Investigating the possible effects of ATG9a-SIK2 interaction on autophagy under er stress conditions
ATG9a-SIK2 etkileşiminin otofaji üzerindeki olası etkilerinin er stres koşulları altında araştırılması
- Tez No: 693690
- Danışmanlar: PROF. DR. FERRUH ÖZCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
Obezite kardiyovasküler hastalıklar, hipertansiyon, insülin direnci, tip 2 diyabet ve bazı kanserler türleride dahil olmak üzere birçok metabolik hastalıkla ilişkilendirilmektedir. Obeziteninin moleküler temelini anlamak, risk oluşturduğu bir çok metabolik ve nörodejeneratif hastalığın ve hatta ilişkili bazı kanser türleri için yeni tedavilerin geliştirilmesi adına büyük önem taşımaktadır. Obez bireylerin merkezi sistemi ve obez hayvan modelleri dahil olmak üzere, metainflamasyonun varlığı metabolik olarak aktif dokularda birçok çalışmada rapor edilmiştir. Şiddeti azalmayan ER stres koşulları altında, birbirine bağlı olan UPR ve otofaji mekanizmalarının inflamasyon yolakların başlatılmasını desteklediği düşünülmektedir. SIK2, AMPK ile ilgili kinaz ailesine ait bir serin/treonin kinazdır ve karaciğer glukoneogenezi, lipogenez ve ketogenez dahil olmak üzere ana metabolik yolakları düzenlemede ve hormonal ve hücresel stress koşullarına bağlı olarak protein homeostazı korumada önemli bir role sahiptir. SIK2, sırasıyla p97/VCP ve HDAC4'ü fosforileyerek ERAD ve otofajinin yukarı regülasyonunu gerçekleştirmektedir. ER stres yanıt yolları ERAD, UPR ve otofaji, protein homeostazını yeniden sağlamak için uyumlu bir şekilde hareket eder. Kronik ER stresin, insülin ve leptin direnci dahil olmak üzere çeşitli hücresel patolojilerin altında yattığı öne sürülmüştür. Öyleki MSS'nde kronik ER stress çözülemezse hücresel kayıplar ve obezite gelişimi gözlenebilir. ATG9A, membranla ilişkili tek otofaji proteinidir ve besin yokluğu ile indüklenen otofajide, erken otofagozom oluşumunda kritik bir rol oynamaktadır. Ayrıda, son zamanlarda, ATG9A için otofajiden bağımsız birçk fonksiyonel rolü rapor edilmiştir. Bu çalışmada, otofajinin tek membran protein ATG9a ile hemostatik stres kinaz proteini ve yukarı akış aktivatörü VCP/p97 (ERAD bileşeni) olan SIK2 arasındaki, muhtemelen otofaji ve ERAD arasındaki düzenleyici iletişimi sağlayabilen fiziksel etkileşimi tanımladık.
Özet (Çeviri)
Obesity is associated with various health problems including cardiovascular diseases, insulin resistance, type 2 diabetes, and some cancers. Despite massive global efforts, the molecular underpinnings of obesity and related metabolic diseases remain unknown. Low-grade inflammation has invariably been reported in these metabolically active tissues, including the CNS of obese individuals and animal models of obesity. Under persistent unmitigated ER stress conditions, two interconnected mechanisms, UPR and autophagy, appear to underpin the initiation of inflammatory pathways. SIK2 is a serine/threonine kinase that belongs to AMPK related kinase family and has crucial role in the regulation of major metabolic pathways including liver gluconeogenesis, lipogenesis, and ketogenesis in addition to protein homeostasis in response to hormonal induction and cellular stress conditions. SIK2 has been implicated in the upregulation of ERAD and autophagy by phosphorylating p97/VCP and HDAC4 respectively. UPR pathways, ERAD, and autophagy act in concert to restore protein homeostasis under ER stress conditions. Unresolved chronic ER stress has been proposed to underlie various cellular pathologies including insulin and leptin resistances both in peripheral tissues and CNS leading to the development of obesity. ATG9a the only membrane-associated autophagy protein plays critical roles in the early autophagosome formation upon starvation-induced autophagy. Recently an autophagy-independent physiological role for ATG9a has been proposed in several studies. Here in this study, we identified a physical interaction between the only membrane protein of autophagy ATG9a and the hemostatic stress kinase SIK2 an upstream activator ERAD component VCP/p97, which presumably mediates a regulatory crosstalk between autophagy and the ERAD.
Benzer Tezler
- Investigating the effects of man-portable launcher on the operator with the use of anthropomorphic test device
Kullanıcı ile direkt etkileşimi olan lançer sistemlerinin kullanıcıya etkilerinin insan benzeri test cihazı kullanılarak incelenmesi
TUNAY TÜRK
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Makine MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN AKKÖK
DOÇ. DR. VOLKAN ESAT
- Sıçanlarda sisplatin ile oluşturulan ovaryum hasarına sarımsağın organosülfür komponentlerinden S-Allil-L-Sistein ve Allil Disülfit'in etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of organosulfide components of garlic, S-Allyl-L-Cysteine and allyl disulfite, on cisplatin-induced ovarian damage in rats
HİLAL ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Histoloji ve EmbriyolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HALİME TUBA CANBAZ
- Investigating the effects of online teaching on teacher identity (re) construction: Towards a 'hybrid' teacher, a case study
Çevrimiçi öğretimin öğretmen kimliği (yeniden) yapılandırılması üzerindeki etkilerinin araştırılması: 'Hibrit' öğretmene doğru, bir durum çalışması
ASLI BAYRAM
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
Eğitim ve ÖğretimMaltepe ÜniversitesiYabancı Diller Eğitimi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜRKAN DOĞAN
- Melatoninin biber tohumlarının yaşlanması üzerine etkilerinin incelenmesi
Investigating the effects of melatonin on the ageing process of pepper seeds
ŞEBNEM KÖKLÜ
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
FizyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHMET KORKMAZ
- Portfolio assessment versus traditional assessment techniques: A case study on the proficiency development and classroom practices of efl students in a Turkish military high school
Portföy değerlendirmesi ile geleneksel değerlendirme tekniklerinin karşılaştırılması: Bir Türk askeri lisesi'nde yabancı dil olarak öğrenen İngilizce öğrencilerin genel dil becerilerindeki gelişme ve sınıf uygulamaları hakkında örnek bir durum çal
MUSTAFA SAĞLAM
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Eğitim ve ÖğretimBoğaziçi Üniversitesiİngiliz Dili Eğitimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YASEMİN BAYYURT