Geri Dön

Tüberküloz hastalarında FokI ve TaqI vitamin D reseptörü polimorfizmlerinin araştırılması

Investigation of FokI and TaqI vitamin D receptor polymorphisms in tuberculosis patients

  1. Tez No: 709186
  2. Yazar: DOĞAN CAN ASLAN
  3. Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MAHMUT ÜLGER
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Eczacılık ve Farmakoloji, Pharmacy and Pharmacology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Mersin Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 66

Özet

Tüberküloz (TB), her yıl 2 milyona yakın ölüme neden olan, insan sağlığını tehdit eden önemli bir hastalıktır. TB'nin etiyolojisi ile ilgili bilgi eksikliği, hastalığın tedavisi veya önlenmesi için etkili stratejilerin geliştirilmesini engellemektedir. İnsan genetiği ile ilgili çalışmalar, yaygın hastalıkların moleküler temelini anlamak için vazgeçilmez bir yaklaşımdır. Bazı genler Mycobacterium tuberculosis enfeksiyonuna konakçı yanıtlarında, hastalığın oluşumu ve seyrini düzenlemede oldukça önemlidir. Nükleotid farklılıkları, TB hastalarının immün regülasyonunu etkileyerek TB'ye duyarlılığa neden olabilir. Vitamin D Reseptör (VDR), steroid-tiroid-retinoid asit reseptör ailesine ait hücre içi bir polipeptittir. Bir dizi biyolojik işlevi aktive eden veya gen transkripsiyonlarının baskılanmasına aracılık eden özel RNA kodlayan proteinlerin sentezini başlatmak için VDR hedef hücrelerdeki DNA'ya bağlanır. 12q12 kromozomunda VDR geni, en az beş promotor bölgesi, proteinleri kodlayan sekiz ekzon ve alternatif olarak eklenmiş altı çevrilmemiş ekzon ile bulunur. FokI (rs2228570), TaqI (rs731236), BsmI (rs154410) ve ApaI (rs7975232) gibi VDR geninde iyi çalışılmış polimorfizmler, TB'nin genetik yatkınlığı için umut verici adaylardır ve bazılarının VDR aktivitesini etkilediği gösterilmiştir. Bu çalışmada VDR'yi kodlayan genlerdeki (FokI ve TaqI) tek nükleotid polimorfizmlerinin TB'ye karşı duyarlılık ya da direnç ile ilişkisinin olup olmadığı ve ilişkili ise bu polimorfizmlerin TB hastalarında sıklığının ortaya koyulması amaçlanmıştır. Çalışmaya 84 TB hastası ve 96 sağlıklı kontrol dahil edildi. Bu kişilerden elde edilen DNA örneklerindeki tek nükleotid polimorfizmini tespit etmek için“TaqMan® Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assays”yöntemi kullanıldı. Çalışmanın istatistiksel analizleri IBM SPSS Statistics Free Download paket program kullanılarak gerçekleştirildi. Çalışma sonucunda VDR geni FokI rs2228570 A/G tek nükleotid polimorfizmi için genotip (p=0,42) dağılımı bakımından hasta grubu ile sağlıklı kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamadı. FokI rs2228570 gen bölgesindeki tek nükleotid polimorfizm sonuçlarına göre G allelli hasta (%74,40) ve kontrol (%69,79) gruplarında daha sık bulunmaktadır. TaqI rs731236 A/G tek nükleotid polimorfizmi real time PZR sonuçlarının değerlendirilmesi sonrası, hasta grubundan 3 kişinin ve sağlıklı kontrol grubundan 3 kişinin tek nükleotid polimorfizm sonuçları cihaz tarafından belirlenememiştir. İstatistiksel analiz 81 hasta ve 93 sağlıklı kontrol grubu üzerinden yapıldı. VDR geni TaqI rs731236 A/G tek nükleotid polimorfizmi için genotip (p=0,23) dağılımı bakımından hasta grubu ile sağlıklı kontrol grubu arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark bulunamadı. TaqI rs731236 gen bölgesindeki tek nükleotid polimorfizm sonuçlarına göre A allelli hasta (%61,11) ve sağlıklı kontrol (%67,74) grubunda daha sık bulunmaktadır. VDR gen bölgesi ile TB'ye genetik yatkınlık arasında bir ilişkinin olup olmadığının belirlenmesi için daha fazla hasta ve sağlıklı kontrollerin dahil edileceği çalışmalar yapılarak bu konunun aydınlatılması sağlanmalıdır.

