Geri Dön

Cell detection on 3d fluorescencemicroscopy with Cnns

Başlık çevirisi mevcut değil.

PDF İndir

  1. Tez No: 715625
  2. Yazar: ERDOĞAN EFE AKMANSU
  3. Danışmanlar: DR. ALVARO GOMARİZ, PROF. DR. ORCUN GOKSEL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Bilgi ve Belge Yönetimi, Elektrik ve Elektronik Mühendisliği, Information and Records Management, Electrical and Electronics Engineering
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Eidgenössische Technische Hochschule Zürich (ETH)
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 38

Özet

Özet yok.

Özet (Çeviri)

Cell detection methods in microscopy images are key for diagnosis applications as well as advances in biomedical research. In spite of the advances in computer vision, most of these routines still rely on manual analysis. In this project, we explore the use of convolutional neural networks for this task, namely by using 2D and 3D adaptations of U-Net and Siamese networks. While the former focuses on extracting features that are useful for the detection of the labelled cells, the latter learns features that are useful for similarity learning. In this way, template cells can be used to match similarities in a search image. Results in the employed dataset show that 3D models lead to better detection of cells than their 2D counterpart, and that Siamese networks are comparable to the U-Net. A potential caveat with Siamese networks was observed, namely that they can learn fixed embeddings of a template under special circumstances. We explored some solutions to this problem and discuss novel problem settings where Siamese networks can be helpful.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    770783

    Multicolor fluorescence microscopy fortracking magnetic micro-agents

    Başlık çevirisi yok

    MERT KAYA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1989

    Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolUniversity of Twente

    PROF. DR. SARTHAK MİSRA

  2. Tez No

    618499

    Biochemical and mechanical cues for osteogenic induction of stem cells on paper based scaffolds

    Kağıt tabanlı doku iskelelerinde kök hücrelerin osteojenik farklılaşması için biyokimyasal ve mekanik işaretler

    ÖZGE KARADAŞ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoteknoloji ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ENGİN ÖZÇİVİCİ

  3. Tez No

    195779

    Hematürili hastalarda mesanenin bt sistografi ve pozitif sanal sistoskopi ile incelenmesi

    In hematüria patients bladder of examination with ct cystography and positive virtual cystoscopy

    EDA KAZAK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    Radyoloji ve Nükleer TıpAdnan Menderes Üniversitesi

    Radyoloji Ana Bilim Dalı

    Y.DOÇ.DR. ALPARSLAN ÜNSAL

  4. Tez No

    855972

    Üç boyutlu yazıcı ile jelatin bazlı yara örtüsü geliştirilmesi

    Development of gelatin-based wound dressing with three-dimensional printer

    ESRA GİRGİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyoteknolojiSakarya Üniversitesi

    Biyomedikal Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MAHMUT ÖZACAR

    PROF. DR. OĞUZHAN GÜNDÜZ

  5. Tez No

    630852

    Development of magnetic levitation-based sensitive assays

    Manyetik levitasyon prensibine dayalı analiz yöntemlerinin geliştirilmesi

    SENA YAMAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜSEYİN CUMHUR TEKİN

    DOÇ. DR. MAHMUT CEM ERGON

Geri Dön