Geri Dön

Gram pozitif bakteri üremesi saptanan kan kültürlerinde genotiplendirme ile idendifikasyon ve direnç tayini

Identification and resistant gene detection with genotyping in blood cultures with gram positive bacteria growth

PDF İndir

  1. Tez No: 626743
  2. Yazar: ZİYA ERDOĞAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. CİHADİYE ELİF ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Moleküler Tıp, Microbiology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Sepsis, Kan kültürü, Genotipik testler, Gram pozitif kok, mecA, van genleri, hızlı moleküler test, Sepsis, Blood culture, Genotypic tests, Gram positive cocci, mecA, van Genes, rapid molecular testing
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Düzce Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 72

Özet

Sepsiste etken bakterinin ve antibiyotik dirençlerinin hızlı şekilde tanımlanması çok önemlidir. Tedavinin en kısa sürede başlanması ile morbidite/mortalite azalmakta, hastanede yatış süresi kısalmakta, gereksiz antibiyotik kullanımı önlenmekte ve hastane maliyetlerinin düşmesi sağlanmaktadır. Otomatize kan kültür sistemleri, bakteriyel patojenlerin tanımlanma süresini önemli ölçüde kısaltmıştır. Buna rağmen doğru tedaviye en erken dönemde başlanabilmesi için daha hızlı tanımlama sistemleri gerekmektedir. Çalışmamızda, hastanemiz servislerinde yatan hastalara ait Gram pozitif bakteri üremesi olan kan kültürlerinde“Genotype® BC Gram-positive (Hain Lifesience, Almanya)”testi kullanılarak genotiplendirilmesi, mecA, vanA, vanB, vanC1, vanC2/C3 genlerinin hızlı tespiti amaçlanmıştır. Çalışmaya, bakteri kültürü ile 35(% 77.7)'i MR-KNS olan 45 KNS, 9(%52.9)'u MRSA olan 17 S.aureus, 2(%22.2)'si VRE olan 9 Enterokok ve bir S. grup D tanımlanmış toplam 72 örnek dahil edilmiştir. Genotipleme yöntemiyle 37(%75.5)'sinde Mec A pozitif olan toplam 49 KNS, 9(% 52.9)'unda mecA pozitif olan toplam 17 S.aureus, 2(%20)'sinde vanA pozitif olan toplam 10 Enterococcus, 2 S.pneumoniae ve 2 S. mitis/oralis bulunmuştur. Genotipleme yöntemi ile kültürde tespit edilemeyen 2 S. pneumoniae, 2 S. mitis/oralis belirlenmiştir. İstatistiksel değerlendirmede; tüm bakteri türleri için bakteri kültürü ile genotipleme yöntemleri arasında anlamlı düzeyde bir uyum bulunmuştur (p=0,999). BC Gram pozitif testinin, sepsis etkeni olan bakterileri, bu bakterilere ait direnç genlerini ve miksenfeksiyon etkenlerini 4-5 saatte doğru olarak tespit ettiği gözlenmiştir. Bu nedenlerle genotiplendirmenin sepsis düşünülen hastalarda erken klinik tanıya ve tedaviye katkıda bulunabileceği düşünülmüştür. Ancak çalışmamızda kültürde bakteri saptanan 10 örnekte genotipleme yöntemi sonuçlanmadığı görülmüştür. Bu nedenle sepsis tanısında kültür ve moleküler yöntemlerin birlikte kullanılmasının çok önemli olduğu düşünülmüştür.

Özet (Çeviri)

Rapid identification of the bacteria and antibiotic resistance causing sepsis is very important. Beginning with the appropriate treatment as soon as possible reduced morbidity/mortality, shortened the hospitalization time, prevented the unnecessary antibiotic use and reduced the hospital costs. Automated blood culture systems have significantly reduced the identification time of bacterial pathogens. However, faster identification systems are required to begin the right treatment as early as possible. The aim of this study is identification and resistant gene detection (mecA gene and vanA, vanB, vanC1, vanC2/C3 genes that cause methicillin and vancomycin resistance) with genotyping method (Genotype® BC Gram-positive) in blood cultures with gram positive bacteria growth which were obtained from inpatient from Düzce University Hospital's services.The study included a total of 72 Gram positive bacteria (which are 45 CNS, 17 S. aureus,9 Enterococci and one S. group D) identified in blood culture samples. Genotyping revealed a total of 49 CNS of which 37 (75%) is mecA positive; a total of 17 S.aureus of which 9 (52.9%) is mecA positive; a total of 10 enterococci of which 2(20%) vanA positive; 2 S.pneumoniae and 2 S. mitis / oralis. Two S. pneumoniae and 2 S. mitis / oralis which could not be detected in the culture, were determined by genotyping method. In the statistical evaluation performed as a result of genotyping study; there was a significant correlation between bacterial culture and genotyping methods for all bacterial species (p = 0.999).Using the BC Gram positive test, sepsis causative bacteria from blood culture bottles and resistance genes of these bacteria were detected correctly within 4-5 hours. For this reason it was found that genotyping may contribute to early clinical diagnosis and treatment of sepsis patients. However, in our study, genotyping method was not found in 10 samples with bacteria detected in culture. Therefore, it is thought that the use of culture and molecular methods together is very important in the diagnosis of sepsis.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    803438

    2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi

    The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021

    DİDEM ÖZKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYFER BAKIR

  2. Tez No

    551269

    Çocuklarda çoklu ilaç direnci gösteren gram negatif bakteriler ile gelişen enfeksiyon hastalıklarının özellikleri

    The characteristics of infections caused by multidrug resistant gram negative bacteria in children

    ECE ERCİ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ALİ BÜLENT CENGİZ

  3. Tez No

    729286

    Aşırı aktif mesane sendromu olan kadın hastalarda mesane mikrobiyotasının araştırılması

    Investigation of bladder microbiota in female patients with overactive bladder syndrome

    ESRA KAYA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT ARAL

  4. Tez No

    710001

    Solid tümörlü kanser hastalarında enfeksiyonların epidemiyolojisi, antibiyotik direnci, tedavisi ve sonuçları

    Epidemiology, antibiotic resistance, treatment and consequences of infections in cancer patients with solid tumors

    İSMAİL KORKMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ATA NEVZAT YALÇIN

  5. Tez No

    124324

    Febril nötropenik pediatrik kanser hastalarında sedimantasyon, C-reaktif protein, prokalsitonin ve interlökin-6 düzeylerinin karşılaştırılması

    Erythrocyte sedimentation rate, CRP, procalcitonin, interleukin 6 levels in febrile neutropenic pediatric cancer patients

    GÜRKAN KILIÇ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2003

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. SEMA ANAK

Geri Dön