Pozitif kan kültürlerinde MALDI-TOF yöntemi kullanılarak hızlı bakteri maya identifikasyonu
Identification of bacteria-yeast / positive blood cultures using MALDI-TOF methodology
- Tez No: 581367
- Danışmanlar: PROF. DR. NEVRİYE GÖNÜLLÜ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Kan kültürü, MALDI-TOF, Phoenix, Gram boyama, hızlı tanı
- Yıl: 2019
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 47
Özet
MALDI TOF MS' in patojen mikroorganizmaların hızlı tanımlanabilmesi için ortaya çıkması mikrobiyoloji alanında önemli bir gelişmedir. Yöntem sonraları doğrudan pozitif kan kültüründen patojenler için ekstraksiyon yöntemleriyle birleştirildi ve bu kan kültür şişelerinde güvenilir bir tür tanımlama imkanı sağladı. Pozitif kan kültürü, patojenin gram boyanma özelliğine bakılarak agar plaklara ekilir ve 24-48 saatlik inkübasyon sonrası geleneksel tanımlama ve biyokimyasal testler yapılarak ya da Phoenix gibi otomatize sistemler kullanılarak ki bu sistemler de 6-8 saate gereksinim duyarlar tanımlama işlemi gerçekleştirilirdi. Ancak rutin mikrobiyoloji laboratuarlarına MALDI TOF MS sisteminin gelmesiyle tanımlama işlemi daha da kısalmış, bu ise hastaya erken tedavi ve uygun antibiyotik kullanımını kolaylaştırmıştır.MALDİ TOF MS sistemi ile tanımlama, mikroorganizmaya ait ribozomal proteinler ile gerçekleşmektedir. Dolayısıyla kullanılacak matriks solüsyonu ribozomal proteinleri iyonize edebilmelidir. Ribozomal proteinlerin iyonize olması ise analiz yapılırken pik yoğunluğunu artıracak ve daha güvenilir tanımlama yapabilmeye olanak sağlayacaktır. Moleküler biyoloji ve konvansiyonel yöntemlerle kıyaslandığında oldukça hassas, hızlı ve düşük maliyetli olması sebebiyle MALDI TOF MS sistemi rutin laboratuvarlarda yerini hemen almıştır. Çalışmamızda Aralık 2015- Mart 2016 tarihleri arasında 108 hastaya ait pozitif kan kültürleri MALDI TOF MS sistemi ile tanımlanmış olup gram boyanma özellikleri ve Phoenix otomatize sistemleri ile sonuçlar karşılaştırılmıştır.
Özet (Çeviri)
The development of MALDI TOF MS for the rapid identification of pathogenic microorganisms is an important step in microbiology. The method was combined with extraction methods for pathogens directly from positive blood culture sand this blood allowed the identification of a reliablespecies in blood culture flasks. Positive blood culture is seeded on agar plaques according to the gram staining feature of the pathogen, and after 24-48 hours of incubation, identification process is performed with traditional identification and biochemical tests or using automated systems such as Phoenix which requires 6-8 hours. However, with the introduction of the MALDI TOF MS system in totheroutine microbiology laboratories, the identification process has become shorter time and this has facilitated early treatment and appropriate antibiotic use for the patient. Identification by MALDI TOF MS system is carried out with ribosomal proteins of belonging to microorganism. There fore, the matrix solution to be used should be capable of ionizing ribosomal proteins. Ionization of ribosomal proteins will in crease peak density and allow for more reliable identification when analyzed. In our study, positive blood cultures of 108 patients between December 2015 and March 2016 were identified by MALDI TOF MS system and the results were compared to gram staining properties and Phoenix automated systems were compared. KeyWords: Blood culture, MALDI TOF, Phoenix, gram staining, fastdiagnosis.
Benzer Tezler
- Hematolojik maligniteli hastalarda febril nötropenik ataklardaki kan kültür üremelerinin değerlendirilmesi
Research of blood culture results in febrle neutropenic attacks in patients with hematological malignity
NACİYE BETÜL BAYSAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyolojiİstanbul Medeniyet ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN ÇAĞ
UZMAN ÖZLEM AYDIN
- Steril vücut sıvılarından üretilen etkenlerin hızlı antibiyotik duyarlılık test sonuçlarının değerlendirilmesi
Evaluation of rapid antibiotic susceptibility test results of agents produced from sterile body fluids
HATİCE ŞEYMA BAYKUŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ATİFET YASEMİN ÖZTOP
- Pozitif kan kültürlerinden MALDI-TOF MS ile direkt mikroorganizma tanımlanması ve hızlı antibiyotik duyarlılık çalışılması
Direct identification of microorganisms from positive blood cultures with MALDI-TOF MS and studying rapid antibiotic susceptibility test
BİLGEHAN ERGAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP ARZU İLKİ
- Maya mantarlarının hızlı tanımlanmasında lizis filtrasyon sonrası malditof-MS yönteminin kullanımı
The use of malditof-ms method after lysis filtration in quick identification of yeasts
SAMİ EREN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. DİLEK YEŞİM METİN
- Karbapenem dirençli klebsiella pneumoniae suşlarında karbapenemaz varlığının MALDI-TOF MS (matrix assisted laser desorption ionization – time of flight mass spectrometry) ile araştırılması ve real-time PCR yöntemi ile karşılaştırılması
Investigation of the presence of carbapenemase in carbapenem-resistant klebsiella pneumoniae strains by MALDİ-TOF MS (matrix assisted laser desorption ionization – time of flight mass spectrometry) and comparison with real-time PCR method
MELİKE YAŞAR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA FERİHA ÇİLLİ