Türkiye'de yetişen Salvia L. (adaçayı) cinsi Sclarea altcinsine ait bazı türlerin moleküler teknikler kullanılarak karakterizasyonu
Characterization of using molecular techniques of some species belonging to Sclarea subgenus of Salvia L. (sage) growing in Turkey
- Tez No: 665956
- Danışmanlar: DOÇ. DR. DENİZ ULUKUŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Genetik, Biology, Biotechnology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Selçuk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 73
Özet
Türkiye'de yetişen Salvia L. (adaçayı) cinsi Sclarea altcinsine ait olan 10 adaçayı türü ve Melissa officinalis türünün genetik benzerlik ve farklılıklarını inceleyip akrabalık ilişkilerini belirlemek amacıyla yapılan çalışmada DNA markörü olarak SRAP moleküler markörü kullanılmıştır. Polimorfizm oranı en yüksek olan SRAP kombinasyonlarını belirlemek için 9 adaçayı DNA'sında 22 SRAP primer kombinasyonu ön taramaya tabi tutulmuş bunlardan yüksek oranda polimorfizm gösteren 9 SRAP primer kombinasyonu tüm örneklerde test edilmiştir. Toplam 10 adaçayı ve dış grup olarak seçilen Melissa officinalis örneklerinde 9 SRAP primer kombinasyonu ile 93'ü polimorfik olan 97 bant tespit edilmiştir. Ortalama polimorfizm oranı %94.70 olarak tespit edilmiştir. Ortalama polimorfizm bilgi içerik (PIC) değerinin 0.36 olduğu ve 0.29-0.43 aralığında değiştiği belirlenmiştir. 10 adaçayı ve dış grup olarak seçilen Melissa officinalis genotipinin birbirine olan uzaklıklarının, Dice ve Ochiai benzerlik katsayısı ile UPGMA ve NJ algoritmaları kullanılarak filogenetik karşılaştırmaları yapılmıştır. Buna göre Dice benzerlik katsayısı ile ortalama genetik farklılık değeri %54.34 olarak tespit edilmiştir. Minimum genetik farklılığa %28.57 oranı ile Salvia argentea ve Salvia vermifolia türleri arasında rastlanırken, maksimum farklılığa ise %92.85 oranı ile Melissa officinalis ve Salvia atropatana türleri arasında rastlanılmıştır. Ochiai benzerlik katsayısı ile ortalama genetik farklılık değerinin ise %52.54 olduğu belirlenmiştir. Minimum farklılığa %28.51 oranı ile Salvia argentea ve Salvia vermifolia türleri arasında rastlanırken, maksimum farklılığa ise %91.29 oranı ile Melissa officinalis ve Salvia atropatana türleri arasında rastlanılmıştır. Yapılan analizler sonucunda SRAP markör sisteminin evrimsel analizlerde kullanılabilir olduğu ve güvenilir sonuçlar verdiği belirlenmiştir. Bu çalışma ile Türkiye'de yetişen Salvia L. (adaçayı) cinsi Sclarea altcinsine ait türlerin SRAP moleküler markörü kullanılarak ilk kez evrimsel olarak incelemesi sağlanmıştır.
Özet (Çeviri)
In a study conducted to examine the genetic similarities and differences of Melissa officinalis and 10 Salvia species belonging to the Sclarea subgenus of the Salvia L. (Sage) genus grown in Turkey and determine their relationship, the SRAP molecular marker was used as a DNA marker. In order to determine the primer combinations with the highest polymorphism rate, 22 SRAP primer combinations in 9 sage DNA were pre-screened and 9 SRAP primer combinations showing high polymorphism were evaluated for all samples. In the Melissa officinalis samples selected as 10 sage and outgroup, 97 bands, 93 of which were polymorphic, were detected with a combination of 9 SRAP primers. The average polymorphism rate was determined as 94.70%. It was determined that the average polymorphism information criterion (PIC) value was 0.36 and varied between 0.29-0.43. Phylogenetic comparisons were made using UPGMA and NJ algorithms with the Dice and Ochiai similarity coefficient and the proximity of Melissa officinalis genotype selected as 10 sage and outgroup. Accordingly, the ratio similarity coefficient and the average genetic difference value were determined as 54.34%. While the minimum genetic difference was found between Salvia argentea and Salvia vermifolia species with a rate of 28.57%, the maximum difference was found between Melissa officinalis and Salvia atropatana species with a rate of 92.85%. It was determined that the average genetic difference value with the Ochiai coefficient was 52.54%. The Minimum difference was found between Salvia argentea and Salvia vermifolia species with a rate of 28.51%, while the maximum difference was found between Melissa officinalis and Salvia atropatana species with a rate of 91.29%. As a result of the analysis, it was concluded that the SRAP marker system can be used in evolutionary analysis and gives reliable results. In this study grown in Turkey Salvia L.(sage) method Sclarea first evolutionarily examined by the species of the subgenus SRAP molecular marker is provided.
Benzer Tezler
- Bodrum ve Marmara Adası'nda yetişen Salvia fruticosa (Syn. salvia Triloba) bitkisinin polar ekstrelerinin kimyasal kompozisyonu ve biyoaktivitelerinin karşılaştırılması
Comparison of chemical composition and bioactivity of polar extracts Salvia fruticosa (Syn. salvia Triloba) plant growing in Bodrum and Marmara Island
MELİKE TEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Eczacılık ve FarmakolojiBezm-i Alem Vakıf ÜniversitesiFarmakognozi ve Doğal Ürünler Kimyası Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜLAÇTI TOPÇU
- Analytical studies on bioactive components of natural materials
Doğal malzemelerin biyoaktif bileşenleri üzerine analitik çalışmalar
VESELİNA ADIMCILAR
Doktora
İngilizce
2024
Kimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATMA BEDİA ERİM BERKER
- Kayseri yöresinde doğal olarak yetişen bazı adaçayı (Salvia sp.) türlerinin uçucu yağ oranları ve uçucu yağ bileşenlerinin belirlenmesi
Determimination of essential content and essential oil components of some sage (Salvia sp.) species native to Kayseri province
BURAK IŞIK
- Anadolu adaçayı (Salvia fruticosa Mill.) bitkisinde denizyosunu uygulamalarının meydana getirdiği metabolik etkilerin belirlenmesi
Determination of metabolic effects of seaweed applications on Anatolian sage (Salvia fruticosa Mill.)
RÜVEYDE NUR YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatBursa Uludağ ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. ASUMAN CANSEV
DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞEGÜL AKPINAR
- Türkiye'de yetişen farklı Salvia L. türlerinin prebiyotik etkinliğinin araştırılması
Investigation of prebiotic activity of various Salvia L. species growing in Türkiye
MEVLÜDE NUR TOPAL
Doktora
Türkçe
2024
BiyolojiAnkara Yıldırım Beyazıt ÜniversitesiHalk Sağlığı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MURAT KOÇ