EGFR ve CTNNB1 gen varyant analizi ile sigara bağımlıları ve fankoni anemi hastalarında oral skuamöz hücreli karsinoma gelişme riskinin araştırılması
Oral squamous cell carcinoma risk investigation in tobacco addicts and fanconi anemia patients with egfr and CTNNB1 gene variant analysis
- Tez No: 639651
- Danışmanlar: PROF. DR. NEVİN YALMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 112
Özet
Oral skuamöz hücreli karsinom (OSHK) en yaygın görülen kanser tiplerinden biridir.Sigara kullanımı ve Fankoni anemisi (FA) OSHK gelişme riskini arttırmaktadır. Epidermal büyüme faktör reseptörü (EGFR) ve Kaderin ilişkili Protein Beta-1 (CTNNB1) genleri çeşitli kanserlerin gelişiminde etkili sinyal yolaklarında fonksiyon göstermektedir. Çalışmamızda EGFR rs845561 ve CTNNB1 rs3864004 gen varyantlarının OSHK gelişimindeki etkinliğini araştırmak ve OSHK riski taşıyan FA hastaları, sigara bağımlıları ile sağlıklı bireylerle karşılaştırmak amaçlanmıştır. Çalışmaya 29 OSHK hastası, 33 FA hastası, 20 sigara bağımlısı ve 20 sigara içmeyen sağlıklı bireyler dahil edilmiş, gen varyant analizleri Sanger Dizi Analiz yöntemi ile gerçekleştirilmiştir. EGFR rs845561 TT genotipi evre 2 OSHK hastalarında daha az bulunmuştur (p=0,02), T allel frekansı ile tümör perinöral invazyon arasında ilişki gözlenmiştir (p=0,05). Lenf nodu metastazı olan OSHK hastalarında C allel frekansı düşük idi (p=0,001). OSHK geliştiren FA hastalarında T alel frekansının daha yüksek olduğu dikkati çekmektedir (p=0,03), yinesigara bağımlılarında TTgenotipi ağız hijyeni kötü olanlarda ve ağızda yara çıkması ile ilişkili bulunmuştur (p=0,01 ve p=0,01). CTNNB1 rs3864004 A allel frekansı OSHK hastalarında artmış tümör invazyonu(p=0,01)ve kemoterapi/radyoterapiye yanıtsızlık ile (p=0,04 ve p=0,03) ilişkili bulunmuştur. Lenf nodu metastazı olanOSHK hastalarında G allel frekansı daha düşük idi (P=0.05). Ağız hıjyeni kötü olan OSHK hastalarında GG genotipi daha az idi (p=0,012). FA hastalarında kontrol grubuna göre G allel frekansı daha düşük bulundu (p=0.02).Sonuç olarak EGFR rs845561 ve CTNNB1 rs3864004 gen varyantlarının OSHK gelişiminde, tümör invazyonu ve tedaviye yanıt verme ile anlamlı derecede ilişkili oldukları gözlenmiştir
Özet (Çeviri)
Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is one of the most common types of cancer. The use of tobacco and Fanconi Anemia (FA) increases the risk of developing this disease. Epidermal growth factor receptor (EGFR) and Cadherin Related Protein Beta-1 (CTNNB1) genes function in signaling pathways which are effective in the development of various cancer types. In our study, we aim to research the effect of EGFR rs845561 and CTNNB1 rs3864004 gene variants in OSCC and compare FA patients who carry OSCC risk with tobacco addicts and healthy individuals. 29 OSCC patients, 33 FA patients, 20 tobacco addicts and 20 non-smoking healthy individuals were included in this study, and gene variant analyses were conducted with Sanger Sequencing Method. EGFR rs845561 TT genotype was found to be less in Stage 2 OSCC patients (p=0,02). A correlation between T allel frequency and tumor perineural invasion was found (p=0,05). C allel frequency was lower in OSCC patients with lymph node metastase (p=0,001). It is remarkable that in FA patients who developed OSCC, T allele frequency is higher (p
Benzer Tezler
- Kolesteatoma etiyopatogenezinde tümör supresör genlerin ve onkogenlerin etkisinin yeni nesil dizileme varyant analizi ile araştırılması
Evaluation of the roles of tumor suppressor genes and oncogenes in cholesteatoma etiopathogenesis by next generation variant analysis
LEVENT ŞİMŞEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
GenetikNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAHMUT SELMAN YILDIRIM
- Herediter meme kanseri olgularında hücre sinyal iletiminde görev alan genlerdeki varyasyon sıklıklarının belirlenmesi ve tümör gelişimine etkisinin araştırılması
Determination of variation frequencies of genes involved in cell signal transduction and investigation of its effect on tumor development in hereditary breast cancer cases
CANSU UĞURTAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
GenetikKocaeli ÜniversitesiTıbbi Genetik ve Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NACİ ÇİNE
- İnvasiv duktal meme karsinoması ile ilişkili yanlış anlamlı mutasyonların olası yapısal ve fonksiyonel etkilerinin in silico tahmini ve değerlendirilmesi
In silico prediction and identification of possible structural and functional effects of i̇nvasive ductal breast carcinoma related missense mutations
MELDA ARSLANTAŞ GÜZEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiHacettepe ÜniversitesiBiyoenformatik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ CEREN SUCULARLI
- Metastatik küçük hücreli dışı akciğer kanseri hastalarında likit biyopsi ile çalışılan mutasyon panelinin terapötik ve prognostik önemi
The therapeutic and prognostic importance of the mutation panel working with liquid biopsy in patients with metastatic non small cell lung cancer
MEHMET ERGİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
OnkolojiErciyes Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN ÖZKAN
- Modelling neuroendocrine differentiation in bladder cancer and analysis phenotypic and molecular effects
Mesane kanserinde nöroendokrin farklılaşmanın modellenmesi ve fenotipik ve moleküler etkilerinin araştırılması
EZGİ BOYVATLI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ŞERİF ŞENTÜRK
DOÇ. DR. SERAP ERKEK ÖZHAN