Geri Dön

Kan kültürlerinden mikroorganizmaların doğrudan tanımlanması ve hızlı antibiyotik duyarlılık testlerinin çalışılması

Direct identification of microorganisms from blood cultures and studying rapid antibiotic susceptibility tests

PDF İndir

  1. Tez No: 650851
  2. Yazar: ÇAĞRI ÇOBAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: MALDI-TOF MS, kan kültürü, doğrudan teşhis, hızlı duyarlılık, MALDI-TOF MS, blood culture, direct diagnosis, rapid sensitivity
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

Kan dolaşımına neden olan patojenlerin hızlı bir şekilde tanımlanması ve antiyogram yapılması mikrobiyoloji laboratuvarı için en önemli testlerinden biridir. Bu çalışmada kan kültürlerinden direkt tanımlama yaparak, kan kültürlerinin agar plaklarındaki inkübasyon periyodunu ortadan kaldırarak ve 2019 EUCAST kriterleri doğrultusunda hızlı antibiyotik duyarlılık testi çalışılarak hasta sonuçlarının daha erken belirlenmesini amaçlanmıştır. Ondokuz Mayıs Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi mikrobiyoloji labarotuvarına 15 haziran 15 ağustos arasında gelen kan kültürlerinden pozitif sinyal veren ve gram boyaması monomikrobiyal gözüken 95 kan kültürü şişesi randomize bir şekilde seçilmiştir. Bu kan kültürlerinin Lizis Filtrasyon Yöntemiyle çalışılan MALDI TOF MS (bioMérieux, Marcy I'Etoile, Fransa) identifikasyon sonuçları ile rutin MALDI TOF MS identifikasyon sonuçları karşılaştırarak değerlendirilmiştir. Kan kültürlerinden doğrudan identifikasyon sonuçlarına değerlendirildiğinde EUCAST hızlı duyarlılık sonuçları 38 kan kültürü şişesi için değerlendirilmeye alınmıştır. MALDI TOF MS ile identifiye edilmiş 95 monomikrobiyal kan kültürü şişeşinden 73 tanesi LF Yöntemi ile tür ve cins düzeyinde tanımlanabilmiştir, 22 tane kan kültürü şişesi için sonuç elde edilememiştir. Gram pozitif bakterilerin, gram negatif bakterilerin, mayaların identifikasyonu sırası ile %70,59 ,%90,9 , %63,64 oranında tespit edilmiştir. EUCAST hızlı duyarlılık sonuçlarına göre değerlendirilen 38 kan kültür şişesinin dağılımı 7'si S. aureus, 4'ü E. fecalis, 5'i E. faceium, 8'i E. coli, 6'sı K. pneumoniae, 5'i A. baumanni, 3'ü P. aeruginosa dır. EUCAST önerileri doğrultusunda çalışılan hızlı duyarlılık sonuçları Vitek 2 Compact (BioMérieux) duyarlılık sonuçları 4., 6.,8., saatlerdeki toplam uyumu sırasıyla % 42,86 , % 86,84 , %100 dür. Kan kültüründen doğrudan tanımlama yapılan hastaların ve aynı zamanda hızlı duyarlılık çalışılan hastaların antiyogramlarının erken sonuçlandırılmasının morbite ve mortaliteye katkısı düşünüldüğünde kan kültüründen doğrudan çalışılan testlere ihtiyaç vardır.

Özet (Çeviri)

It is one of the most important tests for the microbiology laboratory to quickly identify the pathogens that cause blood circulation and make an antiogram. In this study, it was aimed to determine patient results earlier by making direct identification from blood cultures, eliminating the incubation period on agar plates of blood cultures, and by performing a rapid antibiotic susceptibility test in line with 2019 EUCAST criteria. 95 blood culture bottles with a positive signal from blood cultures coming to the microbiology laboratory of Ondokuz Mayıs University Medical Faculty Hospital between 15 June and 15 August and whose gram staining appears to be monomicrobial were randomly selected. The Maldı TOF MS (bioMérieux, Marcy I'Etoile, France) identification results of these blood cultures studied with the Lysis Filtration Method were compared with the routine Maldi TOF MS identification results. When evaluating the direct identification results from blood cultures, EUCAST rapid sensitivity results were evaluated for 38 blood culture bottles. 73 out of 95 monomicrobial blood culture bottles identified by Maldi TOF MS could be identified at the level of species and genus by LF Method, no results were obtained for 22 blood culture bottles. Identification of gram positive bacteria, gram negative bacteria, yeast was determined with a rate of % 70,59, % 90,9 and %63,64 respectively. The distribution of 38 blood culture bottles evaluated according to EUCAST rapid sensitivity results was 7 for S. aureus, 4 for E. fecalis, 5 for E. faceium, 8 for E. coli, 6 for K. pneumoniae, 5 for A baumanni, 3 are P. aeruginosa. Fast sensitivity results studied in line with EUCAST recommendations Vitek 2 Compact (BioMérieux) sensitivity results were 42.86%, 86.84%, and 100%, respectively. Considering the contribution of early conclusion of the antiograms of patients with direct identification from blood culture and patients with rapid sensitivity to morbidity and mortality, tests that are directly studied from blood culture are needed.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    851769

    Pozitif kan kültürlerinden MALDI-TOF MS ile direkt mikroorganizma tanımlanması ve hızlı antibiyotik duyarlılık çalışılması

    Direct identification of microorganisms from positive blood cultures with MALDI-TOF MS and studying rapid antibiotic susceptibility test

    BİLGEHAN ERGAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ

  2. Tez No

    581367

    Pozitif kan kültürlerinde MALDI-TOF yöntemi kullanılarak hızlı bakteri maya identifikasyonu

    Identification of bacteria-yeast / positive blood cultures using MALDI-TOF methodology

    CENNET TUĞÇE BİLGİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NEVRİYE GÖNÜLLÜ

  3. Tez No

    446477

    Kan kültüründen izole edilen mikroorganizmaların mevsimsel değişimi ve antibiyoğramlarının değerlendirilmesi

    Seasonal prevalences of microorganisms isolated from blood cultures and evalution of antibiogram

    SAMET ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiKilis 7 Aralık Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ADEM İMALI

  4. Tez No

    164791

    Bir yıllık sürede kan kültürlerinin klinik, epidemiyolojik ve bakteriyolojik yönden prospektif olarak değerlendirilmesi

    Başlık çevirisi yok

    AYŞEGÜL ÇİÇEK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Mikrobiyolojiİnönü Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. ÇİĞDEM KUZUCU

  5. Tez No

    474576

    Gülhane Eğitim ve Araştırma Hastanesinde kan kültürlerinden izole edilen bakteriler ve antimikrobiyal direnç durumlarının irdelenmesi

    Investigation of bacterial pathogens isolated from blood cultures and antimicrobial profile in Gulhane Training and Research Hospital

    VALBONA MATAJ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA GÜNEY

Geri Dön