Özet (Çeviri)

Tuberculosis (TB) is a significant disease that causes nearly 2 million deaths each year and threatens human health. Lack of knowledge about the etiology of TB hinders the development of effective strategies for treating or preventing the disease. Studies of human genetics are an integrated approach to understanding the molecular basis of common diseases. Some genes are essential in the host response to Mycobacterium tuberculosis infection in regulating the occurrence and course of the disease. Nucleotide differences may affect the immune regulation of TB patients, causing susceptibility to TB. Vitamin D Receptor (VDR) is an intracellular polypeptide belonging to the steroid-thyroid-retinoid acid receptor family. The VDR binds to the DNA in target cells to synthesize specific RNA-coding proteins that activate several biological functions or mediate the repression of gene transcriptions. On chromosome 12q12, the VDR gene is found with at least five promoter regions, eight exons encoding proteins, and six alternatively spliced untranslated exons. Well-studied polymorphisms in the VDR gene such as FokI (rs2228570), TaqI (rs731236), BsmI (rs154410), and ApaI (rs7975232) are promising candidates for genetic susceptibility to TB, and some have been shown to affect VDR activity. This study was aimed at determining whether single nucleotide polymorphisms in genes encoding VDR (FokI and TaqI) are associated with susceptibility or resistance to TB and if any, the frequency of these polymorphisms in TB patients. In this study, 84 TB patients and 96 healthy controls were included. The“TaqMan® Single Nucleotide Polymorphism (SNP) Assays”method was used to detect single nucleotide polymorphism in DNA samples obtained from these individuals. Statistical analysis of the study was performed using the IBM SPSS Statistics Free Download package program. As a result of the study, no statistically significant difference was found between the patient and healthy control groups in terms of genotype distribution (p=0.42) for the VDR gene FokI rs2228570 A/G single nucleotide polymorphism. According to the results of single nucleotide polymorphism in the FokI rs2228570 gene region, the G allele is seen more frequently in the patient (74.40%) and healthy control (69.79%) groups. After the evaluation of TaqI rs731236 A/G single nucleotide polymorphism real-time PCR results, the results of three individual from the patient group and three individual from the healthy control group could not be determined by the device. Statistical analysis was performed on 81 patient and 93 healthy control groups. There was no statistically significant difference between the patient and the healthy control groups regarding genotype distribution (p=0.23) for the VDR gene TaqI rs731236 A/G single nucleotide polymorphism. According to the results of single nucleotide polymorphism in the TaqI rs731236 gene region, A allele is seen more frequently in patients (61.11%) and healthy controls (67.74%). To determine whether there is a relationship between the VDR gene region and genetic susceptibility to TB, studies involving more patients and healthy controls should be conducted, and this issue should be clarified.

Benzer Tezler

  1. Tüberküloz hastalarında yalnızlık ve depresyonla ilişkisi

    The relationship between loneliness levels and depression of the patients with tuberculosis.

    HATİCE POLAT

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2008

    Göğüs HastalıklarıAtatürk Üniversitesi

    İç Hastalıkları Hemşireliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SEHER ERGÜNEY

  2. Tüberküloz hastalarında farmasötik bakım hizmetlerinin değerlendirilmesi ve dirençli olguların tedavisinde levofloksasinin rolünün incelenmesi

    Assessment of pharmaceutical care services in tuberculosis patients and investigation of the role of levofloxacin in resistant cases

    PHİLİP CLARK

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2005

    Eczacılık ve FarmakolojiMarmara Üniversitesi

    Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. FİKRET VEHBİ İZZETTİN

  3. Tüberküloz hastalarında toll-benzeri reseptör (toll-lıke receptor, tlr) 2 ve 4 gen polimorfizmlerinin araştırılması

    Investigation of toll-like receptors (tlr) 2 and 4 gene polymorphisms in tuberculosis patients

    PINAR FIRAT YENER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    MikrobiyolojiMersin Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MAHMUT ÜLGER

  4. Tüberküloz hastalarında yaşam kalitesi ölçülmesi ve silymarin'in anti-tüberküloz ilaç kaynaklı hepatotokisite üzerine etkisinin deney hayvanlarında araştırılması

    Measurement of quality of life in patients with tuberculosis and investigation of efficacy of silymarin in anti-tuberculosis drugs induced hepatotoxicity in experimental animals

    SUDABE AZARMİR SHOTORBANİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    Eczacılık ve FarmakolojiMarmara Üniversitesi

    Farmakoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. FİKRET VEHBİ İZZETTİN

  5. Tüberküloz hastalarında, inaktif Mycobacterıum tuberculosis ve IL-17 ile stimüle edilen nötrofillerin işlev ve aktivasyon belirteçlerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of functions and activation markers of patients neutrophils with tuberculosis stimulated by inactive Mycobacterium tuberculosis and IL-17

    TÜRKER TOKTAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2010

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    İmmünoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YILDIZ CAMCIOĞLU