Diffüz büyük B hücreli lenfoma hastalarında PD-1 ve CTLA-4 gen varyasyonları ile ekspresyon seviyelerinin ilişkisi
The relationship between PD-1 and CTLA-4 gene variations and expression levels in patients with diffuse large B cell lymphoma
- Tez No: 702248
- Danışmanlar: PROF. DR. FAHRİ UÇAR
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Genetik, Tıbbi Biyoloji, Genetics, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2021
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Akdeniz Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 133
Özet
Amaç: Diffüz Büyük B Hücreli Lenfoma (DBBHL) klinik, morfolojik ve sitogenetik özellikler bakımından heterojendir. Non-Hodgkin lenfomaların en sık karşılaşılan agresif seyirli tipidir. Lenfomanın tedavi stratejilerinden biri olan immünoterapi, immün kontrol noktası inhibitörlerini hedef alır. Birçok hastalıklara ilişkin PD-1, PD-L1, CTLA-4 ve CD80 genlerinin araştırılması fenomen haline gelmiştir. Bu tezin amaçları DBBHL'de i) çeşitli kanser türleriyle önemli ilişkileri olan bu dört genin polimorfizmleri incelemek, ii) gözlenen genetik varyantların mRNA ekspreyon ve protein seviyeleriyle korelasyonunu değerlendirmek, iii) bulgular doğrultusunda hastalığın patogenezine katkıda bulunmaktır. Yöntem: Bu araştırmada, 20 kişilik hasta grubuyla aynı yaş ve cinsiyette olan 20 kişilik kontrol gruplarına ait periferik kan örneklerinden DNA dizileme yöntemi kullanılarak PD-1, PD-L1, CTLA-4 ve CD80 genlerindeki ilgilenilen polimorfizmler saptandı. Gerçek Zamanlı Kantitatif PZR yöntemi kullanılarak hedef genlerin ifade seviyeleri belirlendi. Akış Sitometri yöntemiyle hedef hücrelerin ekspresyon (%) düzeyleri değerlendirildi. Verilerin değerlendirilmesinde IBM SPSS Statistics for Windows Version 22 ve R.3.3.2 yazılımlarından yararlanıldı. Bulgular: Hastalarda PD-1, PD-L1 ve CTLA-4 ekspresyon seviyesi, kontrol grubuna göre daha yüksekti. PD-1 (rs2227981), PD-L1 (rs4143815) ve CTLA-4 (rs231775) polimorfizmleri, bu genlerin ekspresyon seviyeleriyle ilişkili olabilir. Akış Sitometri sonuçlarına göre hastalarda kontrol grubuna kıyasla sadece CD4+PD-1+ ve CD4+PD-L1+ hücre ekspresyon (%) düzeyleri anlamlı bulundu. Sonuç: DBBHL'de PD-1, PD-L1 ve CTLA-4 gen polimorfizmleri ve buna bağlı PD-1, PD-L1 ve CTLA-4 ifadelerinin tespiti önemlidir. Elde ettiğimiz bulgular ışığında, bu genlerin DBBHL patogenezinin ve prognozunun anlaşılmasına katkı sağlayabileceğine inanmaktayız.
Özet (Çeviri)
Objective: Diffuse Large B Cell Lymphoma (DLBCL) is heterogeneous in terms of clinical, morphological and cytogenetic features. DLBCL is the most common type of non-Hodgkin lymphoma with an aggressive course. As one of the treatment strategies for lymphoma, immunotherapy targets immune checkpoint inhibitors. The recent scholarship popularized the investigation of correlation of PD-1, PD-L1, CTLA-4 and CD80 genes to many diseases. Thus, the aims of this dissertation are i) examining the polymorphisms of these four genes that evidently are significant in relation to various cancer types, ii) evaluating the correlation of observed genetic variants with mRNA expression and protein levels, iii) contributing the pathogenesis of DLBCL. Methods: In the present research, the DNA sequencing method from peripheral blood samples of 20 patients were used to determine polymorphisms of PD-1, PD-L1, CTLA-4 and CD80 genes, a control group of 20 from the same age and gender as the samples was also considered. Expression levels of target genes were determined using the Real Time Quantitative PCR method. Expression (%) levels of target cells were then evaluated by flow cytometry method. IBM SPSS Statistics for Windows Version 22 and R.3.3.2 software were used to evaluate the obtained data. Results: It is observed that PD-1, PD-L1 and CTLA-4 expression levels were higher in the patients compared to the control group. The PD-1 (rs2227981), PD-L1 (rs4143815) and CTLA-4 (rs231775) polymorphisms can be associated with these gene expression levels. According to the Flow Cytometry results, only CD4+PD-1+ and CD4+PD-L1+ cell expression levels (%) were significant compared to the control group. Conclusion: It is important to detect PD-1, PD-L1 and CTLA-4 gene polymorphisms and related PD-1, PD-L1 and CTLA-4 expressions in DLBCL. In the light of our findings, we believe that these genes may contribute to the understanding of DLBCL pathogenesis and prognosis.
Benzer Tezler
- Nodal diffüz büyük B hücreli lenfoma, NOS''larda mikroçevre ve kontrol noktası blokajı ilişkili moleküllerin (PD-1, PD-l1, CTLA-4, CD163 ve CD14) prognoza etkisi
The prognostic impact of tumor microenvironment and checkpoint blockade-associated molecules (PD-1, PD-L1, CTLA-4, CD163 AND CD14) in nodal diffuse large B cell lymphoma, NOS
ÖMER ATMIŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
PatolojiManisa Celal Bayar ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NALAN NEŞE
- Difüz büyük B hücreli lenfoma hastalarında tedavi öncesi PET-BT'de metabolik tümör volüm değerlendirmesinin prognoz açısından önemi
Prognostic value of metabolic tumor volume measured by pre-treatment PET-CT in patient with diffuse large B-cell lymphoma
TUĞBA USTA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Hematolojiİstanbul Medeniyet Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
ÖĞR. GÖR. ERMAN ÖZTÜRK
- Diffüz büyük B hücreli lenfoma ve kronik lenfositer lösemili hastalarda PD-1/PDL-1 ekspresyonlarının değerlendirilmesi
Evaluation of PD-1/PDL-1 expressions in patients with different large B cell lymphoma and chronic lymphositer leukemia
ÇİĞDEM AKKUŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
İç HastalıklarıVan Yüzüncü Yıl Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNAN DEMİRCİOĞLU
- Diffüz büyük B hücreli lenfomalarda PD-l1 ekspresyonunun prognozla ilişkisi
The relationship between PD-l1 expression and prognosis in diffuse large B-cell lymphomas
SELÇUK CİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
Patolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaPatoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SUAT HİLAL AKİ
- Diffüz büyük B hücreli lenfoma hastalarında IPI,R-IPI VE NCCN-IPI skorlama sistemlerinin prognoz üzerine etkisi
The effects of IPI,R-IPI and NCCN-IPI scoring systems on prognosis in DLBCL patients
EDA ULUSOY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
HematolojiKaradeniz Teknik Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NERGİZ ERKUT