Kan kültürlerinden mikroorganizmaların doğrudan tanımlanması ve hızlı antibiyotik duyarlılık testlerinin çalışılması
Direct identification of microorganisms from blood cultures and studying rapid antibiotic susceptibility tests
- Tez No: 650851
- Danışmanlar: PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: MALDI-TOF MS, kan kültürü, doğrudan teşhis, hızlı duyarlılık, Antibiyotikler, Mikrobiyal duyarlılık testleri, Mikroorganizmalar, Teşhis, MALDI-TOF MS, blood culture, direct diagnosis, rapid sensitivity, Antibiotics, Microbial sensitivity tests, Microorganisms, Diagnosis
- Yıl: 2020
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Kan dolaşımına neden olan patojenlerin hızlı bir şekilde tanımlanması ve antiyogram yapılması mikrobiyoloji laboratuvarı için en önemli testlerinden biridir. Bu çalışmada kan kültürlerinden direkt tanımlama yaparak, kan kültürlerinin agar plaklarındaki inkübasyon periyodunu ortadan kaldırarak ve 2019 EUCAST kriterleri doğrultusunda hızlı antibiyotik duyarlılık testi çalışılarak hasta sonuçlarının daha erken belirlenmesini amaçlanmıştır. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi mikrobiyoloji labarotuvarına 15 haziran 15 ağustos arasında gelen kan kültürlerinden pozitif sinyal veren ve gram boyaması monomikrobiyal gözüken 95 kan kültürü şişesi randomize bir şekilde seçilmiştir. Bu kan kültürlerinin Lizis Filtrasyon Yöntemiyle çalışılan MALDI TOF MS (bioMérieux, Marcy I'Etoile, Fransa) identifikasyon sonuçları ile rutin MALDI TOF MS identifikasyon sonuçları karşılaştırarak değerlendirilmiştir. Kan kültürlerinden doğrudan identifikasyon sonuçlarına değerlendirildiğinde EUCAST hızlı duyarlılık sonuçları 38 kan kültürü şişesi için değerlendirilmeye alınmıştır. MALDI TOF MS ile identifiye edilmiş 95 monomikrobiyal kan kültürü şişeşinden 73 tanesi LF Yöntemi ile tür ve cins düzeyinde tanımlanabilmiştir, 22 tane kan kültürü şişesi için sonuç elde edilememiştir. Gram pozitif bakterilerin, gram negatif bakterilerin, mayaların identifikasyonu sırası ile %70,59 ,%90,9 , %63,64 oranında tespit edilmiştir. EUCAST hızlı duyarlılık sonuçlarına göre değerlendirilen 38 kan kültür şişesinin dağılımı 7'si S. aureus, 4'ü E. fecalis, 5'i E. faceium, 8'i E. coli, 6'sı K. pneumoniae, 5'i A. baumanni, 3'ü P. aeruginosa dır. EUCAST önerileri doğrultusunda çalışılan hızlı duyarlılık sonuçları Vitek 2 Compact (BioMérieux) duyarlılık sonuçları 4., 6.,8., saatlerdeki toplam uyumu sırasıyla % 42,86 , % 86,84 , %100 dür. Kan kültüründen doğrudan tanımlama yapılan hastaların ve aynı zamanda hızlı duyarlılık çalışılan hastaların antiyogramlarının erken sonuçlandırılmasının morbite ve mortaliteye katkısı düşünüldüğünde kan kültüründen doğrudan çalışılan testlere ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
It is one of the most important tests for the microbiology laboratory to quickly identify the pathogens that cause blood circulation and make an antiogram. In this study, it was aimed to determine patient results earlier by making direct identification from blood cultures, eliminating the incubation period on agar plates of blood cultures, and by performing a rapid antibiotic susceptibility test in line with 2019 EUCAST criteria. 95 blood culture bottles with a positive signal from blood cultures coming to the microbiology laboratory of Ondokuz Mayıs University Medical Faculty Hospital between 15 June and 15 August and whose gram staining appears to be monomicrobial were randomly selected. The Maldı TOF MS (bioMérieux, Marcy I'Etoile, France) identification results of these blood cultures studied with the Lysis Filtration Method were compared with the routine Maldi TOF MS identification results. When evaluating the direct identification results from blood cultures, EUCAST rapid sensitivity results were evaluated for 38 blood culture bottles. 73 out of 95 monomicrobial blood culture bottles identified by Maldi TOF MS could be identified at the level of species and genus by LF Method, no results were obtained for 22 blood culture bottles. Identification of gram positive bacteria, gram negative bacteria, yeast was determined with a rate of % 70,59, % 90,9 and %63,64 respectively. The distribution of 38 blood culture bottles evaluated according to EUCAST rapid sensitivity results was 7 for S. aureus, 4 for E. fecalis, 5 for E. faceium, 8 for E. coli, 6 for K. pneumoniae, 5 for A baumanni, 3 are P. aeruginosa. Fast sensitivity results studied in line with EUCAST recommendations Vitek 2 Compact (BioMérieux) sensitivity results were 42.86%, 86.84%, and 100%, respectively. Considering the contribution of early conclusion of the antiograms of patients with direct identification from blood culture and patients with rapid sensitivity to morbidity and mortality, tests that are directly studied from blood culture are needed.
Benzer Tezler
- Pozitif kan kültürlerinden MALDI-TOF MS ile direkt mikroorganizma tanımlanması ve hızlı antibiyotik duyarlılık çalışılması
Direct identification of microorganisms from positive blood cultures with MALDI-TOF MS and studying rapid antibiotic susceptibility test
BİLGEHAN ERGAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ
- Pozitif kan kültürlerinde MALDI-TOF yöntemi kullanılarak hızlı bakteri maya identifikasyonu
Identification of bacteria-yeast / positive blood cultures using MALDI-TOF methodology
CENNET TUĞÇE BİLGİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEVRİYE GÖNÜLLÜ
- Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Hematoloji ve Onkoloji Kliniğinde tedavi gören hastaların kateter komplikasyonlarının retrospektif incelenmesi
Retrospective review of catheter complications in patients treated at the Pediatric Hematology and Oncology Clinic of Trakya University Faculty of Medicine
MUSTAFA ÇELİK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2026
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıTrakya ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ TUBA EREN
- Kan kültürlerinden izole edilen gram pozitif bakterilerde antibiyotik direnç profillerinin araştırılması
Investigation of antibiotic resistance in the profile gram-positive bacteria isolated from blood cultures
KEMAL JENEDİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
MikrobiyolojiMustafa Kemal ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİZAMİ DURAN
- Kan kültürlerinden izole edilen pseudomonas cinsi bakterilerde metallobetalaktamaz varlığının araştırılması
Detection of metallo-betalactamase in carbapenem resistant pseudomonas strains that are i̇solated from the blood cultures
FADİME YILMAZ YÜCEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA KÖKSAL ÇAKIRLAR