Geri Dön

Determination of IDH 1, IDH2, MGMT, TERT, ATRX and H3F3A gene mutations in glial tumors

Glial tümörlerde IDH 1, IDH2, NGMT, tert, ATRX ve H3F3A gen mutasyonlarının belirlenmesı

PDF İndir

  1. Tez No: 701805
  2. Yazar: CUMHUR KAAN YALTIRIK
  3. Danışmanlar: PROF. DR. TURGAY İSBİR
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Moleküler Tıp, Nöroşirürji, Molecular Medicine, Neurosurgery
  6. Anahtar Kelimeler: Next Generation Sequencing, Glioblastoma, Molecular Biology, IDH1/2, MGMT, TERT, ATRX, Next Generation Sequencing, Glioblastoma, Molecular Biology, IDH1/2, MGMT, TERT, ATRX
  7. Yıl: 2021
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Yeditepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 81

Özet

AMAÇ: Glial tümörler tüm malign beyin tümörlerinin neredeyse yarısını oluşturur En popüler ve tehlikeli primer beyin tümörü türü Glioblastoma Multiforme'dir (GBM). Gbm'nin hayatta kalma oranları çok kısadır ve moleküler belirteçlerle tahmin edilebilir. Çalışmamızın amacı, potansiyel patolojik mutasyonları ve sağkalım üzerindeki etkilerini bulmak için IDH1, IDH2, TERT, MGMT ve ATRX genlerini yeni nesil dizileme ile değerlendirmektir. GEREÇ VE YÖNTEM: Bu çalışma için kraniyotomi yapılan ve yüksek dereceli glioma tanısı alan otuz hasta değerlendirildi. Tüm katılımcılardan periferik kan örnekleri alındı. Örneklerden yeni nesil dizileme ile IDH1, IDH2, TERT, MGMT ve ATRX genleri değerlendirildi. Tüm bu mutasyonların sağkalım üzerindeki etkilerini değerlendirmek için SPSS ile sağkalım analizi yapıldı. BULGULAR: Hastaların ortanca yaşı 58.5 (11-74), %56.7'si (n=17) 60 yaşın altındaydı. Cinsiyete göre erkek hasta oranı %66.7, kadın hasta oranı %33.3 idi. Hastaların yüzde sekseninde IDH, % 83.3 MGMT ve% 70'inde EGFR pozitifliği vardı. Hastalar üzerinde hedeflenen gen dizilimi yapıldıktan sonra 21 mutasyon tespit edildi. Bu mutasyonların üçü IDH 1'de, 2'si IDH2'de, 6'sı TERT'de, 7'si MGMT'de ve 3'ü ATRX'te bulundu. Kadın cinsiyet durumu referans olarak alındığında, kadın cinsiyet durumunun genel sağkalımı 4.63 kat, üçten fazla kromozom anomalisi referans olarak kabul edildiğinde, mevcut verilerden üç veya daha az kromozomdaki anomalinin genel sağkalımı 2.83 kat olumsuz etkilediği belirlenmiştir. BULGULAR: Hedeflenen NGS, hem doğru hem de terapötik olarak anlamlı olan glial tümör kategorizasyonunu mümkün kılarak konvansiyonel histolojiye göre daha iyi prognostik bilgi sağlar. Klinik uygulamada bunun nasıl yapılması gerektiği hala tartışmaya açık olmasına rağmen, bu kanserlerin moleküler belirteçler kullanılarak yeniden sınıflandırılması gerektiğini gösteren kanıtlar vardır. Bununla birlikte, moleküler teşhisin standart bakım rutinimize dahil edilmesinin hastalarımızın sonuçlarını daha iyi anlamamıza yardımcı olacağı açıktır.

Özet (Çeviri)

OBJECTIVE: Glial tumors make up almost half of all malignant brain tumors. The most popular and dangerous kind of primary brain tumor is Glioblastoma Multiforme(GBM). The survival rates of GBM are very short and it could be predictable with molecular markers. The aim of our study is to evaluate IDH1, IDH2, TERT, MGMT and ATRX genes with next-generation sequencing to find potential pathological mutations and their effect on survival. MATERIALS AND METHODS: Thirty patients who had a craniotomy and diagnosed with high-grade glioma were evaluated for this study. Peripheral blood samples were obtained from all participants. IDH1, IDH2, TERT, MGMT and ATRX genes were evaluated with next-generation sequencing from the samples. To evaluate the effects of all these mutations on survival we made survival analysis by SPSS. RESULTS: The median age of the patients was 58.5 (11-74), and 56.7% (n=17) were under 60 years of age. According to gender, the rate of male patients was 66.7% and the rate of female patients was 33.3%. Eighty percent of the patients had IDH, 83.3% MGMT, and 70% had EGFR positivity. After the targeted gene sequencing performed on the patients, 21 mutations were detected. Three of these mutations were found in IDH 1, 2 in IDH2, 6 in TERT, 7 in MGMT, and 3 in ATRX. When female gender status was taken as reference, the overall survival of female gender status was 4.63 times, and when more than three chromosome anomaly was accepted as a reference, it was determined from the available data that anomaly in three or less chromosomes negatively affected overall survival 2.83 times. CONCLUSIONS: Targeted NGS enables glial tumor categorization that is both accurate and therapeutically meaningful, providing better prognostic information than conventional histology. There is evidence to suggest that these cancers should be reclassified using molecular markers, although how this should be done in clinical practice is still up for debate. However, it's obvious that incorporating molecular diagnostics into our standard-of-care routine will help us better understand our patients' outcomes.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    846332

    Glial Tümörlerde DNA Metilasyon Analizi ve Genetik Varyasyonların Belirlenmesi

    DNA Methylation Analysis and Determination of Genetic Variations in Glial Tumors

    ELİF NUR BOZDAĞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Genetikİstanbul Üniversitesi

    Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SEMA SIRMA EKMEKCİ

  2. Tez No

    158200

    Quercus aucheri Jaub ve Spach (FAGACEAE) bitkisinin polifenolik bileşikleri üzerinde farmakognozik araştırmalar

    Pharmacognostical investigations on the polyphenolic compounds of Quercus aucheri Jaub and Spach (FAGACEAE)

    DİDEM ŞÖHRETOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    Eczacılık ve FarmakolojiHacettepe Üniversitesi

    Farmakognozi Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. KORAY SAKAR

  3. Tez No

    68436

    Amplification and isolation of a fragment of lactate dehydrogenase gene from rhizopus orgzae using RT_PCR

    RT-PCR metodu kullanılarak rhizopus orgzae'dan lactat dehidrogenaz geninin bir parçasının amplifikasyonu ve izolasyonu

    ERDOĞAN EŞREF HAKKI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    1997

    Bilim ve TeknolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MAHİNUR S. AKKAYA

  4. Tez No

    794234

    Glial tümörlerde morbidite ve mortaliteyi etkileyen faktörler ve klinik sonuçlarımızın yeni Dünya Sağlık Örgütü sınıflaması çerçevesinde retrospektif değerlendirilmesi

    Retrospective evaluation of the factors affecting morbidity and mortality in glial tumors and our clinical results within the framework of the new World Health Organization classification.

    BERKAY AYHAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    NöroşirürjiSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Beyin ve Sinir Cerrahisi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYHAN TEKİNER

  5. Tez No

    666189

    Tam otomatik izositrat dehidrogenaz enzim aktivitesi ölçüm kitinin geliştirilmesi ve izositrat dehidrogenaz enziminin rekombinant üretimi

    Development of fully automated isocitrate dehydrogenase enzyme activity assay kit and recombinant production of isocitrate dehidrogenase enzyme

    FATMANUR KÖKTAŞOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyokimyaBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Tıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞAHBETTİN SELEK

    PROF. DR. FAHRİ AKBAŞ

Geri Dön