Geri Dön

Hacettepe Üniversitesi klinik mikoloji laboratuvarında fungemi etkeni olarak izole edilen candida parapsilosis kompleks izolatlarında türlerin belirlenmesi, bu türlerde azollere direnç durumunun ve direncin moleküler mekanizmalarının incelenmesi

Investigation of the distribution of species, detection of the susceptibility to azoles, and molecular mechanisms of resistance to azoles in candida parapsilosis complex fungemia isolates in hacettepe university clinical mycology laboratory, Hacettepe University Faculty of Medicine

PDF İndir

  1. Tez No: 644509
  2. Yazar: SELAY DEMİRCİ DOS SANTOS DUARTE
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. DOLUNAY GÜLMEZ KIVANÇ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2020
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 78

Özet

Candida parapsilosis kompleks, biyokimyasal ve fenotipik olarak ayrılamayan ve direnç profilleri, tedavi yanıtları ve prevalansları farklı olan Candida parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis ve Candida metapsilosis türlerinden oluşan önemli bir fungemi etkenidir. Tedavide sıklıkla kullanılan azollere duyarlılık azalmaktadır. Bu çalışmada, kan kültüründen izole edilen C. parapsilosis kompleks suşlarında tür dağılımı, azollere duyarlılık durumu ve moleküler mekanizmaların ortaya konması amaçlanmıştır. Hacettepe Üniversitesi Hastaneleri Mikoloji Laboratuvarı'nda 1997-2017 yıllarında periferik kan ve kateter kanı örneklerinden üretilen C. parapsilosis kompleks izolatlarında sekonder alkol dehidrogenaz (SADH) geni“Restriction Fragment Lenght Polymorphism”(RFLP) yöntemiyle türler belirlenmiş, flukonazol, vorikonazol ve posakonazole ait minimum inhibitör konsantrasyon (MİK) değerleri 'European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing' (EUCAST) önerilerine göre saptanmış ve değerlendirilmiştir. Direncin moleküler mekanizmaları için ERG11 ve MRR1 genlerine ait DNA dizileri incelenmiştir. Çalışmaya alınan 181 izolatın 180'inin Candida parapsilosis sensu stricto, birinin ise C. orthopsilosis olduğu görülmüştür. Flukonazol direnç oranı %13,2'dir (24/181). ERG11 geninde 53 izolatın yüksek dozda duyarlı ve dirençli olan 37'sinde A395T (Y132F), altısında G1372A (G458S) mutasyonları saptanmıştır. Ayrıca iki izolatta daha önce bildirilmemiş olan G1261A (D421N) mutasyonu bulunmuştur. Sessiz T591C (I197I) mutasyonu, duyarlı ve dirençli 52 izolatta gösterilmiştşr. MRR1 genindeyse 29 izolatta G1214A (R405K) ve dört izolatta G2779T (G927D) mutasyonları saptanmıştır. Yıllar içinde azollere artan direncin görüldüğü ve dirence sebep olan moleküler mekanizmaların literatür ile uyumlu olduğu gözlenmiştir. Daha önce bildirilmeyen G1261A (D421N) mutasyonunun da azol direnci ile ilişkisinin daha başka çalışmalar ile ortaya konması gerekmektedir.

Özet (Çeviri)

Candida parapsilosis complex is important in fungemia, consisting of Candida parapsilosis sensu stricto, Candida orthopsilosis and Candida metapsilosis species, which cannot be separated biologically and phenotypically and have different resistance profiles and prevalence. Susceptibility to azoles is decreasing in this species. In this study, it was aimed to determine the species distribution in C.parapsilosis complex fungemia isolates and to reveal molecular mechanisms causing decreased susceptibility to azoles. Species-level identification was determined by the secondary alcohol dehydrogenase (SADH) gene Restriction Fragment Lenght Polymorphism (RFLP) method in these isolates obtained from peripheral and catheter-drawn blood samples in 1997-2017 at Hacettepe University Hospitals Mycology Laboratory. The minimum inhibitory concentration (MIC) values of fluconazole, voriconazole and posaconazole were determined and interpreted according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). DNA sequences of ERG11 and MRR1 genes were analyzed for molecular mechanisms of resistance. In 181 isolates per patient, 180 were C.parapsilosis sensu stricto, and one was C. orthopsilosis. The fluconazole resistance rate was 13.2% (24/181). For the ERG11 gene, 37 non-susceptible isolates of 53 isolates had A395T (Y132F) mutation and six isolates had G1372A (G458S) mutation. In addition, G1261A (D421N) mutation, which was not previously reported, was found in two isolates. The silent T591C (I197I) mutation was demonstrated in 52 of 53 isolates including susceptible and resistant isolates. In the MRR1 gene, G1214A (R405K) mutation was detected in 29 isolates and G2779T (G927D) mutation was found in four isolates. The resistance to azoles increased over the years and the molecular mechanisms causing the resistance were compatible with the literature. The relationship of G1261A (D421N) mutation, which has not been previously reported, with azole resistance should be demonstrated with further studies.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    749371

    Klinik candida ve aspergillus suşlarının antifungal duyarlılık profillerinin matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi ('MALDİ-TOF MS') yöntemi ile değerlendirilmesi

    Evaluation of antifungal susceptibility profiles of clinical candida and aspergillus strains by matrix assisted laser desorption/ionization time-of-FLİGHT MASS spectrometry ('MALDİ-TOF MS') method

    İLKE TOKER ÖNDER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEVTAP ARIKAN AKDAĞLI

  2. Tez No

    420119

    Candida türlerinde biyofilm oluşumu ve antifungal duyarlılığa etkisi

    Biofilm formation in candida species and its effect on antifungal susceptibility

    HACER ASLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DOLUNAY GÜLMEZ KIVANÇ

  3. Tez No

    752412

    Klinik saprochaete izolatlarının tür düzeyinde tanımlanması, iki farklı referans yöntemle elde edilen antifungal duyarlılık testi sonuçlarının karşılaştırılması ve virülans faktörlerinin araştırılması

    Identification of clinical saprochaete isolates at species level, comparison of antifungal susceptibility test results obtained with two different reference methods, and investigation of virulence factors

    BEYZANUR KAŞALTI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. DOLUNAY GÜLMEZ KIVANÇ

  4. Tez No

    437413

    Febril nötropenili hematolojik kanser hastalarında görülen invazif fungal enfeksiyonlarda uygulanan tedavi yaklaşımlarının maliyet etkililik analizi

    Cost-effectiveness analysis of invazife fungal infections therapies in febrile neutropenic patients with hematological malignancy

    ÖZLEM ATİK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe Üniversitesi

    Eczacılık İşletmeciliği ve Mevzuatı Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SELEN YEĞENOĞLU

    DOÇ. DR. SİBEL AŞÇIOĞLU HAYRAN

  5. Tez No

    658625

    Akut lösemi hastalarında invaziv fungal enfeksiyonlar

    Invasive fungal infections in acute leukemia patients

    ASLI ÖNCEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Göğüs HastalıklarıHacettepe Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. LÜTFİ ÇÖPLÜ

Geri Dön