Geri Dön

Pepper vein yellows virus ((PeVYV)'ün tüm genom dizilemesi ve moleküler karakterizasyonu

Full genome sequence and molecular characterization of Pepper vein yellows virus ((PeVYV)

PDF İndir

  1. Tez No: 661906
  2. Yazar: CEREN SERÇE ÖĞÜT
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HAKAN FİDAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Ziraat, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 60

Özet

Solanaceae familyasında yer alan biber (Capsicum annuum), dünyada ve ülkemizde üretim alanı ve miktarı bakımından ikinci sırada yer alan sebze türüdür. Örtü altı biber üretiminin en fazla olduğu Antalya ili ve çevresinde son zamanlarda Pepper vein yellows virus (PeVYV) enfeksiyonuna sıkça belirlenmiştir. Bu tez çalışmasında PeVYV'nin moleküler karakterizasyonu yapılarak nükleik asit dizilimleri ve protein düzeyi belirlenmiştir. 2019-2020 yılları arasında Antalya ilinde simptomatolojik olarak tespit edilmiş olan PeVYV cins ve tür bazındaki primerler ile RT-PCR çalışmaları yapılmıştır. PeVYV'nin genom primerleri kullanılarak tüm genom dizilemesi elde edilmiştir. Biber bitkilerinden alınan virionlar geçirimli elektron mikroskobu ile incelenmiştir ve 25 nm'lik küresel parçacıklar fotoğraflanmıştır. Biyoinformatik çalışmalar sonucunda PeVYVAnt01 izolatının, %95 oranında benzer bulunduğu Yunanistan'dan kaydedilen biber izolatı ve İtalya'dan kaydedilen biber izolatı ile aynı grupta yer aldığı tespit edilmiştir.

Özet (Çeviri)

Pepper (Capsicum annuum), which is in the Solanaceae family, is grown most produced vegetable plants in the world and in our country in terms of production area and amount. Pepper vein yellows virus (PeVYV) infection has been frequently encountered in Antalya and its surroundings, where greenhouse pepper production is highest. Nucleic acid sequences and protein levels were determined by molecular characterization of PeVYV in this thesis study. The verification was performed by RT-PCR with the PeVYV genus and species-based primers that were detected symptomatologically in Antalya between 2019-2020. Whole genome sequencing was achieved using the genome primers of PeVYV. Virions taken from pepper plants were examined with a transmission electron microscope and spherical particles of 25 nm were photographed. As a result of bioinformatics studies, it was determined that PeVYVAnt01 isolate is in the same group with pepper isolate recorded from Greece and pepper isolate recorded from Italy, which is 95% similar.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    481859

    Bazı biber genotiplerinin PVYV (pepper vein yellows virus)'ye tepkilerinin belirlenmesi

    Determination of some pepper genotypes response to PVYV (pepper vein yellows virus)

    ALAİTTİN APALAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    ZiraatKilis 7 Aralık Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BEKİR BÜLENT ARPACI

  2. Tez No

    121741

    Gaziantep ilinde yetiştirilen biberlere zarar veren virüslerin DAS-ELISA yöntemiyle saptanması

    Identification of pepper viruses by DAS-ELISA assays in Gaziantep

    ZEYNEP SIĞIRCI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MEHMET ÖZASLAN

  3. Tez No

    213791

    Kahramanmaraş'ta biberlerde kök ve kök boğazı yanıklığı etmeni (Phytophthora capsici leonian)'nin inokulum kaynaklarının belirlenmesi ve entegre mücadelesi

    Determination of inoculum sources and integrated control of the causal agent of root and foot rot of pepper (Phytophthora capsici leonian) in Kahramanmaraş

    FATMA KONUKOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH MADEN

  4. Tez No

    322966

    Bazı bitki aktivatörlerinin in vitro ve in vivo koşullarda yetiştirilen biber (Capsicum annuum L.) çeşitlerinde total protein ve peroksidaz aktivitesi üzerine etkileri

    Effects of some plant activators on total protein and POX activity of pepper varieties (Capsicum annuum L.) which growth in itro and in vivo conditions

    RABİA ÖZLEM KIPRAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. CÜNEYT AKI

  5. Tez No

    410859

    Allıum tuncelıanum ekstraktının domates ve biberde önemli bazı patojenlere karşı kullanılma olanaklarının araştırılması

    Investigation of allium tuncelianum extracts against some important pathogens in tomato and pepper

    TUĞÇE ERGÜN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    ZiraatSüleyman Demirel Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜLYA ÖZGÖNEN ÖZKAYA

Geri Dön