Erzurum piyasasından toplanan kıyma örneklerindeki bazı patojenik bakterilerin Real Time PCR yöntemi ile tespiti
Detection of some pathogenic bacteria in beef samples collected from Erzurum market by Real Time PCR method
- Tez No: 738881
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET ADIGÜZEL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: kıyma, Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp, Real-Time PCR, Escherichia coli, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Salmonella, beef, Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7, Salmonella spp, Real-Time PCR, Escherichia coli, Reverse transcription polimerase chain reaction, Ground meat, Salmonella
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Atatürk Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Et; protein bakımından oldukça zengin olması ve bünyesinde bulundurduğu yeterli su aktivitesi gibi özellikleri sayesinde gıda kaynaklı patojenlerin üremeleri için gerekli olan ortamı sağlamaktadır. Bu tez çalışmasında, Erzurum ili merkez ilçelerinde bulunan farklı kasap ve marketlerden temin edilen 100 adet kıyma örneğinde Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7 ve Salmonella spp. patojen bakterilerinin, Real-Time PCR ile ön zenginleştirme ve DNA izolasyonu yapılmadan hızlı, güvenilir ve kolay bir şekilde tespiti amaçlanmıştır. Yöntem: Erzuruma bağlı ilçelerdeki kasap ve marketlerden temin edilen 100 adet kıyma örneği aseptik koşullar altında laboratuvara getirilmiştir. Daha sonra getirilen bu örneklerde DNA izolasyonu yapılmadan Real-Time PCR yöntemi kullanılarak, aynı örnekte hem Listeria monocytogenes hem de Escherichia coli O157:H7 ve Salmonella spp. patojenlerinin varlığı ve miktarı belirlenmiştir. Bulgular: Standart patojen bakterilerin Ct değerlerine ait lineer-regresyon grafikleri çizilmiştir. Real-Time PCR analizi sonucu elde edilen kıyma örneklerinin Ct değerleri, standart grafiklerin doğru denklemlerinde yerine konularak, örneklerdeki patojen bakteri miktarları belirlenmiştir. Toplanan 100 adet kıyma örneğinin %45'inde Listeria monocytogenes, %30'unda Escherichia coli O157:H7 ve %29'unda Salmonella spp. patojenlerinin olduğu tespit edilmiştir. Sonuç: Patojen bakterileri tespit etmek için kullanılan Real-Time PCR metodunun, geleneksel yöntemlere göre daha spesifik, hızlı ve güvenilir olduğu saptanmıştır. Ayrıca, ön zenginleştirme ve DNA izolasyonu yapılmadan da daha az maliyet, daha kısa zaman ve en aza indirilmiş iş yükü ile gıdalar üzerinde gelişen patojen bakterilerin hassas bir şekilde tespit edilebileceği gözlemlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Purpose: Meat provides the necessary environment for the growing of foodborne pathogens thanks to its features such as being quite rich in terms of protein and sufficient water activity it contains. In this thesis study, determination of pathogenic bacteria Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7 and Salmonella spp. was aimed by Real-Time PCR without pre-enrichment and DNA isolation in a fast, reliable and easy way. Method: 100 minced meat samples obtained from butchers and markets in districts of Erzurum province were brought to the laboratory under aseptic conditions. In these samples, existence and amount of pathogens of Listeria monocytogenes, Escherichia coli O157:H7 and Salmonella spp. were simultaneously determined by Real-Time PCR method without DNA isolation. Findings: Linear regression graphs of Ct values of standard pathogenic bacteria were created. The Ct values of minced meat samples obtained as a result of Real-Time PCR analysis were substituted in the straight lines of the standard graphics and the amounts of pathogenic bacteria in the samples were detected. The presence of Listeria monocytogenes at 45%, Escherichia coli O157:H7 at 30% and Salmonella spp. pathogens at 29% of the collected 100 minced meat samples was determined. Results: Real-Time PCR method used to detect pathogenic bacteria was found to be more specific, fast and reliable than conventional methods. In addition, it was observed that pathogenic bacteria growing on foods can be detected sensitively with less cost, shorter amount of time and minimized workload without pre-enrichment and DNA isolation.
Benzer Tezler
- İbrahim Hakkı Erzurumi'nin Tertib-i ulum isimli eserindeki eğitimle ilgili görüşleri
Başlık çevirisi yok
ÖMER ÖZYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Eğitim ve ÖğretimUludağ ÜniversitesiDin Kültürü ve Ahlak Bilgisi Eğitimi Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. HALİS AYHAN
- Geleneksel konutlarda ahşap yapı konstrüksiyonları Ankara Erzurum Mahallesi örneği
Başlık çevirisi yok
MUALLA KALFAGİL
- Erzurumlu İbrahim Hakkı Divan'ında aşk
Başlık çevirisi yok
SÜLEYMAN SOLMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Türk Dili ve EdebiyatıGazi ÜniversitesiTürk Dili ve Edebiyatı Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ABDURRAHMAN GÜZEL
- Endemik iki centaurea türü üzerinde taksonomik ekolojik ve palinolojik araştırmalar
Başlık çevirisi yok
ZAFER KAYA