormally expressed in various neoplasia including lymphomas. They are important candidate molecules to solve the problem of differential diagnosis between T cell lymphoma subgroups, as well as promising therapy targets. The miRNA expression profile of T/NKCNHL is not very well documented. In this study our aim is to examine the miRNA profile of Angioimmunoblastic T cell lymphomas (AITCL), CD30+ and CD30- Peripheral T cell lymphomas not otherwise specified (PTCL-NOS) and compare with reactive lymphoid hyperplasia. In this study T cell lymphomas diagnosed between 2006-2013 in the Department of Pathology School of Medicine University of Ankara were reexamined by the two Pathologists (IK and GK) and classified according to the 2008 WHO criteria. The formalin fixed parafine embeded lymph node tissue samples were used for miRNA microarray analysis. Six cases of CD30+, 6 cases of CD30- PTCL-NOS, 8 AITCL and 10 reactive lymphoid hyperplasia were selected. There were 62 miRNA's siginificantly different between PTCL and reactive hyperplasia, mostly presenting downregulated expression (MannWhitneyU, p<0.001) in PTCL group. Hsa-miR-4746-3p was the most increased and hsa-miR-144- was the most decreased distingtive miRNA's in PTCL. Microarray results revealed 1 distingtive miRNA between AITCL and CD30- PTHL-NOS, 7 miRNA's between AITCL and CD30+ PTHL-NOS, 12 miRNA's between CD30- PTHL-NOS and CD30+ PTHL-NOS (Kruskal Wallis, p<0.05). Hsa-miR-99b-5q in AITCL and CD30+ PTHLNOS, hsa-miR-222-3p in AITCL and CD30- PTHL-NOS, hsa-miR-221-3p in CD30- PTHL-NOS and CD30+ PTHL-NOS were the distingtive miRNA's. We confirmed the expression of the 5 of 9 miRNA's by QRT-PZR. The result of this study revealed that, disease groups AITCL, CD30+ PTHL-NOS, CD30- PTHL-NOS and the reactive lymphoid hyperplasia have different miRNA expression which can be promising candidate markers for explaining the biology of the lymphoma entities.

Benzer Tezler

  1. Non-hodgkin lenfomalarda T ve B hücre tipini belirlemede immünhistokimyanın yeri

    Başlık çevirisi yok

    LEVENT ÇAKMAKLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1994

    PatolojiCumhuriyet Üniversitesi

    PROF.DR. HANDAN AKER

  2. Matür T ve B hücreli lenfoproliferatif hastalıklarda tanı anında kemik iliği tutulumunun immünohistokimya ve akım sitometri yöntemi ile karşılaştırılması

    Comparison of bone marrow involvement at the time of diagnosis in mature T and B cell lymphoproliferative diseases with immunohistochemistry and FLOW cytometric methods

    AYLİN YILMAZ AYGÜN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    HematolojiAnkara Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MELTEM YÜKSEL

  3. Non-hodgkin lenfomalarda gen düzenlemelerinin araştırılması

    Detection of gene rearrangements in non-hodgkin's lymphoma

    HÜLYA YAZICI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    Onkolojiİstanbul Üniversitesi

    Temel Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEJAT DALAY

  4. Non-hodgkin ve hodgkin lenfoma hastalarında tanı ile tedavi arasındaki sürenin ve tedavideki gecikmelerin nüks ve mortalite ile ilişkisi

    Associations of time from diagnosis to treatment and intercycle delays with mortality and recurrence in non-hodgkin lymphoma and hodgkin lymphoma patients

    DENİZ DÖNMEZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    HematolojiHacettepe Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SERKAN AKIN