Geri Dön

TLR4 VE IL28B genleri polimorfizmlerinin tüberküloz enfeksiyonlarının insidansı ve gelişimine etkisi

Impact of TLR4 VE IL28B gene polymorphisms on their incidence of tuberculosis infection

PDF İndir

  1. Tez No: 683437
  2. Yazar: AHMED KAMIL BUNIYA BUNIYA
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜGE FIRAT
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 95

Özet

Mycobacterium tuberculosis bakterisinin neden olduğu tüberküloz, bulaşıcı ve yaygın bir hastalık olup dünyadaki başlıca ölüm nedenlerinden biridir. Bu çalışmada, 100 tüberküloz hastasından balgam örnekleri alınmış olup Ziehl-Neelsen doğrudan muayene yöntemi kullanılarak 88'i TB pozitif, geri kalanı TB negatif bulunmuştur. Tüm örnekler L-J besiyerinde kültüre alınmış ve bakteri kültürü sonuçları %100 TB pozitif bulunmuştur. Balgam numuneleri ayrıca moleküler GeneXpert sistemi kullanılarak da incelenmiştir. Sonuçlar, MTB'nin varlığı veya yokluğu sinyaline ve rifampisin direncinin varlığı veya yokluğuna göre 6 seviyeye ayrılmıştır. Bu çalışmada hastalar 8 yaş grubuna ayrılmıştır. Hastaların yaşları 4 ile 85 yaş arasında değişmektedir. Sonuçlar, en yüksek hasta yüzdesinin %28 ile 25-34 yaş grubunda kaydedildiğini, bunu %21 ile 15-24 yaş grubunun, ardından %19 ile 45-54 yaş grubunun takip ettiğini ve %10 ile 35-44 ve 54-64 yaş gruplarında eşit, %3 ile 5-14 ve %1 ile 0-4 yaş gruplarında en düşük oranlara sahip olduğunu ortaya koymuştur. Bu çalışmada erkeklerde enfeksiyon oranı %51 iken kadınlarda %49 olarak bulunmuştur. Kültürü pozitif olan 43 hasta ve 30 sağlıklı kontrol TLR4 ve IL28B genlerinin tek nükleotid polimorfizmleri açısından araştırılmıştır. Hepsinin periferik kanından genomik DNA ekstrakte edilmiş ve bu çalışma için özel olarak tasarlanmış spesifik primerler kullanılarak PCR ile hedef DNA amplifiye edilmiştir. TLR4 geninin tek nükleotid polimorfizmleri (rs1927911 ve rs10759930), MTB hastalarında ve sağlıklı kontrollerde üç genotip (rs1927911 için CC, CT ve TT ve rs10759930 için TT, TC ve CC) bulunurken, IL28B geninin tek nükleotid polimorfizmleri (rs12979860 ve rs8099917), MTB hastalarında ve sağlıklı kontrollerde üç genotip (rs12979860 için TT, TC ve CC ve rs8099917 için TT, TG ve GG) ile sunulmaktadır. Bu çalışmada, sonuç, allel T için homozigot olan hastaların pulmoner TB gelişme riskinin anlamlı olarak daha yüksek olduğunu, 12,923 olasılık oranıyla (%95 güven aralığı, 2,1621 ila 32,9812) ve p değeri=0,0221 olan hastaların allel T için heterozigot, 4,4423'lük bir olasılık oranı (%95 güven aralığı, 1,4449 ila 115,5796) p değeri=0,0060 ile pulmoner TB gelişimi için önemli ölçüde daha yüksek bir riske sahip olduğunu ortaya koymuştur. Dolayısıyla TLR4 geninin sonucu C

Özet (Çeviri)

