Steril vücut sıvılarının akım sitometri yöntemiyle taranması ve direkt örnekten MALDI-TOF MS ile mikroorganizma saptanması
Screening of sterile body fluids by flow cytometry and microorganism identification from direct sample with MALDI-TOF MS
- Tez No: 634762
- Danışmanlar: PROF. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 69
Özet
Amaç: Çalışmamızın amacı Steril vücut sıvısı (SVS) örneklerini akım sitometrik bir yöntemle lökosit ve bakteri miktarı açısından değerlendirmek ve muhtemel patojenleri MALDI TOF MS (VITEK MS, bioMérieux, Fransa) ile örnekten hızla tanımlamaktır. Gereç ve Yöntem: Steril bölge enfeksiyonu şüphesiyle Kasım 2018-Ocak 2020 tarihleri arasında laboratuvarımıza gönderilen SVS örnekleri çalışmaya dahil edildi. Çalışmanın ilk bölümünde akım sitometrik yöntem olan Sysmex UF-5000 (Co., Kobe Japonya) ile örneklerde lökosit miktarı saptanıp, aynı örnekte referans yöntem olan Thoma lamıyla lökosit sayımı yapılarak sonuçlar karşılaştırılmıştır. İkinci kısmında kültür sonuçları ile UF-5000 bakteri sayımları arasındaki ilişki değerlendirilmiş, üçüncü aşamada ise kültür pozitif örnekler 8 saat beyin-kalp infüzyon buyyonda inkübe edildikten sonra MALDI-TOF MS ile tanımlanmıştır. Bulgular: Çalışmamıza 498 beyin omurilik sıvısı (BOS), 109 periton ve 109 plevra sıvısı dahil edilmiştir. Örneklerin lökosit sayısı açısından akım sitometri ile manuel mikroskobi (MM) sonuçlarının kategorik uyumları Spearman korelasyonu ile analiz edilmiştir. Bunun sonucunda BOS için, yüksek düzeyde uyum (0,717), plevra ve periton örnekleri için ise sırasıyla 0,604, 0,659 şeklinde orta düzeyde uyum saptanmıştır (p
Özet (Çeviri)
Objectives: The aim of our study is to evaluate bacteria and white blood cell (WBC) analysis by flow cytometric method in sterile body fluids (BF) and to provide rapid identification possible pathogens of samples with MALDI TOF MS (VITEK MS, bioMérieux, Fransa). Materials/methods: BF samples submitted to our laboratory with suspected sterile body fluid infection between November 2018 and January 2020 were included in the study. In the first part of the study WBC counts of samples were analyzed with Sysmex UF-5000 (Co., Kobe Japan) based on the principle of flow cytometry and the results were then compared with the reference method (i.e., manual microscopy), by counting in a Thoma chamber. In the second part, the relationship between culture results and UF-5000 bacterial count was evaluated, and in the third stage, culture positive samples were identified by MALDI-TOF MS after incubating in brain-heart infusion broth for 8 hours. Results: In our study 498 cerebrospinal fluid (CSF), 109 peritoneal and 109 pleural fluids were included. The categorical agreement of flow cytometry and manual microscopy (MM) results was assessed by Spearman correlation for WBC. As a result, a high agreement (0.717) was detected for CSF, and a moderate agreement was found for pleural and peritoneual samples with 0.604 and 0.659, respectively (p
Benzer Tezler
- Streptococcus pneumonia, Staphylococcus aureus ve Pseudomonas aeruginosa ile İnvaziv Bakteriyel Enfeksiyon geçiren çocuklarda IRAK4 ve MYD88 genlerinde mutasyon varlığının aAraştırılması
Investigation of Mutations in IRAK4 and MYD88 genes in children undergoing Invasive Bacterial Infection with Streptococcus pneumonia, Staphylococcus aureus and Pseudomonas aeruginosa
ZEYNEP GÖKÇE GAYRETLİ AYDIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
GenetikHacettepe ÜniversitesiPediatrik Temel Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DENİZ NAZİRE ÇAĞDAŞ AYVAZ
- Tüberkülozun tanısında polimeraz zincir reaksiyon yönteminin değeri ve N-acetyl-L-cystein'nin bu yöntemin duyarlılığı üzerine etkisi
Başlık çevirisi yok
MEHMET SAİT TEKEREKOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1999
Mikrobiyolojiİnönü ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. RIZA DURMAZ
- Klinik örneklerden izole edilen haemophilus influenzae suşlarının serotiplendirilmesi ve bazı antimikrobiyallere duyarlılık durumunun araştırılması
Serotyping and antimicrobial susceptibilities of haemophilus influenzae strains isolated from clinical specimens
DEMET AYANGİL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
MikrobiyolojiErciyes ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. BÜLENT SÜMERKAN
- Steril vücut sıvılarından üretilen etkenlerin hızlı antibiyotik duyarlılık test sonuçlarının değerlendirilmesi
Evaluation of rapid antibiotic susceptibility test results of agents produced from sterile body fluids
HATİCE ŞEYMA BAYKUŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATİFET YASEMİN ÖZTOP
- Çocuk yoğun bakım ünitesinde steril vücut sıvılarında NON-albicans izole edilen hastaların özelliklerinin belirlenmesi ve diğer etken üremesi olan hastalar ile karşılaştırılması
Determination of the characteristics of patients with non-albicans candida isolated in sterile body fluids in A child intensive care unit and comparison of them with patients with growth of other types of agents
BURCU AYVACI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2017
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıEskişehir Osmangazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ENER ÇAĞRI DİNLEYİCİ