Kan kültürlerinden izole edilen enterokoklarda virülans genleri ve biyofilm varlığının araştırılması
Investigation of virulence resistance genes and biofilm presence in enterococci isolated from blood cultures
- Tez No: 930385
- Danışmanlar: PROF. DR. YASEMİN BAYRAM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 89
Özet
Enterokoklar, hem hastane hem de toplum kökenli enfeksiyonlarda önemli rol oynamaktadır. Virülans genleri ve biyofilm varlığı, hem antibiyotiklere karşı direnç kazanmalarını hem de konak dokulara yapışmalarını sağlayarak hastalıkların tedavisini zorlaştırmaktadır. Çalışmada, Van Yüzüncü Yıl Üniversitesi Dursun Odabaş Tıp Merkezinde takip edilen hastaların kan kültürü örneklerinden izole edilen Enterokok suşlarında virulans genleri ve biyofilm varlığı araştırılmıştır. Bu doğrultuda, Vankomisine dirençli 15 enterokok, vankomisine duyarlı 15 E. faecium ve vankomisine duyarlı 15 E. faecalis olmak üzere toplam 45 suş çalışmaya dâhil edilmiştir. Suşların identifikasyonu ve antibiyotik dirençlerinin belirlenmesi için Phoenix M50 (Becton Dickinson, ABD) otomatize sistemi kullanılmıştır. VanA ve VanB direnç genleri ile birlikte asa1, gelE, cylA, hyl, esp virulans genleri polimeraz zincir reaksiyonuyla araştırılmıştır. biyofilm üretim düzeylerinin araştırılması için mikroplak yöntemi kullanılmıştır. Vankomisine dirençli 15 enterokok suşunda VanA geni %86,7 oranında saptanırken VanB geni saptanmamıştır. Tüm izolatlarda, Hyl, esp, efaA, gelE, asa1 ve cylA genleri sırasıyla; 34 (%76), 25 (%56), 14 (%31), 10 (%22), 10 (%22), 3 (%7) suşta tespit edilmiştir. 15 VRE suşunda esp (11, %73) ve hyl (9, %60) genleri tespit edilmiştir. Vankomisine duyarlı E. faecium suşlarında en sık esp (11, %73) ve hyl (10, %67) genleri; vankomisine duyarlı E. faecalis suşlarında ise en sık hyl (15,%100), efaA (13,%87), gelE (10,%67) ve asa1 (10,%67) genleri tespit edilmiştir. Virulans genlerin bulundurma oranı E. faecium suşlarında 1,4 (42/30) olarak; E. faecalis suşlarında ise 3,7 (55/15) olarak tespit edilmiştir. Biyofilm varlığı için yapılan absorbans ölçümlerine göre toplam 45 suşun 16'sında (%35,5) zayıf derece (I) biyofilm, 25'inde (%55,5) orta derece (II) biyofilm ve 4'ünde (%8,8) güçlü derece (III) biyofilm üretimi saptandı. Tür düzeyinde; E. faecalis suşlarında güçlü derece (III) biyofilm varlığı tespit edildi. Güçlü derece (III) biyofilm üreten dört suşunda E.faecalis olduğu ve vankomisine duyarlı E. faecium suşlarının çoğunluğunun da (13, %87) zayıf derece (I) biyofilm oluşturduğu belirlenmiştir. Sonuç olarak; biyofilm üretimi ve virülans faktörlerinin E. faecalis izolatlarında daha yüksek bulunduğu ancak E. faecium türlerinin antibiyotiklere daha dirençli olduğu saptanmıştır. E. faecalis, antibiyotiklere direnci nisbeten az olsa da virülans genleri ve biyofilm oluşturma özellikleriyle kan dolaşımı enfeksiyonlarında E. faecium ile birlikte dikkat edilmesi gerekmektedir.
Özet (Çeviri)
Enterococci play an important role in both nosocomial and community-acquired infections. Virulence genes and the presence of biofilm make it difficult to treat diseases by enabling them to gain resistance to antibiotics and adhere to host tissues. In this study, virulence genes and biofilm presence were investigated in Enterococci strains isolated from blood culture samples of patients followed up in Van Yüzüncü Yıl University Dursun Odabaş Medical Center. Accordingly, a total of 45 strains including 15 vancomycin-resistant enterococci, 15 vancomycin-sensitive E. faecium and 15 vancomycin-sensitive E. faecalis were included in the study. Phoenix M50 (Becton Dickinson, USA) automated system was used for the identification and antibiotic resistance determination of the strains. VanA and VanB resistance genes and asa1, gelE, cylA, hyl, esp virulence genes were investigated by polymerase chain reaction. microplate method was used to investigate biofilm production levels. VanA gene was detected in 86.7% of 15 vancomycin-resistant enterococci isolates, while VanB gene was not detected. Hyl, esp, efaA, gelE, asa1 and cyl genes were detected in 34 (76%), 25 (56%), 14 (31%), 10 (22%), 10 (22%) and 3 (7%) isolates, respectively. In 15 VRE strains, esp (11, 73%) and hyl (9, 60%) genes were detected. In vancomycin-susceptible E. faecium strains, esp (11, 73%) and hyl (10, 67%) genes were detected most frequently; in vancomycin-susceptible E. faecalis strains, hyl (15, 100%) was detected most frequently. In conclusion, biofilm production and virulence factors were higher in E. faecalis isolates, but E. faecium species were more resistant to antibiotics. Although E. faecalis is relatively less resistant to antibiotics, it should be considered together with E. faecium in bloodstream infections due to its virulence genes and biofilm forming properties
Benzer Tezler
- Enterokoklarda yüksek düzey aminogıikozid direnci
Başlık çevirisi yok
GÖNÜL ÇİÇEK ŞENTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. PAŞA GÖKTAŞ
- Enterekokların identifikasyon yöntemleri antibiyotik duyarlılıkları ve beta laktamaz aktivitelerinin değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
YEŞİM ÖZTÜRK
Yüksek Lisans
Türkçe
1997
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıGATAMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Vankomisin dirençli enterokok izolatlarının çeşitli antimikrobiyallere karşı duyarlılıklarının belirlenmesi
Determination of antimicrobial susceptibilities of vancomycin resistant enterococci to various antimicrobial agents
YASEMİN ÇAĞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık BakanlığıEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SERAP GENÇER
- Klinik mikrobiyoloji laboratuvarına gönderilen kan kültürlerinin prospektif olarak değerlendirilmesi
Prospective assesment of blood cultures which were sent to clinical microbiology laboratory
SİBEL AYDIN BOLUKÇU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. A.ATAHAN ÇAĞATAY
- Febril nötropenik hastalarda gelişen kan dolaşımı enfeksiyonlarının epidemiyolojisi ve mortalite üzerine etkili prognostik faktörler
Epidemiology of bloodstream infections in patients febrile neutropenic and prognostic factors affecting mortality
RIDVAN KARA ALİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiEnfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Bakteriyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NEŞE SALTOĞLU