SU.86.86 metastatik ve BxPC-3 metastatik olmayan pankreas kanser hücre hatlarında keratin 19 (KRT 19) ve transmembran serin proteaz 4 (TMPRSS4) genlerinin ifade düzeylerinin karşılaştırılması
Comparison of expression levels of keratin 19 (KRT 19) and transmembrane serine protease 4 (TMPRSS4) genes in SU.86.86 metastatic and BxPC-3 non-metastatic pancreatic cancer cell lines.
- Tez No: 644267
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SÜREYYA BOZKURT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstinye Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 51
Özet
Bu tez çalışmasında metastatik pankreas kanser hücre hattı SU.86.86 ile metastatik olmayan pankreas kanser hücre hattı BxPC3 hücrelerinde Keratin 19 (KRT 19) ve transmembran serin proteaz 4 (TMPRSS4) genlerinin ifade düzeyleri, transkripsiyonel aşamada belirlenecek ve olası farklılıklar ortaya çıkarılacaktır. Buradan bu iki genin pankreas kanserinde metastatik biyobelirteç olabilme kapasiteleri değerlendirilecektir. Araştırmanın amacı doğrultusunda hücre kültürü teknikleri, RNA izolasyonu, cDNA sentezi ve real time PCR yöntemleri kullanılmıştır. Pankreas hücre hatları kültüre edildikten sonra total RNA izolasyonu yapılıp komplementer DNA'lara dönüştürülmüştür. Kontrol grubu olarak insan bronşiyal epitel hücre hattı BEAS-2B kullanılmıştır. KRT19 ve TMPRSS4 genlerine özgü primerler tasarlanarak real time PCR yapılmıştır. Araştırmada elde edilen gerçek zamanlı PCR sonuçlarının ∆∆Ct hesaplaması sonucunda SU8686 hücre hattında BEAS-2B kontrol hücre hattına göre, TMPRSS4 geninin ifadesinde 1,31 kat azalış olduğu; KRT19 geninin ifadesinde ise 1234 kat artış olduğu saptanmıştır. Değerlendirilen diğer hücre hattı olan BxPC3 hücre hattında yapılan gerçek zamanlı PCR sonuçlarının ∆∆Ct hesaplaması sonucunda BEAS-2B kontrol hücre hattına göre, TMPRSS4 geninin ifadesinde 2,38 kat azalış, KRT19 geninin ifadesinde 183 kat artış saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
In this thesis study, expression levels of Keratin 19 (KRT 19) and transmembrane serine protease 4 (TMPRSS4) genes in metastatic pancreatic cancer cell line SU.86.86 and nonmetastatic pancreatic cancer cell line BxPC3 cells will be determined at the transcriptional stage and possible differences will be revealed. Here, the capacity of these two genes to be metastatic biomarkers in pancreatic cancer will be evaluated. Cell culture techniques, RNA isolation, cDNA synthesis and real time PCR methods were used for the purpose of the study. After pancreatic cell lines were cultured, total RNA was isolated and transformed into complementary DNAs. Human bronchial epithelial cell line BEAS-2B was used as a control group. Real time PCR was performed by designing primers specific to KRT19 and TMPRSS4 genes. As a result of the Ct calculation of the real-time PCR results obtained in the study, it was found that the expression of TMPRSS4 gene decreased by 1.31 times in the SU8686 cell line compared to the BEAS-2B control cell line; A 1234-fold increase in expression of the KRT19 gene was found. As a result of the real-time PCR calculation of the BxPC3 cell line, which was the other cell line evaluated, a 2.38-fold decrease in the expression of the TMPRSS4 gene and an 183-fold increase in the expression of the KRT19 gene were found compared to the BEAS-2B control cell line.
Benzer Tezler
- Havacıva otu (Alcanna tinctoria L.) etanol ve su özütlerinin akciğer kanseri üzerine etkisinin in vıtro araştırılması
In vitro investigation of the protective effect of alkanet (Alcanna tinctoria L.) ethanol and water extracts on lung cancer
DERYA FİDAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
Beslenme ve DiyetetikHaliç ÜniversitesiBeslenme ve Diyetetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. CEYDA OKUDU
- Mide kanserlerinin evrelemesinde bilgisayarlı tomografi ve dinamik kontrastlı MRG bulgularının önemi
The importance of CT and dynamic contrast enhanced MRI in the evaluation of the staging of gastric cancer
HÜSEYİN HAKAN SEZER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
Radyoloji ve Nükleer TıpTrakya ÜniversitesiRadyodiagnostik Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. ÖMÜR ÖKTEN
- Evre I germ hücreli testis tümörlerinde adjuvan tedavi ve aktif izlem olgularının klinik ve laboratuvar sonuçlarının karşılaştırılması
Comparison of the clinical and laboratory outcomes of patients with stage I germ cell tumors undergoing adjuvant treatment and active surveillance
AHAD SAFARALIYEV
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
ÜrolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiÜroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YARKIN KAMİL YAKUPOĞLU
- Meme kanserinin meme manyetik rezonans görüntüleme bulgularının cerrahi ve histopatolojik bulgularla korelasyonu
Correlation of breast magnetic resonance imaging findings of breast cancer with surgical and histopathologic findings
MERYEM ÖZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Radyoloji ve Nükleer TıpHacettepe ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FİGEN BAŞARAN DEMİRKAZIK
- Meme kanserinin evrelendirilmesinde aksiller diseksiyon ile sentinel lenfadenektominin karşılaştırılması
Comparing sentinel lymphadenectomy with axillary dissection in staging breast cancer
İSMAİL GÜLER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2000
Genel CerrahiAnkara ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. BÜLENT ALIÇ