Geri Dön

Cell detection on 3d fluorescencemicroscopy with Cnns

Başlık çevirisi mevcut değil.

PDF İndir

  1. Tez No: 715625
  2. Yazar: ERDOĞAN EFE AKMANSU
  3. Danışmanlar: DR. ALVARO GOMARİZ, PROF. DR. ORCUN GOKSEL
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Elektrik ve Elektronik Mühendisliği, Bilgi ve Belge Yönetimi, Electrical and Electronics Engineering, Information and Records Management
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2019
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Eıdgenossısche Technısche Hochschule Zurıch (eth)
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Özet yok.

Özet (Çeviri)

Cell detection methods in microscopy images are key for diagnosis applications as well as advances in biomedical research. In spite of the advances in computer vision, most of these routines still rely on manual analysis. In this project, we explore the use of convolutional neural networks for this task, namely by using 2D and 3D adaptations of U-Net and Siamese networks. While the former focuses on extracting features that are useful for the detection of the labelled cells, the latter learns features that are useful for similarity learning. In this way, template cells can be used to match similarities in a search image. Results in the employed dataset show that 3D models lead to better detection of cells than their 2D counterpart, and that Siamese networks are comparable to the U-Net. A potential caveat with Siamese networks was observed, namely that they can learn fixed embeddings of a template under special circumstances. We explored some solutions to this problem and discuss novel problem settings where Siamese networks can be helpful.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    770783

    Multicolor fluorescence microscopy fortracking magnetic micro-agents

    Başlık çevirisi yok

    MERT KAYA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    1989

    Bilim ve TeknolojiUnıversıty Of Twente

    PROF. DR. SARTHAK MİSRA

  2. Tez No

    496465

    Construction and characterization of solid-supported lipid bilayers to investigate cell-surface interactions

    Hücre–yüzey etkileşimlerinin incelenmesi için yüzey-destekli lipid zarların oluşturulması ve karakterizasyonu

    ABDULHALİM KILIÇ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2018

    Biyomühendislikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DOÇ. DR. FATMA NEŞE KÖK

  3. Tez No

    713273

    3d optical imaging of living cells in microgravity: application to study dynamic changes of cytoskeleton

    Canlı hücrelerin mikro çekim altında 3 boyutlu görüntülenmesi: hücre iskeletinin dinamik değişimlerinin çalışılmasında uygulanması

    MUHAMMED FATİH TOY

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Elektrik ve Elektronik MühendisliğiEcole Polytechnıque Federale de Lausanne (epfl)

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CHRISTIAN DEPEURSINGE

    DR. MARCEL EGLI

  4. Tez No

    650348

    DEVELOPMENT OF MICROFLUIDIC BASED SINGLE CELL CAPTURING SYSTEMS FOR EARLY DETECTION OF DISEASES

    Erken teşhise yönelik mikroakışkan tabanlı tek hücre yakalama sistemlerinin geliştirilmesi

    EMRE ALTINAĞAÇ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Biyoteknolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HÜSEYİN KIZIL

  5. Tez No

    338484

    Detection of imatinib and doxorubicin resistance in K562 leukemia cells by 3D-electrode contactless dielectrophoresis

    Imatinib ve doxorubicin direnci geliştirmiş K562 lösemi hücrelerinin 3 boyutlu elektrot kullanılarak temassız dielektroforez ile tespiti

    YAĞMUR DEMİRCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyomühendislikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Elektrik-Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HALUK KÜLAH

Geri Dön