Geri Dön

Burdur ili çiğ süt örneklerinden bazı gram negatif bakterilerin izolasyonu, MALDI-TOF MS ile tanımlanması ve bazı virulans özelliklerin belirlenmesi

Isolation of gram negative bacteria from raw milk samples in Burdur province, identification by MALDI-TOF MS and determination of some virulence characteristics

PDF İndir

  1. Tez No: 696578
  2. Yazar: HACER KAÇAR
  3. Danışmanlar: PROF. DR. GÜLDEN BAŞYİĞİT KILIÇ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Gıda Mühendisliği, Food Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Burdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 123

Özet

Burdur ili ve ilçelerinden toplanmış olan süt örneklerinden CHROMagar™ ESBL besiyerinden 33 adet Gram negatif bakteri izole edilmiştir ve MALDI TOF-MS ile 15 adet Stenotrophomanos maltophilia, 5'er adet Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, 3 adet Klebsiella oxytoca, 2 adet Chryseobacterium gleum ve 1'er adet Enterobacter claocoe, Hafnia alvei, Acinetobacter baumannii tanımlanmıştır. Disk difüzyon yönteminde tüm antibiyotikler genel olarak değerlendirildiğinde en duyarlı suşun H. alvei YH102A olduğu belirlenmiştir. H. alvei YH102A suşu seftazidim (30 µg), sefpodaksim (10 µg), sefotaksim (30 µg), sefepim (30 µg) ve sefepim (5 µg) antibiyotiklerine duyarlı bulunmuştur. VITEK® 2 Compact sistemi ile en fazla direnç seftiofur antibiyotiğinde, en fazla duyarlılık ise trimetoprim/SMZ antibiyotiğinde tespit edilmiştir. Çalışmamızda E. coli YH131A suşunun en yüksek antibiyotik direnç profiline sahip olduğu, çalışmada kullanılan 16 antibiyotiğin 13'üne dirençli iken, sadece amoksisilin/klavulanik asit, tikarsilin/klavulanik asit ve imipenem antibiyotiklerine duyarlı olduğu belirlenmiştir. Virulans özelliklerin belirlenmesi amacıyla yapılan analizler sonucunda incelenen tüm suşlarda DNAz aktivitesi belirlenmemiştir. S. maltophilia (YH6A, YH100, YH101, YH103, YH129D), E. coli (YH131A, YH140B), C. gleum YH67B ve A. boumannii YH138B suşlarının jelatinaz üretimi pozitif bulunmuştur. Suşlarda histidin, ornitin ve lisin aminoasitlerinde dekarboksilaz aktivite belirlenmezken, suşların en fazla triptofan aminoasidini dekarboksile ettiği belirlenmiştir. P. aeruginosa (YH27C, YH152B, YH138A, YH148A), S. maltophilia (YH101, YH103, YH113, YH135B) ve E. cloacae YH27A suşları beta hemoliz, S. maltophilia YH64 suşu ise alfa hemoliz özellik göstermiştir. S. maltophilia (YH12A, YH94A, YH97B, YH99, YH129D), E. coli (YH126A, YH131A), K. oxytoca YH98B, H. alvei YH102A zayıf alfa hemoliz gösterirken diğer suşlarda hemoliz oluşmamıştır. S. maltophilia YH6A ve P. aeruginosa YH27C suşlarının 0,64 değeri ile güçlü biyofilm üreticisi olduğu, diğer suşların ise 0,15 ile 0,38 arasında zayıf biyofilm üreticisi oldukları tespit edilmiştir. Ekstraselüler proteaz üretimi deneyinde; 17 suşun kazein, süt ve skim milk agarda zon oluşturduğu, her üç besiyerinde de zon oluşturmayan tek suşun E. coli YH140B olduğu belirlenmiştir.

