GDO tayini için mikroakışkan biyosensör tasarlanması
Design of microfluidic biosensor for GMO detection
- Tez No: 734959
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜSEYİN YÜCE, DR. ÖĞR. ÜYESİ OYA AKÇA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mekatronik Mühendisliği, Mechatronics Engineering
- Anahtar Kelimeler: GDO, Genetiği değiştirilmiş organizmalar, Mikro akışkanlar, GDO, Genetically modified organisms, Microfluidics
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mekatronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mekatronik Mühendisliği Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Günümüzde insan sağlığı ve çevre sağlığı için önemli bir konu olan“Genetiği Değiştirilmiş Organizma”(GDO) kavramı ve içerisinde GDO olan ürünlerin hızlı, kolay ve güvenilir olarak algılanması büyük bir önem arz etmektedir. Günümüze GDO tayinine yönelik yöntemler genellikle polimeraz zincir reaksiyonu temelli yaklaşımlardır. Bu yöntemler pahalı ekipmanlar, maliyetli reaktifler ve deneyimli personel gerektirir. Bu çalışmayla, piyasadaki GDO'ların varlığını izleme sürecinin ekonomik yükünü azaltmak için DNA hibridizasyonuna dayalı nispeten ucuz ve kullanımı kolay bir mikroakışkan biyosensör tasarlamak amaçlanmıştır. Sistemin nümerik çalışması Comsol Multiphysics 5.6 yazılımında çoklu fiziksel sistem kullanılarak yapılmıştır. Çalışmamızda GDO'nun varlığı, komplementer DNA hibridizasyonuna bağlı olarak değişen kütle ile tayin edilmektedir. Piezoelektrik alttaş olarak LiTaO3 kullanılmış olup, altın IDT'ler ile yüzey akustik dalgası üretilmiştir ve özfrekans analizi ile frekanstaki kayma hesaplanmıştır. Ayrıca modelleme yaklaşımının doğruluğu için ikinci bir çalışma yapılarak yaklaşımın doğruluğu ispatlanmıştır. Nümerik çalışma ile mikroakışkan kanal kullanmadan yüzeye DNA tutturulmasıyla elde edilen frekans tepkisi KHz düzeyinde olup, mikroakışkan kanal eklenmesiyle yapılan analizde frekans tepkisi MHz düzeyine çıkmıştır. Bu durumda mikroakışkan kanalın varlığıyla birlikte hassasiyetin arttığı görülmüştür. Ayrıca mikroakışkan kanal kullanımı, deneysel çalışmalarda yenilenmeyi ve farklı yıkama koşullarındaki deneylerin tek bir çip üzerinde yapılmasına olanak tanıyacaktır.
Özet (Çeviri)
The concept of“Genetically Modified Organism”(GMO), and perception of products containing GMOs in fast, easy and reliable ways are of great importance for human and environmental health. Today, methods for GMO detection are mainly based on polymerase chain reactions. These methods require expensive equipment, costly reagents and experienced personnel. In this study, it is aimed to design a relatively inexpensive and easy-to-use microfluidic biosensor based on DNA hybridization to reduce the economic burden of monitoring the presence of GMOs in the market. The numerical study of the system was made using the multi-physical system in Comsol Multiphysics 5.6 software. In our study, the presence of GMO is determined by varying mass depending on complementary DNA hybridization. LiTaO3 was used as the piezoelectric substrate, surface acoustic wave was produced with gold IDTs and frequency shift was calculated by eigenfrequency analysis. In addition, the accuracy of the modeling approach has been proven by a second study for the accuracy of the modeling approach. The frequency response obtained by attaching DNA to the surface without using microfluidic channels by numerical study was at the level of Hz, and the frequency response was increased to MHz in the analysis made with the addition of microfluidic channel. In this case, it was observed that the sensitivity increased with the presence of the microfluidic channel. In addition, the use of microfluidic channels will allow renewal in experimental studies and experiments under different washing conditions on a single chip.
Benzer Tezler
- Development of PCR methods for detection and quantification of genetically modified maize
Genetiği değiştirilmiş mısırların tespiti ve miktar tayini için PZR yöntemleri geliştirilmesi
HOUMAN JABBARİFARHOUD
Doktora
İngilizce
2010
BiyoteknolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
DOÇ. DR. CANDAN GÜRAKAN
DR. REMZİYE YILMAZ
- Using plasmid reference materials for genetically modified organisms analysis and their verification with inter-laboratory comparison test
Gdo analiz yöntemlerinde plazmit referans malzeme kullanımı ve laboratuvarlar arası karşılaştırma testi ile doğrulanması
TUĞÇE CEREN TUĞRUL
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
BiyolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE MERAL YÜCEL
DOÇ. DR. REMZİYE YILMAZ
- Microneedles for DNA extraction in plant studies
Bitki çalışmalarında DNA ekstraksiyonu için mikroiğneler
EMRE ECE
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Mühendislik Bilimleriİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiMalzeme Bilimi ve Nanoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. FATİH İNCİ
- 18F-FDG-grayanotoksin-gadolinyum-nanoparçacıkların sentezi ve in vitro biyoetkinliklerin incelenmesi
In vitro bioactivity evaluation of synthesized 18F-FDG grayanotoxin-gadolinium-nanoparticles
TALHA SIDDIK AKKAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Radyoloji ve Nükleer TıpEge ÜniversitesiNükleer Bilimler Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PERİHAN ÜNAK
ÖĞR. GÖR. İSKENDER İNCE
- Yüzeyde güçlendirilmiş Raman spektroskopisi kullanılarak yüksek hassasiyette DNA analizine yönelik dönen çember amplifikasyonu yönteminin geliştirilmesi
Development of rolling circle amplification method for high sensitivity DNA analysis using surface enhanced Raman spectroscopy
BURCU GÜVEN
Doktora
Türkçe
2016
Gıda MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL HAKKI BOYACI