Geri Dön

Önemli kanatlı solunum yolu viruslarının real-time polymerase chain reaction (rPCR) ile araştırılması

Investigation of important avian respiratory virus infections by real-time PCR

PDF İndir

  1. Tez No: 674634
  2. Yazar: ÖZGE ARDIÇLI
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAMİL TAYFUN CARLI
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Bursa Uludağ Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 128

Özet

Bu çalışmada solunum yolu problemli tavuklarda Avian Coronavirus Infectious Bronchitis Virus (IBV), Infectious Laryngotracheitis Virus (ILTV), Avian Metapneumovirus (aMPV) ve Avian Reovirus (ARV) aranması ve IBV ve ILTV izolatlarının genetik karakterizasyonlarının yapılması hedeflendi. Bu amaçla Türkiye'de 15 ilde yer alan 45 yumurtacı ve 48 broyler kümeslerindeki tavuklara ait trakeal svablardan virus izolasyonu için 'Specific Pathogen Free' embriyolu yumurtalara ekim yapıldı. Bu yumurtaların koryoallantoik sıvılarında Newcastle Disease Virus (NDV) ve Avian Influenza Virus (AIV) varlığı Hemaglutinasyon ve Hemaglutinasyon İnhibisyon testleri ile saptandı. IBV, ILTV, aMPV ve ARV'ları ise Real-Time PCR (rPCR) testleri ile identifiye edildi. İdentifikasyon işlemleri sonucunda örneklerin hiçbirinde NDV ve AIV saptanmazken, yumurtacı örneklerinin 21'inde (%46,67) IBV, 10'unda (%22,22) ILTV, 6'sında (%13,33) aMPV ve 2'sinde (%4,44) ARV, broyler örneklerinin ise 28'inde (%58,33) IBV, 1'inde (%2,22) ILTV, 4'ünde (%8,33) aMPV ve 10'unda (%20,83) ARV varlığı tespit edildi. İncelenen yumurtacı ve broyler tavuklara ait örneklerin sırasıyla 5'inde (%11,11) ve 1'inde (%2,08) IBV+aMPV, 1'inde (%2,22) ve 5'inde (%10,42) IBV+ARV ikili olarak bulunurken, broyler örneklerin ise 2'sinde (%4,17) IBV+aMPV+ARV üçlü olarak saptandı. Birden fazla etken bulunan toplam örnek oranı %15,05 olarak hesaplandı. ILTV saptanan örneklerde başka bir virus belirlenmedi. Ayrıca yumurtacı ve broyler tavuk örneklerinin hiçbirinde ARV+aMPV ikili olarak saptanmadı. ILTV izolatlarının genetik karakterizasyonları sonucunda hepsinin saha suşu ve düşük virulensli oldukları kararına varıldı. IBV'ye ait S1 gen bölgesinin dizileme işlemi 5 örnekte başarılı oldu. Bu örneklerden 3'ünün 4/91 genotipi ile; diğer 2'sinin ise IS/1494/06 (Israel Var2) genotipi ile %99 oranında benzerlik gösterdiği belirlendi. Elde edilen sonuçların kanatlı endüstrisine faydalı olacağı düşünülmektedir.

Özet (Çeviri)

In this study, it was aimed to search Avian Coronavirus Infectious Bronchitis Virus (IBV), Infectious Laryngotracheitis Virus (ILTV), Avian Metapneumovirus (aMPV), and Avian Reovirus (ARV) and to perform genetic characterization of IBV and ILTV isolates in chickens with respiratory problems. For this purpose,“Specific Pathogen Free”embryonated chicken eggs were inoculated for virus isolation from tracheal swabs of chickens in 45 layers and 48 broiler flocks located in 15 provinces in Turkey. The presence of Newcastle Disease Virus (NDV) and Avian Influenza Virus (AIV) in the chorioallantoic fluid of these eggs was detected by Hemagglutination and Hemagglutination Inhibition tests. IBV, ILTV, aMPV, and ARV were identified by Real-Time PCR (rPCR) tests. As a result of the identification process, NDV and AIV were not detected in any of the samples; concerning layer samples, the presence of 21 (46.67%) IBV, 10 (22.22%) ILTV, 6 (13.33%) aMPV, and 2 (% 4.44) ARV were detected, whereas, IBV in 28 (58.33%), ILTV in 1 (2.22%), aMPV in 4 (8.33%) and 10 (20.83%) ARV were detected in broiler samples. Of the layers and broiler chickens examined, respectively, IBV+aMPV in 5 (11.11%) and 1 (2.08%), IBV+ARV in 1 (2.22%), and 5 (10.42%) were found to be dual infections while IBV+aMPV+ARV were detected as triple in 2 (4.17%) broiler samples. The total sample rate with more than one agent was calculated as 15.05%. No other virus was detected in ILTV detected samples. In addition, ARV+aMPV was not detected as a dual infection in any of the layers and broiler chicken samples. Regarding the genetic characterization of ILTV isolates, it was concluded that they were all field strains and low virulence. Sequencing of the S1 gene region of IBV was successful in 5 samples. It was determined that 3 of these samples to 4/91 genotype and the other 2 were 99% similar to the IS / 1494/06 (Israel Var2) genotype. It is thought that the present results will be beneficial in the poultry industry.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    376889

    Balıkesir ve Bolu illerinde bulunan kanatlı işletmelerinde avian reovirus enfeksiyonunun serolojik olarak araştırılması

    Serological research on avian reovirus infections in poultry enterprises in Balikesir and Bolu regions

    SIDIKA BELGİN AYDIN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    Veteriner HekimliğiAdnan Menderes Üniversitesi

    Viroloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. NURAL EROL

  2. Tez No

    629664

    Kümes hayvanlarında mycoplasma gallisepticum'un tespiti için lam aglütinasyon, ELISA ve PCR testlerinin karşılaştırılması

    Comparison of slide agglutination, ELISA and PCR tests for the detection of mycoplasma gallisepticum in poultry

    MÜMTAZ RECEP TEKKALAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    BiyoteknolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMRAH TORLAK

  3. Tez No

    490021

    Broiler sürülerinde ornithobacterium rhinotracheale infeksiyonunun seroprevalansının ELISA yöntemi ile araştırılması

    Investigation of the seroprevalence of ornithobacterium rhinotracheale infection in broiler hens by ELISA

    CENK GÜLLÜ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. GÖKSEL ERBAŞ

  4. Tez No

    585053

    Kafes kuşlarında dışkı ile chlamydophila psittaci saçılımının real time PCR ile araştırılması

    Investigation of chlamydophila psittaci scattering in cage birds with by real Time PCR

    ZEYNEP YILMAZ ER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Veteriner HekimliğiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZAFER CANTEKİN

  5. Tez No

    782006

    Mycoplasma gallıseptıcum varlığının pcr ve loop medıated ısothermal amplıfıcatıon yöntemi ile karşılaştırılmalı olarak belirlenmesi

    Comperative detection of the precense of mycoplasma gallisepticum by conventionel polimerase chain reaction and loop mediated isothermal amplification

    ELİF BULUT

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Veteriner HekimliğiKırıkkale Üniversitesi

    Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT YILDIRIM

Geri Dön