Kanatlılardan izole edilen termofilik kampilobakter türlerinde kinolon direncinin fenotipik ve genotipik olarak belirlenmesi
Başlık çevirisi mevcut değil.
- Tez No: 665255
- Danışmanlar: PROF. DR. NACİYE YAKUT ÖZGÜR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Veteriner Hekimliği, Microbiology, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2016
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 72
Özet
Bu çalışmada, farklı üretim sistemlerinde yetiştirilen tavuklardan termofilik kampilobakter izolasyonu yapılması, minimum inhibisyon konsantrasyon (MİK) değerlerinin belirlenmesi (nalidiksik asit ve siprofloksasin) ve dirençle ilişkili genin PCR ile araştırılması amaçlandı. İstanbul (Çatalca, Arnavutköy, Çerkezköy, Avcılar), Sakarya ve İzmir illerinde bulunan yetiştiricilerden, Ekim 2014 – Mayıs 2015 tarihleri arasında tesadüfi örnekleme ile toplam 220 örnek (kloakal svap ya da bağırsak örnekleri) alındı. Bu örneklerin 70'i köy tipi tavuk (kloakal svap), 71'i organik yetiştiricilik (kloakal svap) ve 79'u yer tipi yetiştiricilik (bağırsak içeriği) yapılan broylerlere aitti. Alınan örnekler charcoal cephoperazone desoxycholate (mCCD) agarda kültüre edildi. Multipleks PCR (mPCR) ile 181 Campylobacter spp. izolatı saptandı. C. jejuni (n=98) ve C. coli (n=83) izolatlarının nalidiksik asit ve siprofloksasin için, EUCAST standartlarına göre sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle MİK değerlerini belirlendi. İzolatların nalidiksik asit MİK değerlerine göre (2-128 µg/ml); köy tipi tavuklarda 17, organik broylerlerde 63 ve yer tipi broylerlerde 51 dirençli (MİK>16) izolat saptandı. Siprofloksasin MİK değerlerine göre (0,032-16 µg/ml); köy tipi tavuklarda 24, organik broylerlerde 65 ve yer tipi broylerlere 79 dirençli (MİK>0,5) izolat saptandı. Fenotipik olarak dirençli olan izolatlara gyrA genindeki C257T (Thr-86-Ile) mutasyonunu belirlemek amacıyla Mismatch amplification mutation assay PCR (MAMA-PCR) yapıldı. Tüm izolatların gyrA geninde mutasyon saptandı. Bu bulgular farklı yöntemlerle yetiştirilen tavuklardaki kampilobakter izolatlarında yaygın nalidiksik asit ve siprofloksasin direnci olduğunu ve bu dirençli kampilobakter izolatlarının yaygınlığını azaltmak için kanatlı üretiminde antibiyotik kullanımının sınırlandırılması gerektiği kanısına varıldı.
Özet (Çeviri)
This study was aimed to the isolation of thermophilic campylobacter from different rearing systems, determination of minimum inhibitory concentrations (MICs) values and, investigation of resistance gene by PCR. Totally 220 dropping samples (cloacal swabs and intestinal contents) by random sampling were collected between October 2014 and May 2015 from village-type, organic and conventional broiler farms which have been found in Istanbul (Catalca, Arnavutkoy, Cerkezkoy, Avcilar), Sakarya and Izmir provinces, respectively. These samples of 70 village-type (cloacal swabs), 71 organic type (cloacal swabs) and 79 conventional type (intestinal swabs) of breeding belonged to broilers. The samples were cultured in modified charcoal cephoperazone desoxycholate (mCCD) agar and 181 isolates were identified with multiplex PCR (mPCR). The MICs values of C. jejuni (n=98) and C. coli (n=83) isolates were determinated with a micro broth dilution method which was recommended by the European Committee on Antibiotic Susceptibility Testing (EUCAST). According to nalidixic acid (2-128 mg / ml) and ciprofloxacin (0,032-16 µg/ml) MICs of the isolates, 17, 63 and 51, and 24, 65 and 79 resistance isolates were determinated in village-type, organic-type and conventional type of breeding respectively. Mismatch amplification mutation assay polymerase chain reaction protocol was performed in order to detect this gyrA mutation. The gyrA mutation was observed in all of ciprofloxacin resistance isolates. These findings showed that the widespread nalidixic acid and ciprofloxacin resistance was found in Campylobacter isolates of chickens different rearing systems and use of antibiotics should be restricted to reduce the prevalence of resistant Campylobacter isolates in poultry production.
Benzer Tezler
- Kanatlılardan izole edilen salmonella suşlarının identifikasyonunda kullanılan metotlar üzerinde araştırmalar
Research on the methods used for identification of salmonella strains isolated from poultry species
ÜMİT ÖZDEMİR (SEVİMLİ)
- Kanatlılardan izole edilen Salmonella'ların identifikasyonunda koaglütinasyon testinin önemi
Başlık çevirisi yok
DEMET İŞCAN
- Kanatlılardan izole edilen salmonella suşlarının florokinolon grubu antibiyotiklere duyarlılıklarının ve minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerlerinin karşılaştırılması üzerine çalışmalar
Conparison of antibiotic susceptibilities and minimum inhibitor concentration (MIC) values of avian salmonella icolates against fluoroquinolones
ÖĞÜT KÖSE
Yüksek Lisans
Türkçe
2003
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. N. YAKUT ÖZGÜR
- Çeşitli evcil ve yabani kanatlılardan arcobacter SPP. izolasyonu ve izolatların multipleks pzr ile genotiplendirilmesi
Isolation of arcobacter spp. and genotyping of isolates by multiplex PCR from various poultry and wild avian animals
ELİF ÇELİK
- Bazı uçucu yağların Salmonella spp. üzerine antibakteriyel etkilerinin araştırılması ve GCMS ile karakterizasyonu
Characterization of some essential oils with GCMS and investigation antibacterial effects on Salmonella spp.
EVREN ARIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ALİ TABUR