Geri Dön

Kocaeli'de yaygınlık gösteren sivrisinek (Dıptera: culıcıdae) türlerinin filogenetik analizi

Phylogenetic analysis of mosquito (Diptera: culicidae) species common in kocaeli

PDF İndir

  1. Tez No: 629778
  2. Yazar: SERKAN DEDE
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. FİKRİYE POLAT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Kocaeli Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 82

Özet

Bu çalışmada, Kocaeli yöresinden toplanan sivrisinek örneklerinin filogenetik analiz yöntemiyle tür bazında tayin edilmesi amaçlandı. Bunun için Haziran 2017-Eylül 2018 tarihleri arasında toplanan 54 sivrisinek örneğinin DNA'ları izole edildi. Ardından mitokondrial Sitokrom Oksidaz Altünite I (COI) barkod geni, Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile amplifiye edilip DNA dizi analizleri yapıldı. Filogenetik analizler GeneBank'tan alınan dizilerle birlikte değerlendirilerek gerçekleştirildi ve türler arası ilişkiler belirlendi. COI barkod geni ile Aedes, Anopheles ve Culiseta cinsine ait sivrisinekler, tür bazında yüksek benzerlik oranları ile tespit edilirken Culex pipiens kompleksi türlerin ayrımı sağlanamadı. Yalnızca Culex torrentium yüksek benzerlik oranı ile tespit edilebildi. Culex pipiens kompleksi türlerin ayırımını yapmak için ikinci aşamada Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) gen bölgesi kullanıldı. Ancak ITS2 barkod geni de Culex türlerinde COI gibi yüksek ayırım gücüne sahip değildi. Çalışılan gen bölgelerine ait tüm diziler MEGA X programına yüklenerek modelleme yöntemleri ve mesafeleri belirlendi. Bootstrap 1000'de filogenetik ağaçları oluşturuldu. Sonuç olarak, Kocaeli ilinde yapılan bu çalışmada Aedes geniculatus (n=10), Aedes albopictus (n=7), Anopheles funestus (n=1), Anopheles plumbeus (n=1), Culiseta longiareolata (n=1), Culex torrentium (n=1) ve Culex pipiens kompleksi (n=33) sivrisinekler tespit edildi.

Özet (Çeviri)

In this study, it was aimed to determine the species level of mosquito samples from a region of Kocaeli using phylogenetic analysis method. For this, DNAs of 54 mosquito samples collected between June 2017 and September 2018 were isolated. Then Mitochondrial Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) barcode gene was amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) technique and sequenced. Phylogenetic analyses were evaluated together with the sequences obtained from GenBank and relationships between species were determined. Mosquitoes belonging to the genus of Aedes, Anopheles and Culiseta were detected to be having high similarity rates on the basis of COI barcode gene, whereas the species of Culex pipiens complex were not distinguished. Only Culex torrentium was detected with a high similarity rate. For the second step, Internal Transcribed Spacer 2 (ITS2) gene region was used to detect the species of Culex pipiens complex. However, similar with COI, ITS2 barcode gene did not have high separation power in Culex species. After all sequences of the gene regions were loaded into MEGA X program, their modeling methods and distances were determined. Phylogenetic trees were created in Bootstrap 1000. In conclusion, in this study conducted in Kocaeli, mosquitoes were detected as follows: Aedes geniculatus (n = 10), Aedes albopictus (n = 7), Anopheles funestus (n = 1), Anopheles plumbeus (n = 1), Culiseta longiareolata (n = 1), Culex torrentium (n = 1) and Culex pipiens complex (n = 33).

Benzer Tezler

  1. Tez No

    279175

    İlköğretim okulu öğrencilerindeki internet bağımlılığı

    Internet addiction among primary school students

    MEHMET ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Eğitim ve ÖğretimYeditepe Üniversitesi

    Eğitim Yönetimi ve Denetimi Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. LEVENT DENİZ

  2. Tez No

    730626

    Nikomedeia'da denizcilik ve denizciler

    Seafaring and seafarers in Nikomedeia

    SÜMEYRA ÇAVUŞOĞLU VARDAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ArkeolojiKocaeli Üniversitesi

    Arkeoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FÜSUN TÜLEK

  3. Tez No

    759989

    Farklı yer ivmesi değerlerinde Adapazarı-Erenler-Serdivan (Sakarya) zeminleri sıvılaşma analizlerinin değerlendirilmesi

    Assessment of the liquefaction analysis of Adapazari-Erenler-Serdivan (Sakarya) soils at different ground acceleration values

    EMEL ATASOY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Jeoloji MühendisliğiKocaeli Üniversitesi

    Jeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AHMET KARAKAŞ

  4. Tez No

    194179

    Zorunlu göç yaşayan ailelerin ikinci kuşak üyelerinin sağlık durumu

    The psychological health status of the second generation members of families which underwent forced migration

    A. TAMER AKER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Halk SağlığıKocaeli Üniversitesi

    Halk Sağlığı Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ONUR HAMZAOĞLU

  5. Tez No

    798099

    Ulusal kimlik söyleminin bir parçası olarak oryantalizm: Arnavut medyasında elit söylemin eleştirel bir analizi

    Orientalism as a part of national identity: A critical discourse analysis of the elite in Albanian media

    GRANİT AJDİNİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Halkla İlişkilerKocaeli Üniversitesi

    Halkla İlişkiler ve Tanıtım Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA YILMAZ

Geri Dön