Özet (Çeviri)

33 Gram-negative bacteria were isolated from CHROMagar™ ESBL broth from milk samples collected from Burdur province and its districts. Out of 33 bacteria, 15 Stenotrophomanos maltophilia, 5 Pseudomonas aeruginosa, 5 Escherichia coli, 3 Klebsiella oxytoca, 2 Chryseobacterium gleum, 1 Enterobacter claocoe 1 Hafnia alvei and Acinetobacter baumannii were identified by MALDI TOF-MS. When all antibiotics were evaluated in the disk diffusion method, it was determined that the most sensitive strain was H. alvei YH102A. H. alvei YH102A strain was found to be sensitive to ceftazidime (30 µg), cefpodaxime (10 µg), cefotaxime (30 µg), cefepime (30 µg) and cefepime (5 µg) antibiotics. With the VITEK® 2 Compact system, the highest resistance was detected in the ceftiofur antibiotic, and the highest sensitivity was detected in the trimethoprim/SMZ antibiotic. In our study, it was determined that E. coli YH131A strain had the highest antibiotic resistance profile, while it was resistant to 13 of the 16 antibiotics used in the study, it was sensitive only to amoxicillin/calvulanic acid, ticarcillin/clavulanic acid and imipenem antibiotics. As a result of the analysis carried out to determine virulence characteristics, DNAse activity was not determined in all strains examined. S. maltophilia (YH6A, YH100, YH101, YH103, YH129D), E. coli (YH131A, YH140B), C. gleum YH67B and A. baumannii YH138B strains were found to be positive for gelatinase production. While decarboxylase activity was not determined in histidine, ornithine and lysine amino acids of the strains, the most decarboxylated amino acid by the strains was determined as tryptophan. P. aeruginosa (YH27C, YH152B, YH138A, YH148A), S. maltophilia (YH101, YH103, YH113, YH135B) and E. cloacae YH27A strains showed beta hemolysis. Eventhough S. maltophilia YH64 strain showed alpha hemolysis. S. maltophilia (YH12A, YH94A, YH97B, YH99, YH129D), E. coli (YH126A, YH131A), K. oxytoca YH98B, H. alvei YH102A showed weak alpha hemolysis, other strains did not show hemolysis. S. maltophilia YH6A and P. aeruginosa YH27C strains were found to be strong biofilm producers with a value of 0.64, while other strains were found to be weak biofilm producers between 0.15 and 0.38. In the experiment of extracellular protease production; It was determined that 17 strains formed a zone in casein, milk and skim milk agar, and E. coli YH140B was the only strain that did not form a zone in all three media.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    372879

    Ankara ve Burdur ili çiğ süt örneklerinden izole edilen laktik asit bakterileri ve p-NO2 ve o-NO2 formazanların bu bakteriler üzerine inhibitör etkisi

    Lactic acid bacteria isolated from raw milk collected from Ankara and Burdur province and inhibitory effect of p-NO2 and o-NO2 formazans on these bacteria

    MİTRA ESMAEİLİ PARDOUL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiGazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜVEN URAZ

  2. Tez No

    436791

    Ortaokul sosyal bilgiler programında yer alan doğal afetler konularına yönelik öğrencilerin, farkındalık, bilinç düzeyleri ve görüşlerinin incelenmesi (Burdur ili örneği)

    The observation of views and the consciousness level of students towards natural disasters which take place in secondary school social studies curriculum (The example of Burdur city)

    MEHMET URSAVAŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    CoğrafyaMehmet Akif Ersoy Üniversitesi

    İlköğretim Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YILDIRIM ATAYETER

  3. Tez No

    85248

    Burdur ili sığırcılığı işletmelerinde sürü yönetiminin verimliliğe etkisi

    The Influence of herd management on productivity in Burdur milk cattle farms

    ŞULE DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    ZiraatAkdeniz Üniversitesi

    Zootekni Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİM MUTAF

  4. Tez No

    770523

    İhracat sürecinde karşılaşılan sorunlar: Burdur ili Bucak ilçesi örneği

    Problems encountered in the export process: The case of Bucak district of Burdur province

    ALİ OSMAN ÖZEKİNCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    İşletmeBurdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi

    Gümrük İşletme Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ ÖZHAN AKYÜZ

  5. Tez No

    795654

    Yalakasar antik yerleşimi

    The ancient settlement of Yalakasar

    MEHMET TEKİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    ArkeolojiSüleyman Demirel Üniversitesi

    Arkeoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. FİKRET ÖZCAN

Geri Dön