Geri Dön

Ceviz (juglans regia l.) için mikrosatellit (ssr)primerlerin geliştirilmesi

Development of microsatellite (ssr) markers inwalnut (j.regia l.)

PDF İndir

  1. Tez No: 740699
  2. Yazar: HAYAT TOPÇU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SALİH KAFKAS
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2013
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 61

Özet

Bu çalışmada daha önceki bir çalışmada J. nigra DNA'sı kullanılarak oluşturulan ve 'GA' ile 'AC' tekrar dizileri ile zenginleştirilen genomik kütüphanelerden dizayn edilen SSR primer çiftlerinin J. regia'da amplifikasyon ve polimorfizm bakımından test edilmesi amaçlanmıştır. Toplam olarak 'GA' ile zenginleştirilmiş kütüphanaden 99 adet SSR primer çifti test edilirken, 'AC' ile zenginleştirilmiş kütüphaneden ise 241 primer çifti test edilmiştir. 'GA' ile zenginleştirilmiş kütüphaneden geliştirilen SSR primer çiftlerinden 47 (%47.5) tanesi bant üretmiş ve 19 tanesi (%19.2) polimorfizm gösterirken, 'AC' ile zenginleştirilmiş genomik kütüphaneden geliştirilen SSR primer çiftlerinden 44 tanesi (%18.3) gradient PCR sonucu bant vermiş ve bunlardan 13 tanesi (%5.4) polimorfik bulunmuştur. 'GA' kütüphanesindeki 19 polimorfik SSR primerden 90 adet allel elde edilmiş ve bunların 66 tanesi (%73.4) polimorfizm gösterirken, 'AC' kütüphanesindeki 13 adet polimorfik SSR primer çifti 81 adet allel üretmiş ve bunlardan 32 tanesi (%39.5) polimorfizm göstermiştir. Özetle bu çalışmada 32 adet (%9.41) polimorfik SSR primer çifti geliştirilmiş ve bu primerlerin 20 ceviz çeşi/genotipinde analizinden 98 adet polimorfik allel elde edilmiştir. Bu polimorfik SSR primerleri açılım gösteren bir populasyonda da ('Maraş-12' X 'Kaplan-86') test edilmiş ve 13 tanesinin kodominant açılım gösterdiği belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada geliştirilen SSR primer çiftleri bundan sonra cevizde yapılacak genetik karakterizasyon, populasyon genetiği, genetik haritalama, çeşitlerin tanımlanması ve genetik kaynakların karakterizasyonu gibi genetik çalışmalarda kullanılabilir.

Özet (Çeviri)

In this study, it was aimed to analyze SSR primer pairs based on their amplification and polymorphism in J. regia, which were designed from J.nigra genomic libraries enriched with 'GA' and 'AC' repeats in a previous study. Totally, 99 SSR primer pairs were tested in 'GA' enriched libarary, whereas 241 SSR primer pairs were tested in 'AC' enriched library. Forty-seven (%47.5) SSR primer pairs gave amplification product and 19 of them showed polymorphism in 'GA' enriched library, whereas 44 (%18.3) SSR primer pairs had products after gradient PCR and 13 of them (%5.4) had polymorphism. Totally, 90 alleles were obtained from 19 polymorphic SSR primers in 'GA' library and 66 of them were polymorphic, whereas 81 alleles were amplified from 13 SSR primer pairs in 'AC' library and 32 of them (%39.5) showed polymorphism. In a summary, 32 (%9.41) polymorphic SSR primer pairs were developed in this study and they produced 98 polymorphic alleles in 20 walnut cultivars/genotypes. These polymorphic SSR primers were also tested in a segregating population (Maras-12 X Kaplan-86) and 13 of them showed codominant segregation. In conclusion, these polymorphic SSR primer pairs can be used in the future genetic studies in walnut such as genetic characterization, population genetic, genetic mapping, cultivar identification and germplasm chracterization.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    478722

    Chandler ceviz çeşidi DNA dizilerini kullanarak polimorfik mikrosatellit markörlerin geliştirilmesi

    Development of polymorphic microsatellites markers using DNA sequences of chandler walnut cultivar

    EMRE ESER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH KAFKAS

  2. Tez No

    426047

    Bazı ceviz (Juglans regia L.)çeşitlerinde dinlenmenin karşılanması için gerekli soğuklama ve sıcaklık toplamı ihtiyaçlarının belirlenmesi

    Determination of chilling and heat requirements for breaking dormancy in some walnut (Juglans regia L.) cultivars

    GÜLNUR ÇAVDAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    ZiraatUludağ Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ÜMRAN ERTÜRK

  3. Tez No

    360961

    Molecular characterization of walnut (Juglans regia L.) population using aflp markers

    Ceviz (Juglans regia L.) populasyonunun aflp markörleri kullanılarak moleküler karakterizasyonu

    RAWNAQ HUSSEİN RASHAD ALMOHAMMED

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyomühendislikKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YÜKSEL BÖLEK

  4. Tez No

    529018

    Cevizin SSR, SNP ve DArT markörleri ile yoğun genetik bağlantı haritasının oluşturulması

    Construction of high density genetic linkage map of walnut by SSR, SNP AND DArT markers

    SINA KEFAYATI

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    BiyoteknolojiÇukurova Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SALİH KAFKAS

    PROF. DR. MEHMET SÜTYEMEZ

  5. Tez No

    688321

    Ceviz (Juglans regia L.) bitkisinin in vitro mikroçoğaltımı üzerine kültür tiplerinin etkileri

    Effects of culture types on in vitro micropropagation of walnut (Juglans regia L.)

    CEM DİRLİK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyomühendislikEge Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYNUR GÜREL

Geri Dön