Tuberculosis, which is caused by the bacteria Mycobacterium tuberculosis, is an infectious and common disease and one of the main causes of death in the world. Sputum samples were collected from 100 tuberculosis patients and diagnosed by the Ziehl-Neelsen direct examination method; 88 of them showed positive results, while the remaining results were negative. All samples were cultivated on L-J medium, and the results of the bacterial culture were 100% TB positive. Molecular investigations of sputum samples were also performed using GeneXpert assay. The results were divided into 6 levels according to the signal of presence or absence of MTB and the presence or absence of rifampicin resistance. In this study, the patients were distributed into 8 age groups. The ages ranged from 4 years to more than 85 years. The results revealed the highest percentage of patients was recorded in the age group 25-34 where the percentage was 28%, followed by the age group 15-24 at 21%, then the age group 45-54 at 19%, and the two age groups 35-44 and 54-64 were equal and by 10%, whereas the two categories 5-14 and 0-4 had the lowest rates of 3% and 1%, respectively. In this study, the rate of infection in males was 51% compared to 49% in females. 43 culture-positive patients and 30 healthy controls were investigated for single-nucleotide polymorphisms of TLR4 and IL28B genes. Genomic DNA was extracted from peripheral blood of all of them and amplified the target DNA by PCR by using a specific primer specially designed for this study. The two single nucleotide polymorphisms of the TLR4 gene (rs1927911 and rs10759930) were found in MTB patients and healthy controls, with three genotypes (CC, CT, and TT for rs1927911 and TT, TC, and CC for rs10759930). While the two single nucleotide polymorphisms of the IL28B gene (rs12979860 and rs8099917) are presented with three genotypes (TT, TC, and CC for rs12979860 and TT, TG, and GG for rs8099917) in MTB patients and healthy controls. In this study, the result revealed patients who were homozygous for allele T had a significantly higher risk for development of pulmonary TB, with an odds ratio of 12.923 (95% confidence interval, 2.1621 to 32.9812) p value=0.0221 and patients who were heterozygous for allele T had a significantly higher risk for development of pulmonary TB, with an odds ratio of 4.4423 (95% confidence interval, 1.4449 to 115.5796) p value=0.0060. So the result of the TLR4 gene C

Benzer Tezler

  1. Tez No

    695686

    Dejeneratif disk hastalığının oluşumunda TLR4/TRAM, NF-kB ve MyD88 bağımsız yolağın rolü

    The role of TLR4/TRAM, NF-kB and MyD88 independent pathway in degenerative disc disease

    ORKHAN ALIZADA

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Nöroşirürjiİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATMA ÖZLEN

  2. Tez No

    440330

    Broyler civcivlerin dalağında TLR4 ve MHC II moleküllerinin dağılımının araştırılması

    Investigation of the distribution of MHC II molecules and TLR4 in spleen of broiler chicks

    EBRU AKA

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Histoloji ve EmbriyolojiAdnan Menderes Üniversitesi

    Histoloji ve Embriyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜLKER EREN

  3. Tez No

    836220

    Bir flavonoid olarak rutinin TLR4/TRIF/IRF3 sinyal yolu aktivasyonundaki rolünün hormon duyarlı meme kanseri hücrelerinde belirlenmesi

    Determination of the role of routine as a flavonoid in TLR4/TRİF/İRF3 signal path activation on hormone-sensitive breast cancer cells

    NUR KAZAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Moleküler TıpSakarya Üniversitesi

    Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ASUMAN DEVECİ ÖZKAN

  4. Tez No

    688241

    Pankreas kanserinde Toll-like reseptör 4 (TLR4) yolağının immün check-point VISTA üzerindeki etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of Toll-like receptor 4 (TLR4) pathway on immune check-point VISTA in pancreatic cancer

    KÜBRA SENA BAŞ TOPCU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    OnkolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE NEDİME KORUCU

  5. Tez No

    694206

    Gestasyonel diyabetli ve normal gebelerden izole edilen umbilikal arterlerde anjiyotensin II ve TLR4 ilişkisinin incelenmesi

    Investigation of the relationship between angiotensin II and TLR4 on umbilical arteries isolated from pregnants of normal and gestational diabetes

    ESRA BÜYÜK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Eczacılık ve FarmakolojiNecmettin Erbakan Üniversitesi

    Tıbbi Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE SAİDE ŞAHİN

Geri Dön