Geri Dön

Marmara bölgesinde ruminant abortlarında chlamydia abortus'un real time PCR ile teşhisi ve multilokus VNTR analizi ile genotiplendirilmesi

Diagnosis of chlamydia abortus by real time PCR in ruminant abortions in the marmara region and genotyping with multilocus VNTR analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 644933
  2. Yazar: MEHMET ENGİN MALAL
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SÜHEYLA TÜRKYILMAZ
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 84

Özet

Chlamydia abortus insanlarda ve birçok hayvan türünde hastalığa sebep olan Gram negatif, zorunlu hücre içi, zoonoz bir bakteridir. C. abortus'un ruminantlarda sebep olduğu enzootik abort hastalığı hemen hemen tüm dünyada yaygın olarak görülmektedir. Ülkemizde C. abortus'un, abortif etkenler içerisindeki yerini gösterecek geniş çapta bir çalışma yapılmamış olmakla birlikte; etkenin genotipleriyle ilgili yayınlanmış herhangi bir veri de bulunmamaktadır. Bu çalışmanın amacı, Marmara Bölgesi'ndeki ruminant abortlarında C. abortus'un teşhisini yapmak ve etkenin genotiplerini belirleyerek bu anlamda ulusal ilk epidemiyolojik veriyi elde etmektir. Bu amaçla 12 ilden 267'si sığır, 380'i koyun, 70'i keçi, 13'ü mandaya ait toplam 730 abort materyali (fötal iç organlar, cenin mide sıvısı, plasenta, kotiledon, vaginal sıvap) C. abortus yönünden incelendi. Çalışmada, abort materyalinden, düşük tespit limitine sahip, tür spesifik Real Time Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PCR) metodu ile etken DNA'sı araştırıldı. Pozitif sonuçlara ait DNA'lar Multilocus Variable Number Tandem Repeat (VNTR) Analysis (MLVA) yöntemi ile genotiplendirildi. 730 materyalden 87 (%11.9) tanesi C. abortus yönünden pozitif bulundu. Pozitiflik oranları keçilerde %21.4, koyunlarda %16.6, mandalarda %7.7 ve sığırlarda %3 olarak tespit edildi. Genotiplendirme sonucunda hâkim genotip MLVA genotip 2 (%93.1) olarak bulundu ve genotip 3, 4, ve 5 ile birlikte toplam 4 farklı genotipin enfeksiyonlarda rol aldığı görüldü. Bu çalışma ile ülkemizde ilk kez C. abortus'un genotiplendirilmesi yapılırken; bir manda fetusunda C. abortus tespit edildi. Ayrıca Marmara Bölgesi'nde C. abortus'un özellikle küçük ruminant abortlarının önemli bir kısmından sorumlu olduğu belirlendi. Etkenin zoonotik olması ve yaygın görülmesi sebebi ile ulusal strateji planı hazırlanmasının gerekliliği ve yurdumuzda diğer bölgelerde yapılacak benzer çalışmaların da etkenin yaygınlığının ve genotiplerinin ulusal çapta belirlenmesine katkı sağlayacağı sonucuna varıldı.

Özet (Çeviri)

Chlamydia abortus is a Gram negative, obligate intracellular, zoonotic bacteria that causes disease in many animal species and humans. Enzootic abortion caused by C. abortus in ruminants is common almost all over the world. There is no extensive studies to show the place of C. abortus in abortive agents and no published data about the genotypes of the agent in our country. The aim of this study is to diagnose C. abortus in ruminant abortions in the Marmara Region and to determine the genotypes of the agent and obtain the first national epidemiological data in this sense. For this purpose, a total of 730 abortion materials (fetal tissues, fetal stomach contents, placentas, cotyledons, vaginal swabs) of 267 cattle, 380 sheep, 70 goats, 13 buffaloes were examined for C. abortus. In this study, DNA of the agent was investigated from abort materials by species specific Real Time Polimerase Chain Reaction (PCR) with low detection limit. DNAs of positive results were genotyped by Multilocus Variable Number Tandem Repeat (VNTR) Analysis (MLVA) method. From 730 materials, 87 (11.9%) were found positive for C. abortus. Positivity rates were 21.4% in goats, 16.6% in sheep, 7.7% in buffaloes and 3% in cattle. As a result of genotyping, the dominant genotype was found as MLVA genotype 2 (93.1%), and a total of 4 different genotypes with genotypes 3, 4, and 5 were involved in infections. With this study, genotyping of C. abortus and detection of the agent in a buffalo was done for the first time in our country. It was also determined that C. abortus was responsible for a significant part of small ruminant abortions in the Marmara Region. As the agent is zoonotic and widespread, it was concluded that the necessity of preparing a national strategy plan and similar studies in other regions of our country will contribute to the determination of the prevalence and genotypes on a national scale.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    746159

    Marmara bölgesi ruminant abortlarında Coxiella burnetii'nin real-time PCR ile teşhisi ve MLVA ile moleküler karakterizasyonu

    Diagnosis of Coxiella burnetii in ruminant aborties in Marmara Region with real-time PCR and molecular characterization with MLVA

    ORBAY SAYI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiAydın Adnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERAP SAVAŞAN

  2. Tez No

    729843

    Marmara bölgesindeki ruminant atık fötuslarında toxoplasma gondii ve neospora caninum'un moleküler, patolojik yöntemlerle araştırılması ve etkenin moleküler karakterizasyonu

    Investigation of toxoplasma gondii and neospora caninum in ruminant foetuses in marmara region by molecular and pathological methods and the molecular characterisation of the agents

    MESUT ŞENEL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Veteriner HekimliğiKafkas Üniversitesi

    Parazitoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ATİLA AKÇA

  3. Tez No

    811272

    Marmara bölgesinde koyunlarda small ruminant lentivirus enfeksiyonunun moleküler karakterizasyonu

    Molecular characterization of small ruminant lentivirus infection Among Sheep in the Marmara region

    MUSTAFA TÜRKDOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Veterinerlik Viroloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OĞUZHAN AVCI

  4. Tez No

    802689

    Marmara Bölgesinde ruminantlarda görülen enterotoksemi olgularının histopatolojik ve immunohistokimyasal bulgularının araştırılması ve elısa ile tiplendirilmesi

    Investigation of histopathological and immunohistochemical findings of enterotoxemia cases in ruminants in the Marmara Region and typing them with elisa

    OSMAN DOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    PatolojiSelçuk Üniversitesi

    Veterinerlik Patolojisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MUSTAFA ORTATATLI

  5. Tez No

    361493

    Koyunlarda ve sığırlarda küçük ruminant vebası virusunun virolojik, serolojik ve moleküler yönden araştırılması ve soyağacı oluşturulması

    Investigations on the peste des petits ruminants virus (PPRV) in sheep and cattle by virological, serological, molecular and phylogenetic analyses

    EDA ALTAN TARAKCI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul Üniversitesi

    Viroloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN YILMAZ

Geri Dön