Geri Dön

İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda mikroRNA, CCN2 ve TGF-β ekspresyon düzeylerinin değerlendirilmesi

Evaluation of microrna, CCN2 and TGF-β expression levels in patients with idiopathic pulmonary fibrosis

PDF İndir

  1. Tez No: 694244
  2. Yazar: KÜBRA METLİ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MAHMUT SELMAN YILDIRIM, DOÇ. DR. AYŞE GÜL ZAMANİ
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genetik, Göğüs Hastalıkları, Genetics, Chest Diseases
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Necmettin Erbakan Üniversitesi
  10. Enstitü: Meram Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 154

Özet

Amaç: MiRNA'lar biyolojik süreçlerde ve İPF gibi fibrotik hastalıklarda rol alan küçük RNA molekülleridir. Son yıllarda yapılan çalışmalar; vücut sıvılarında tespit edilebileceğini, hastalıkların tanı ve takiplerinde belirteç olarak kullanılabileceğini göstermektedir. Bu projede amaç; İPF hastalarında fibrotik süreçten sorumlu olabilecek CCN2 ve TGF-β genlerinin ve 21 miRNA'nın ekspresyon düzeylerinin periferik kanda qPCR yöntemiyle değerlendirilmesidir. Yöntem: Göğüs hastalıkları ana bilim dalı multidisipliner interstisyel akciğer hastalıkları konseyinde değerlendirilmiş ve İPF tanısı almış 20 kişilik hasta grubu ile 20 sağlıklı gönüllüden alınan periferik kan örneklerinde qPCR ile CCN2, TGF-β ve miRNA ekspresyon analizleri yapıldı. Bulgular: CCN2, TGF-β genlerinin ve miR'lerin ekspresyon düzeyleri belirlenerek hasta ve kontrol grubu arasındaki fark istatistiksel yöntemler ile incelendi. TGF-β, miR-29a/29b/29c-3p, miR-19a, miR-130a-3p, miR-140-5p, miR-320a, miR-155-5p, miR-21-5p, miR-205-5p ekspresyonları hasta grubunda downregüle bulundu, miR-143-3p ekspresyonu ise upregüle bulundu. CCN2, miR-145, miR-30a/30b/30d/30e-5p, miR-26a-5p, miR-32-5p, miR-19b-1, miR-133 ve let-7d gruplar arasında ekspresyon farkı göstermedi. Hastalarda miR-29a-3p ve miR-140-5p'nin sigara kullanımı ile; miR-155-5p, miR-140-5p ve miR-320a'nın cinsiyete göre ekspresyon farkı sergilediği saptandı. miR-29a ve miR-143 ile lojistik regresyon modeli oluşturuldu, ROC analizi ile miR-29a ve miR-143'ün hasta ve kontrol grubunu ayırt etme gücü istatistiksel olarak yüksek bulundu. Sonuç: Çalışmamızda, gen ve miRNA disregülasyonunun İPF hasta serumlarında RT-qPCR gibi kolay ve rutin bir yöntemle tespit edilebileceği gösterilmiş; tanı, takip ve ilaç yanıtı değerlendirmede kullanımının mümkün olabileceği tartışılmıştır. Literatüre katkı sağlayacak yeni bulgular tespit edilmiş olup, bu bulgular ışığında yapılacak yeni çalışmalara yön verecektir.

Özet (Çeviri)

Background/Aim: MiRNA's are small RNA molecules that participate many biological processes and fibrotic diseases like IPF. Studies carried out in recent years; shows that it can be detected in body fluids and can be used as a marker in the diagnosis and follow-up of diseases. Aim in this project is evaluation of expression levels of CCN2 and TGF-β genes and 21 miRNA's that can be responsible for the fibrotic process of IPF, using RT-qPCR in peripheral blood samples. Methods: CCN2, TGF-β and miRNA expression levels were analyzed using qPCR in peripheral blood samples of 20 patients and 20 healthy volunteers. All of the patients were diagnosed of IPF in the multidiciplinary interstitial pulmonary diseases counsil of the chest diseases department. Result: Any alteration of the expression levels of CCN2, TGF-β genes and miRNA's were statistically analyzed. It is revealed that; TGF-β, miR-29a/b/c-3p, miR-19a, miR-130a-3p, miR-140-5p, miR-320a, miR-155-5p, miR-21-5p, miR-205-5p expression levels were downregulated in the patients; in contrast to miR-143-3p expression, which was upregulated. CCN2, miR-145, miR-30a/b/d/e-5p, miR-26a-5p, miR-32-5p, miR-19b-1, miR-133 and let-7d showed no statistically significant difference between patient and control groups. It was demonstrated; miR-29a and miR-140 expressions were altered due to whether the patient was a smoker, while miR-155, miR-140 and miR-320a expressions showed gender differences. Logistical regression model with miR-29a and miR-143 expression profiles were created. It was demonstrated that; strength of differentiating case and control groups were statistically higher in miR-29a and miR-143, with ROC analysis. Conclusion: In this study; we demonstrated that, gene and miRNA dysregulations in blood samples of IPF patients could easily be detected by routinely used RT-qPCR method. The potentiality of them being used in diagnosis, follow-up and drug responsiveness was discussed. Our project will contribute to the literature with new findings and guide the other invetigators in this field.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    679916

    İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda kor stabilizasyon egzersizleri ve nöromusküler elektrik stimülasyonunun(NMES) etkinliği

    Efficacy of core stabilization exercises and neuromuscular electrical stimulation (NMES) in patients with idiopathic pulmonary fibrosis

    FERİDE ELÇİN ÇAKIR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Fizyoterapi ve Rehabilitasyonİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Kardiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. RENGİN DEMİR

  2. Tez No

    453951

    İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda serum periostin düzeyi ile solunum fonksiyon testleri, 6 dakika yürüme testi ve yaşam kalitesi arasındaki ilişkinin değerlendirilmesi

    The relationship between serum periostin levels and pulmonary function tests, six minute walk test, quality of life in idiopathic pulmonary fibrosis patients

    ÖZGE ASLANTEKİN EKEN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Göğüs HastalıklarıUludağ Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. NECMİYE FUNDA COŞKUN

  3. Tez No

    860015

    İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda kan hücre sayımı ve bunlardan elde edilen inflamasyon indekslerinin değerlendirilmesi

    İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda kan hücre sayimi ve bunlardan elde edilen inflamasyon indekslerinin değerlendirilmesi

    DAMLA AY

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Göğüs HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ŞEYMA BAŞLILAR

  4. Tez No

    729793

    İdiyopatik pulmoner fibrozisli hastalarda pulmoner hipertansiyona gidişi saptamada copeptin proteinin etkinliliği

    Effectiveness of copeptin protein in detecting pulmonary hypertension in patients with idiopaticpulmonary fibrosis

    AHMET YURTTAŞ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    Göğüs HastalıklarıBursa Uludağ Üniversitesi

    Göğüs Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET URSAVAŞ

  5. Tez No

    487146

    İdiyopatik pulmoner fibrozis tanısı olan hastalarda sürekli veya aralıklı bisiklet ergometrisi ile uygulanan pulmoner rehabilitasyonun etkinliği

    Efficacy of pulmonary rehabilitation performed with interval or continuous cycle ergometer training in patients diagnosed as idiopathic pulmonary fibrosis disease

    EZGİ ŞAŞMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonPamukkale Üniversitesi

    Fiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HAKAN ALKAN

Geri Dön