Geri Dön

Kan kültüründen izole edilen candida suşlarında azol direnç mekanizmalarının moleküler olarak araştırılması

Molecular investigation of azol resistance mechanism in candida strains isolated from blood culture

PDF İndir

  1. Tez No: 665634
  2. Yazar: AYŞE ALICI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜLGÜN YENİŞEHİRLİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Tokat Gaziosmanpaşa Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 93

Özet

Çalışmamızda kan kültüründen izole edilen Candida türlerinin tanımlanması, antifungal duyarlılıklarının belirlenmesi ve azol direnç mekanizmalarının moleküler olarak tespiti amaçlanmıştır. Çalışmaya kan kültüründen izole edilen 100 Candida suşu dahil edildi. Tür düzeyinde tanımlanma sonucu suşların 41'i C.albicans, 22'si C.parapsilosis, 14'ü C.glabrata, 13'ü C.tropicalis, 5'i C.lusitaniae, 3'ü C.guillermondi, 1'i C.krusei, 1'i C.kefyr olarak tanımlandı. Çalışmaya dahil edilen suşların %78'i yoğun bakım'dan, %16'sı dahili servislerden, %6'sı cerrahi servislerden gelen örneklerden izole edildi. Antifungal duyarlılık testi C.albicans, C.parapsilosis, C.glabrata ve C.tropicalis suşlarına yapıldı. Suşların flukonazol, posakonazol, vorikonazol, amfoterisin B, kaspofungin ve mikafungin için in vitro antifungal duyarlılıkları belirlendi. C.albicans suşlarının %2'si flukonazol, %15'i vorikonazol dirençli bulunurken, suşların %5'i vorikonazol, %10'u mikafungin orta duyarlı bulundu. C.albicans suşlarının %34'ü amfoterisin B, %7'si posakonazol için vahşi olmayan tip olarak bulunurken; suşların tamamı kaspofungin duyarlı bulundu. C.parapsilosis suşlarının %23'ü flukonazol dirençli %23'ü doz bağımlı duyarlı bulundu. C.parapsilosis suşlarının %50'si vorikonazol, %14'ü mikafungin orta duyarlı bulunurken suşların tamamı kaspofungin duyarlı bulundu. Suşların %59'u amfoterisin B için, %5'i posakonazol için vahşi olmayan tip olarak bulundu. C.glabrata suşlarının %21'i flukonazol dirençli, %79'u flukonazol doz bağımlı duyarlı bulundu. C.glabrata suşlarının %7'si mikafungin dirençli bulunurken; suşların %64'ü mikafungin, %7'si kaspofungin orta duyarlı bulundu. C.glabrata suşlarının %71'i amfoterisin B, %57'si vorikonazol için vahşi olmayan tip olarak bulunurken, suşların tamamı posakonazol için vahşi tip olarak bulundu. C.tropicalis suşlarının tamamı flukonazol ve kaspofungin duyarlı bulunurken; suşların %15'i vorikonazol, %15'i mikafungin orta duyarlı bulundu. Suşların %77'si amfoterisin B için, %8'i posakonazol için vahşi olmayan tip olarak bulundu. Antifungal duyarlılık testi sonucuna göre flukonazol dirençli 3 C.glabrata, 5 C.parapsilosis, 1 C.albicans ve flukonazol doz bağımlı duyarlı 11 C.glabrata, 5 C.parapsilosis suşunda ERG11, CDR1, CDR2 ve MDR1 genlerinin ekspresyon seviyeleri hesaplandı. Sonuçlar kontrol ATCC suşları ile kıyaslanarak genlerin kaç kat ekprese edildiği hesaplandı. Buna göre flukonazol dirençli C.glabrata suşlarının tamamında ERG11 ve CDR1, %67'sinde CDR2 geni over eksprese bulundu. Flukonazol doz bağımlı duyarlı C.glabrata suşlarının tamamında ERG11 ve CDR1, %91'inde CDR2 genini over eksprese bulundu. Flukonazol dirençli C.parapsilosis suşlarının tamamında MDR1, %80'inde ERG11ve CDR1 genleri over eksprese bulundu. Flukonazol doz bağımlı duyarlı C.parapsilosis suşların %80'inde ERG11, CDR1, MDR1 genleri over eksprese bulundu. Flukonazol dirençli C.albicans suşunda ise ERG11 ve CDR1 genleri over eksprese saptandı.

