Actinobacteria üyelerinin beyaz ve kırmızı toprak örneklerinden izolasyonu, morfolojik, fizyolojik, biyokimyasal ve moleküler karakterizasyonu
Isolation of Actinobacteria members from white and red soil samples and their morphological, physiological, biochemical and molecular characterization
- Tez No: 713711
- Danışmanlar: PROF. DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 88
Özet
Actinobacteria filumuna ait olan Streptomyces cinsinin üyeleri, bir dizi antibiyotiğin keşfedilmesine ve geliştirilmesine yol açmıştır. Bu antibiyotikler onların ikincil metabolitleridir. Bugüne kadar keşfedilen antibiyotiklerin yaklaşık %80'i Streptomyces cinsinin üyeleri tarafından sentezlenmektedir. Piyasadaki çok sayıda antibiyotiğe rağmen, sürekli olarak yeni antibiyotiklere ihtiyaç vardır. Bunun nedeni bakterilerin bir direnç mekanizmasına sahip olmalarıdır. Bu çalışmada bakteri kaynağı olarak Gemerek ilçesinden (Sivas, Türkiye) beyaz ve kırmızı toprak örnekleri kullanıldı. Bu toprak örneklerinden ISP-2 agar üzerinde toplam 50 izolat elde edildi. Bunlardan 15 izolat seçildi; bazı biyokimyasal özellikleri belirlendi ve tür düzeyinde teşhisleri yapıldı. İzolatlar Streptomyces griseorubens, Streptomyces griseoflavus, Streptomyces olivaseus, Streptomyces griseobrunnes, Streptomyces viridodiastaticus, Streptomyces tunisiensis ve Nocardiopsis dassonvilei'ye aitti. Kültürleri 37°C'de ve pH 7'de optimize edildi. Hücre dışı enzimlerin varlığı açısından taranan 10 izolatın hepsinde zon oluşumu gözlendi ve izolatlar katalaz pozitifti. Antimikrobiyal aktivite taraması için kuyucuk-difüzyon yöntemi kullanıldı ve izolatların çoğunlukla Gram-pozitif bakterilere karşı etkili olduğu gözlendi. Toplam ikincil metabolitler, n-butanol ile özütlendi ve GC-MS ile tanımlandı.
Özet (Çeviri)
Members of the genus Streptomyces, belonging to the phylum Actinobacteria, have led to the discovery and development of a number of antibiotics. These antibiotics are their secondary metabolites. About 80% of the antibiotics discovered to date are synthesized by members of the Streptomyces genus. Despite the large number of antibiotics on the market, there is a constant need for new antibiotics. This is because bacteria have a resistance mechanism. In this study, white and red soil samples from the town of Gemerek (Sivas, Turkey) were used as a source of bacteria. A total of 50 isolates were obtained from these soil samples on ISP-2 agar. Of these, 15 isolates were selected, some biochemical properties were determined, and and they were identified at species level. The isolates belonged to Streptomyces griseorubens, Streptomyces griseoflavus, Streptomyces olivaseus, Streptomyces griseobrunnes, Streptomyces viridodiastaticus, Streptomyces tunisiensis and Nocardiopsis dassonvilei. Their cultures were optimized at 37°C and pH 7. Zone formation was observed in all 10 isolates screened for the presence of extracellular enzymes, and the isolates were catalase positive. Well-diffusion method was used for antimicrobial activity screening and it was seen that the isolates were mostly effective against Gram-positive bacteria. Total secondary metabolites were extracted with n-butanol and characterized by GC-MS.
Benzer Tezler
- Actinobacteria üyelerinden pigment üretimi, kültür optimizasyonu ve pigment izolasyonu
Pigment production, culture optimization and pigment isolation from actinobacteria members characterization
DÖNSEL ARSLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyoteknolojiSivas Cumhuriyet ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ FAZIL YENİDÜNYA
DR. SERAP ÇETİNKAYA
- Karakum çölü (Türkmenistan) kültürlenebilir aktinobakteri biyoçeşitliliğinin genoma dayalı polifazik taksonomisi
Genome-based polyphasic taxonomy of Cultivable actinobacteria biodiversity in the Karakum desert (Turkmenistan)
HAYRETTİN SAYGIN
- Bazaltik ana materyal ve üzerinde oluşmuş topraklardan aktinomiset izolasyonları ve polifazik taksonomisi
Isolation of actinomycetes from basaltic parent material and formed on it surface soils and polyphasic taxonomy
SALİH SARICAOĞLU
- Kapadokya yöresi topraklarından aktinomiset izolasyonu ve polifazik taksonomisi
Isolation of actinomycetes from Cappadocia regions soil and polyphasic taxonomy
TALHA GENÇBAY
- Ticari arı ekmeği örneklerindeki laktik asit bakterilerinin tanımlanması
Identification of lactic acid bacteria in commercial bee bread samples
NERMİN ÇELİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA