Fermantation and recovery of ecori endonuclease using two different genetically enginereed E.coli strains
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 65059
- Danışmanlar: PROF. DR. BETÜL KIRDAR, PROF. DR. Z. İLSEN ÖNSAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mühendislik Bilimleri, Engineering Sciences
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 1997
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 256
Özet
EcoRI restriksiyon endonükleazını saflaştırmak için geliştirilen ufak ölçekli saflaştırma yöntemi iki farklı rekombinant Esherichia coli susuna uygulanmıştır. Saflaştırma sonucunda E.coli M5248 için 1.3xl05 U/g-hücre ve E.coli 294 için 3.3xl06 U/g-hücre verim elde edilmiştir. EcoRI endonükleazının her iki rekombinant E.coli susundan üretim verimini arttırmak amacıyla indüklenme parametreleri incelenmiştir. Ecoli 29 A (pPG430) susundan 595 nm dalga boyunda 1.2 optik yoğunluğa erişildiğinde eklenen 0.1 mM IPTG ile 6 saatlik indüklenmenin enzim üretimi için optimum koşullan sağladığı saptanmıştır. Ecoli M5248 (pSCC2) susundan EcoRI eldesi için optimum koşullar 590 nm dalga boyunda 1.0 optik yoğunluğa erişildiğinde fermentasyon sıcaklığını 32°C den 42°C ye yükselterek 5 saat süre ile indüklenmesi olarak bulunmuştur. Plasmid pPG430 ve pSCC2'nin kararlığına ilişkin çalışmalar, Ecoli 294 (pPG430) susu için, minimal besi ortamında büyütüldüğünde enzim üretkenliğinin ve plasmid kararlılığının azaldığını, E.coli M5248 (pSCC2) susu için ise, sıcaklık artışının plasmid kararlılığının ve EcoRI üretkenliğinin azalmasına neden olduğunu göstermiştir. Ecoli 29 A ve Ecoli M5248 hücrelerinin büyüme kinetiğinin yapısal olmayan sübstrat-kısıtlaması içeren modeller ile tanımlanabildiği belirlenmiştir. 3-kademeli bir yapısal model kullanılarak E.coli 29 A hücrelerinin hücre içi bileşenlerinin değişimini tanımlayan bir kinetik model geliştirilmiş ve 10g/L başlangıç glikoz derişiminde elde edilen deneysel verilere uygunluğu saptanmıştır.
Özet (Çeviri)
A laboratory scale procedure developed for the purification of EcoBl restriction endonuclease has been applied to two different overproducing Escherichia coli strains. The yields obtained at the final stage of the purification are 1.3x10s U/g cells for Ecoli M5248 and 3.3xl06 U/g cells for Ecoli 294. Induction parameters were optimized in order to increase the yield of the EcoKL endonuclease isolated from both recombinant E.coli strains. For the Ecoli 294 (pPG430) strain, 0. 1 mM IPTG concentration at an optical density of 1.2 at 595 nm over an induction period of 6 hours were determined to be the optimum conditions for induction. For the Ecoli M5248 (pSCC2) strain, the induction of EcoKL endonuclease was achieved by a temperature-shift from 32°C to 42 °C at an optical density of 1.0 at 590 nm over an induction period of 5 hours. Investigation of the stability of plasmids pPG430 and pSCC2 showed that in the case oîE.coli 294 (pPG430), minimal medium results in a decrease in enzyme productivity and plasmid stability, and in the case of Ecoli M5248 (pSCC2) cells, temperature-upshift leads to a decrease in the percentage of plasmid-containing cells and in EcoKL productivity. The unstructured modeling of cell growth has shown that substrate-inhibited kinetics is successful in predicting the growth behavior of both Ecoli 294 and Ecoli M5248. A three-compartment model was developed to describe the dynamic changes in the intracellular components of Ecoli 294 cells. The model gives a good description of the growth kinetics with an initial glucose concentration of 10 g/L.
Benzer Tezler
- Recombinant production and characterization of serine protease enzyme from Virgibacillus sp. AGTR strain using site directed mutagenesis
Virgibacillus sp. AGTR suşundan izole edilen serin proteaz enziminin bölgeye yönelik mutagenez yöntemi kullanılarak rekombinant üretimi ve karakterizasyonu
EVRİM KAPUCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Sıvı sıvı ekstraksiyonu ile maya atıksuyu membran çıkışından uçucu yağ asidi geri kazanımı
Recovery of volatile fatty acids from anaerobic fermantation broth by liquid liquid extraction
AYŞEGÜL NALAN ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MAHMUT ALTINBAŞ
- Katı faz fermantasyon (solid state fermantation; SSF) yöntemiyle Bacillus licheniformis ATCC 14580'den proteaz üretimi
Production of protease from Bacillus licheniformis ATCC 14580 with the method of solid state fermantation
MUHAMET AFŞİN
- Su kefiri taneleri ile fermente edilmiş vişne, nar ve üzüm suyunun antioksidan miktarı ve in vitro biyoerişilebilirliğinde meydana gelen değişimler
Changes in antioxidant quantity and bioavailability of sour cherry, black grape and pomegranate juices fermented with water kefir grain
HANDE YÜCE
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Gıda Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ESRA ÇAPANOĞLU GÜVEN