Kan kültürlerinde üreyen biyofilm oluşturan ve oluşturmayan klebsiella pneumoniae izolatlarında in-vitro antimikrobiyal etkileşimlerin gösterilmesi
Demonstration of in-vitro antimicrobial interactions in klebsiella pneumoniae isolates that produce and do not produce biofilms grown in blood cultures
- Tez No: 707600
- Danışmanlar: DOÇ. DR. TUBA MÜDERRİS
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İzmir Katip Çelebi Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 124
Özet
Giriş ve Amaç: Klebsiella pneumoniae gelişmiş ve gelişmekte olan ülkelerde kan dolaşımı enfeksiyonlarına en sık neden olan bakterilerdendir. Özellikle bağışıklığı baskılanmış hastalarda hastane kaynaklı enfeksiyonda majör bir patojendir. K. pneumoniae bakteriyemisi, tıp alanındaki ve sağlık hizmetindeki tüm gelişmelere rağmen yüksek morbidite ve mortalite oranına sahiptir. Ek olarak biyofilm yapısının da antimikrobiyal dirençte etkili olabileceği bilinmektedir. Çok ilaca dirençli K. pneumoniae için tedavi seçenekleri oldukça kısıtlıdır bu nedenle kombine antimikrobiyal tedavilerine gereksinim duyulmaktadır. Bu çalışmada biyofilm yapan veya yapmayan izolatlarda, ayrıca biyofilm yapan izolatlarda biyofilm öncesi ve sonrası dönemlerde çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının in-vitro etkileşimlerinin gösterilmesiyle yeni tedavi protokollerinin oluşturulmasına katkı sağlanması amaçlanmıştır. Gereç ve Yöntem: Bu çalışma, 01.01.2019 - 31.12.2020 tarihleri arasında İKÇÜ Tıp Fakültesi Atatürk Eğitim ve Araştırma Hastanesi, Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gelen kan kültürlerinde üreyen kolistine dirençli olduğu saptanmış, 15 biyofilm oluşturan ve 15 biyofilm oluşturmayan K. pneumoniae izolatında gerçekleştirilmiştir. Bu izolatlarda öncelikle antibiyotik duyarlılıkları belirlenmiş ve biyofilmli izolatlarda biyofilm oluşumu sonrası duyarlılıklar tekrar çalışılmıştır. Dama tahtası yöntemi ile üç antibiyotik kombinasyonu (kolistin-meropenem, kolistin-tigesiklin, kolistin-rifampisin) hem biyofilm oluşumu öncesi hem de biyofilm oluşumundan sonra çalışılarak in-vitro etkileşim varlığı araştırılmıştır. Bulgular: Çalışmamıza dahil edilen 30 K. pneumoniae izolatından 15 (%50)'inin biyofilm üretimi için negatif olduğu, 8 (%26.7)'inin orta derecede biyofilm üreticisi ve 7 (%23.3) izolatın güçlü biyofilm üreticisi olduğu saptandı. Sıvı mikrodilüsyon çalışmalarına göre 30 izolatın tamamı (%100) kolistine dirençliydi. Meropenem için ise 27 izolatın (%90) dirençli, 3 izolatın (%10) ise artmış dozda duyarlı olduğu görüldü. K. pneumoniae'da tigesiklin ve rifampisin için sınır değerleri bulunmamaktadır. Biyofilmde sıvı mikrodilüsyon yöntemi ile belirlenen biyofilm inhibitör konsantrasyonu (BİK) değer aralıkları dört antibiyotik için de MİK değer aralıklarına göre yüksek bulundu. Dört antibiyotik için de BİK ile MİK değerleri arasında istatistiksel olarak anlamlı fark görüldü (p
Özet (Çeviri)
Introduction and Aim: Klebsiella pneumoniae is one of the most common bacteria causing bloodstream infections in developed and developing countries. It is a major pathogen in hospital-acquired infections, especially in immunocompromised patients. Despite all the advances in medicine and health care, K. pneumoniae bacteremia has a high morbidity and mortality rate. In addition, it is known that the biofilm structure may also be effective in antimicrobial resistance. Treatment options for multidrug-resistant K. pneumoniae are very limited, so combined antimicrobial therapies are needed. In this study, it is aimed to contribute to the creation of new treatment protocols by demonstrating the in-vitro interactions of various antibiotic combinations in biofilm-forming