Özet (Çeviri)

In our study, it was aimed to identify Candida species isolated from blood culture, to determine their antifungal susceptibility and molecular determination of azole resistance mechanisms. A total of 100 Candida strains isolated from blood culture were included in the study. As a result of species-level identification, 41 of the strains were C.albicans, 22 were C.parapsilosis, 14 were C.glabrata, 13 were C.tropicalis, 5 were C.lusitaniae, 3 were C.guillermondi, 1 was C.krusei, 1 was identified as C.kefyr. Of the strains included in the study, 78% were isolated from the intensive care unit, 16% from the internal services, and 6% from the surgical services Antifungal susceptibility testing was performed on C.albicans, C.parapsilosis, C.glabrata and C.tropicalis strains. In vitro antifungal susceptibilities of the strains for fluconazole, posaconazole, voriconazole, amphotericin B, kaspofungin and micafungin were determined. While 2% of the C.albicans strains were resistant to fluconazole and 15% to voriconazole, 5% of the strains were found intermediate resistant to voriconazole and 10% to micafungin. While 34% of C.albicans strains were found as non-wild type for amphotericin B, 7% for posaconazole; all strains were found susceptible to caspofungin. Twenty three percent of C.parapsilosis strains were resistant to fluconazole and 23% were dose-dependent susceptible. While 50% of the C.parapsilosis strains were found intermediate susceptible to voriconazole and 14% to micafungin, all strains were found susceptible to caspofungin. 59% of the strains were found non-wild type for amphotericin B and 5% for posaconazole. Twenty one percent of the C.glabrata strains were found fluconazole resistant, 79% were dose-dependent susceptible to fluconazole. While 7% of C.glabrata strains were micafungin resistant; 64% of the strains were found intermediate susceptible to micafungin and 7% to caspofungin. While 71% of the strains were found as non-wild type for amphotericin B, 57% for voriconazole, all of the strains were wild type for posaconazole. While all C.tropicalis strains were found susceptible to fluconazole and caspofungin; 15% of the strains were found intermediate susceptible to voriconazole and 15% to micafungin. 77% of the strains were found to be non-wild type for amphotericin B and 8% to posaconazole. According to the antifungal susceptibility test, expression levels of ERG11, CDR1, CDR2 and MDR1 genes were calculated in the fluconazole-resistant 3 C.glabrata, 5 C.parapsilosis, 1 C.albicans and fluconazole dose-dependent susceptible 11 C.glabrata, 5 C.parapsilosis strains. The number of folds the genes were expressed was calculated by comparing the results with the control ATCC strains. Accordingly, over expression of ERG11 and CDR1 was found in all fluconazole-resistant C.glabrata strains, and over expression of CDR2 was found in 67% of them. In all fluconazole dose dependent susceptible C.glabrata strains over expressed ERG11 and CDR1 genes, while 91% of them over expressed CDR2 genes. MDR1 genes were overexpressed in all fluconazole resistant C.parapsilosis strains, and ERG11 and CDR1 genes were overexpressed in 80% of them. ERG11, CDR1, MDR1 genes were overexpressed in 80% of fluconazole dose-dependent susceptible C.parapsilosis strains. In fluconazole resistant C.albicans strain, ERG11 and CDR1 genes were found overexpressed.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    644509

    Hacettepe Üniversitesi klinik mikoloji laboratuvarında fungemi etkeni olarak izole edilen candida parapsilosis kompleks izolatlarında türlerin belirlenmesi, bu türlerde azollere direnç durumunun ve direncin moleküler mekanizmalarının incelenmesi

    Investigation of the distribution of species, detection of the susceptibility to azoles, and molecular mechanisms of resistance to azoles in candida parapsilosis complex fungemia isolates in hacettepe university clinical mycology laboratory, Hacettepe University Faculty of Medicine

    SELAY DEMİRCİ DOS SANTOS DUARTE

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DOLUNAY GÜLMEZ KIVANÇ

  2. Tez No

    454077

    Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesinde izlenen yetişkin hastalarda kandidemi olgularının epidemiyolojisi, risk faktörleri, antifungal duyarlılıkları ve mortalite açısından farklılıklarının saptanması

    Evaluation of epidemiology, risk factors, antifungal susceptibilities and mortality of candidaemia in adult patients admitted to Akdeniz University Medical School Hospital

    ÇİĞDEM ÇİÇEK KOLAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıAkdeniz Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİLİZ GÜNSEREN

  3. Tez No

    803438

    2018-2021 yılları arasında hastanemiz yoğun bakım ünitelerinden gönderilen kan kültürü ve alt solunum yolu örneklerinden izole edilen gram negatif bakterilerin antibiyotik duyarlılık verileri ve direnç profiline COVİD-19 pandemisinin etkisi

    The effect of the COVİD-19 pandemic on the antibiotic susceptibility data and resistance profile of gram-negative bacteria isolated from blood cultures and lower respiratory tract samples sent from the intensive care units of OUR hospital between 2018-2021

    DİDEM ÖZKAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    MikrobiyolojiSağlık Bakanlığı

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. AYFER BAKIR

  4. Tez No

    408453

    Kan kültürlerinden izole edilen candida türlerinin floresan in situ hibridizasyon yöntemiyle tanımlanması ve antifungal duyarlılıklarının araştırılması

    Determination of candida species isolated from blood cultures with floresan in situ hibridization method and investigation of antifungal susceptibilty

    GONCA AYDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NEDRET KOÇ

  5. Tez No

    455230

    Kan kültüründen izole edilen candida türü mayaların repetetive-PCR ile klonal dağılımlarının belirlenmesi

    Detection of clonal distrubition of candida type yeasts isolated from blood culture with repetetive PCR

    BEGÜM BAYRAM UÇAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    MikrobiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. YASEMİN ZER

Geri Dön