Geri Dön

DNA dizilerine dayalı olarak Argulus foliaceus (Linnaeus, 1758)'un moleküler tanımlanması

Molecular description of Argulus foliaceus (Linnaeus, 1758) based on DNA sequences

PDF İndir

  1. Tez No: 742707
  2. Yazar: BUSE ESENLİLİOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Biyoloji, Genetics, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Balıklar, Dizi analizi-DNA, Kabuklular, Fishes, Sequence analysis-DNA, Crustaceans
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada, 4 Argulus foliaceus örneğinden 28S rRNA gen lokusuna ait 712-721 bp kısmi belirgin nükleotid dizileri özdeş olarak tanımlanmış ve GenBank'ta kayıt altına alınmıştır (OM721927-30). Çalışmada OM721927 ve OM721928 izolatlarında nükleotit varyasyonu görülmemiştir. Bununla birlikte OM721929 nolu izolatta %0,2 ve OM721930 nolu izolatta %0,4 varyasyon kaydedilmiştir. Argulus foliaceus örneklerinin 28S rRNA gen dizilerindeki nükleotid değerleri tanımlanmıştır: %20,9 T (U), %25,1 A, %29,3 G, %24,3 C. Maksimum benzerlik (ML) metodu ile elde edilen 28S rRNA dizi veri kümesi mesafe matrisine göre, bu çalışmada tanımlanan Argulus foliaceus izolatları (OM721927-30) ile GenBank'ta kayıtlı Argulus foliaceus izolatı (EU370442) arasında tam bir uyum görülmüştür (%0,0). Bu Argulus foliaceus izolatları UPGMA filogram analizinde aynı kümede toplanmıştır. Sonuç olarak, Anadolu'daki Argulus foliaceus türüne ait 4 örnek üzerinden 28S rRNA gen dizileri ilk defa bu çalışmada tanımlanmış ve bu türe ait genetik özelliklerin yerel ve küresel ölçekte belirlenmesi çalışmalarına katkı yapılmıştır. Ayrıca, 28S rRNA gen dizi sonuçları, anatomik ve morfolojik özelliklerine göre tanımlanan Argulus foliaceus türünün taksonomik konumunu doğrulamıştır.

Özet (Çeviri)

In this study, 712-721 bp partially distinctive nucleotide sequences belonging to the 28S rRNA gene locus from 4 Argulus foliaceus samples were identified as identical and registered in GenBank (OM721927-30). No nucleotide variation was observed in the OM721927 and OM721928 isolates in the study. However, 0.2% variation was recorded in isolate OM721929 and 0.4% in isolate OM721930. Nucleotide values in 28S rRNA loci sequences of the Argulus foliaceus samples were defined: 20.9% T (U), 25.1% A, 29.3% G, 24.3% C. According to the 28S rRNA sequence dataset distance matrix obtained by the maximum similarity (ML) method, there was a complete agreement (0%) between the Argulus foliaceus isolates identified in this study (OM721927-30) and the Argulus foliaceus isolate registered in the GenBank (EU370442). These Argulus foliaceus isolates were collected in the same cluster in the UPGMA phylogram analysis. As a result, 28S rRNA gene sequences were defined for the first time in this study on 4 samples belonging to Argulus foliaceus species in Anatolia, and it contributed to the studies of determining the genetic characteristics of this species on a local and global scale. In addition, the 28S rRNA gene sequence results confirmed the taxonomic position of Argulus foliaceus, which was defined according to its anatomical and morphological features.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    789273

    Molecular description of medicinal leech (Hirudo verbana carena, 1820) based on DNA sequences

    DNA dizilerine dayalı olarak tıbbi sülük (Hirudo verbana carena, 1820)'ün moleküler tanımlaması

    AL-HUSSEIN HAMEED HUSSEIN OKBI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  2. Tez No

    437826

    Manyetik partiküllere dayalı dizi seçimli nükleik asit hibridizasyonunun elektrokimyasal sensörlerle tayini

    Detection of sequence-selective nucleic acid hybridization based on magnetic particles by electrochemical sensors

    CANSU ALTAY KÜÇÜK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyoteknolojiEge Üniversitesi

    Biyomedikal Teknolojiler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KADRİYE ARZUM ERDEM GÜRSAN

    PROF. DR. SİNAN AKGÖL

  3. Tez No

    735603

    Tordylium L. (Apiaceae) cinsine ait taksonların kloroplast trnL intron ve trnL-F IGS bölgelerine dayalı moleküler sistematik analizi

    Molecular systematic analysis of Taxa tordylium L. (Apiaceae)based on chloroplast trnL intron and trnL-F IGS regions

    YASİN SİNAN ERDEM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyoteknolojiSelçuk Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ÖZLEM ÇETİN

  4. Tez No

    425933

    Tarsus ve Çevresinde Bulunan Çatalburun Köpeklerin genetik yapısının mtDNA-PCR analiz yöntemiyle belirlenmesi

    Analysis of genetic structure of Catalburun dogs from Tarsus region using by mtDNA-PCR methods

    ZELİHA TUĞÇE ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiMersin Üniversitesi

    Biyoloji Eğitimi Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. REMZİYE SERAP ERGENE

  5. Tez No

    476251

    Yöresel peynirlerden izole edilen laktik asit bakterilerinin real-time PCR yüksek çözünürlüklü erime (RT-PCR-HRM) analizi ile karakterizasyonu

    Characterization of lactic acid bacteria isolated from traditional cheeses with real-time PCR high resolution melting (RT-PCR-HRM) analysis

    ALAEDDİN TÜRKMEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Gıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ZÜLAL KESMEN

Geri Dön