or non-biofilm-forming isolates, as well as in the pre- and post-biofilm periods. Material and Methods: This study was carried out on 15 biofilm-forming and 15 non-biofilm-forming K. pneumoniae isolates, which were found to be resistant to colistin grown in blood cultures from IKCU Faculty of Medicine Atatürk Training and Research Hospital Medical Microbiology Laboratory between 01.01.2019 - 31.12.2020. First of all, antibiotic susceptibilities of these isolates were determined and susceptibilities were re-studied after biofilm formation in isolates with biofilms. The presence of in-vitro interaction was investigated by studying the combination of three antibiotics (colistin-meropenem, colistin-tigecycline, colistin-rifampicin) with the checkerboard method both before and after biofilm formation. Results: It was determined that 15 (50%) of the 30 K. pneumoniae isolates included in our study were negative for biofilm production, 8 (26.7%) were moderate biofilm producers and 7 (23.3%) isolates were strong biofilm producers. According to the broth microdilution studies, all 30 isolates (100%) were resistant to colistin. For meropenem, 27 isolates (90%) were found to be resistant, and 3 isolates (10%) were found to be susceptible at increased doses. There are no breakpoints for tigecycline and rifampicin in K. pneumoniae. The biofilm inhibitor concentration (BIC) value ranges determined by the broth microdilution method in the biofilm were found to be higher than the MIC value ranges for all four antibiotics. There was a statistically significant difference between BIC and MIC values for all four antibiotics (p
Benzer Tezler
- Kan kültürü ve kateter kan kültürlerinden izole edilen candıda albıcans izolatlarında EFG-1 geni varlığının biyofilm üretimi üzerine etkisi ve ekspresyon düzeylerinin real-tıme pcr ile araştırılması
The effect of the presence of EFG-1 gene on biofilm production in candida albicans isolats isolated from blood culture and catheter blood cultures and investigation of expression levels by real-time pcr
MUHAMMET SAMET EMRE DAŞTAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. ASUMAN BİRİNCİ
- Kan kültürlerinde üreyen candida türlerinin tanımlanmasında ve antifungal duyarlılığının araştırılmasında standart yöntemler ile yeni yöntemlerin karşılaştırılması
Comparison of conventional methods and new methods in identification and antifungal susceptibility of Candida spp. from blood cultures
HAKAN ODABAŞI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASUMAN BİRİNCİ
- Kan kültürlerinde üreyen klebsıella pneumonıae suşlarında, karbapenemaz direncinin matriks destekli lazer desorpsiyon/ iyonizasyonu-uçuş zamanı kütle spektrometresi ile belirlenmesi
Determination of carbapenemase profiles of klebsiella pneumoniae isolated from blood cultures using matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry
ABDULLAH YÜCEL BABA
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
MikrobiyolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. METİN DOĞAN
- Kan kültürlerinde üreyen metisiline dirençli Staphylococcus aureusun multipleks polimeraz zincir tepkimesi yöntemiyle hızla tanısı
Rapid diagnosis of methicilin resistant S.aureus in blood cultures by using a multiplex PCR method
TUBA VİLKEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2005
MikrobiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ZEYNEP GÜLAY
- Kan kültürlerinde üreyen Acinetobacter baumannii'lerde kolistin direncinin çeşitli yöntemlerle araştırılması
Investigation of colistin resistance in Acinetobacter baumannii grown in blood cultures by various methods
AYŞE ŞERİFE CERAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÖKHAN AYGÜN