Geri Dön

DNA dizilerine dayalı olarak Argulus foliaceus (Linnaeus, 1758)'un moleküler tanımlanması

Molecular description of Argulus foliaceus (Linnaeus, 1758) based on DNA sequences

PDF İndir

  1. Tez No: 742707
  2. Yazar: BUSE ESENLİLİOĞLU
  3. Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Genetik, Biology, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Afyon Kocatepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 65

Özet

Bu çalışmada, 4 Argulus foliaceus örneğinden 28S rRNA gen lokusuna ait 712-721 bp kısmi belirgin nükleotid dizileri özdeş olarak tanımlanmış ve GenBank'ta kayıt altına alınmıştır (OM721927-30). Çalışmada OM721927 ve OM721928 izolatlarında nükleotit varyasyonu görülmemiştir. Bununla birlikte OM721929 nolu izolatta %0,2 ve OM721930 nolu izolatta %0,4 varyasyon kaydedilmiştir. Argulus foliaceus örneklerinin 28S rRNA gen dizilerindeki nükleotid değerleri tanımlanmıştır: %20,9 T (U), %25,1 A, %29,3 G, %24,3 C. Maksimum benzerlik (ML) metodu ile elde edilen 28S rRNA dizi veri kümesi mesafe matrisine göre, bu çalışmada tanımlanan Argulus foliaceus izolatları (OM721927-30) ile GenBank'ta kayıtlı Argulus foliaceus izolatı (EU370442) arasında tam bir uyum görülmüştür (%0,0). Bu Argulus foliaceus izolatları UPGMA filogram analizinde aynı kümede toplanmıştır. Sonuç olarak, Anadolu'daki Argulus foliaceus türüne ait 4 örnek üzerinden 28S rRNA gen dizileri ilk defa bu çalışmada tanımlanmış ve bu türe ait genetik özelliklerin yerel ve küresel ölçekte belirlenmesi çalışmalarına katkı yapılmıştır. Ayrıca, 28S rRNA gen dizi sonuçları, anatomik ve morfolojik özelliklerine göre tanımlanan Argulus foliaceus türünün taksonomik konumunu doğrulamıştır.

Özet (Çeviri)

In this study, 712-721 bp partially distinctive nucleotide sequences belonging to the 28S rRNA gene locus from 4 Argulus foliaceus samples were identified as identical and registered in GenBank (OM721927-30). No nucleotide variation was observed in the OM721927 and OM721928 isolates in the study. However, 0.2% variation was recorded in isolate OM721929 and 0.4% in isolate OM721930. Nucleotide values in 28S rRNA loci sequences of the Argulus foliaceus samples were defined: 20.9% T (U), 25.1% A, 29.3% G, 24.3% C. According to the 28S rRNA sequence dataset distance matrix obtained by the maximum similarity (ML) method, there was a complete agreement (0%) between the Argulus foliaceus isolates identified in this study (OM721927-30) and the Argulus foliaceus isolate registered in the GenBank (EU370442). These Argulus foliaceus isolates were collected in the same cluster in the UPGMA phylogram analysis. As a result, 28S rRNA gene sequences were defined for the first time in this study on 4 samples belonging to Argulus foliaceus species in Anatolia, and it contributed to the studies of determining the genetic characteristics of this species on a local and global scale. In addition, the 28S rRNA gene sequence results confirmed the taxonomic position of Argulus foliaceus, which was defined according to its anatomical and morphological features.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    789273

    Molecular description of medicinal leech (Hirudo verbana carena, 1820) based on DNA sequences

    DNA dizilerine dayalı olarak tıbbi sülük (Hirudo verbana carena, 1820)'ün moleküler tanımlaması

    AL-HUSSEIN HAMEED HUSSEIN OKBI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyolojiAfyon Kocatepe Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET OĞUZ ÖZTÜRK

  2. Tez No

    770928

    Adana ve civarında buğday yetiştirilen alanlarda arpa sarı cücelik hastalığıyla ilişkili virüslerin (Barley Yellow Dwarf Virus, BYDV)'nün saptanması ve karakterizasyonu

    Determination and characterization of Barley Yellow Dwarf Virus, BYDV in wheat-growing land in Adana and of its around

    NURİ ÇETİZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAADETTİN BALOĞLU

  3. Tez No

    517912

    Doğu Akdeniz bölgesi'nde turunçgillerde yaprak kırışıklığı ve deformasyonlarına neden olan virüs hastalıklarının mevcut durumlarının serolojik ve moleküler yöntemler ile belirlenmesi

    Detection of the situation of virus diseases causing leaf curling and deformation on citrus by serological and molecular techniqus in East Mediterranean region

    ALİ GÜNEŞ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAADETTİN BALOĞLU

  4. Tez No

    567604

    Türkiye'de yayılış gösteren Salsola (Amaranthaceae) türlerinin PSBB-PSBH kloroplast genler arası bölgesi DNA dizilerine dayalı filogenetik ilişkilerinin araştırılması

    Phlogenetic study of Salsola (Amaranthaceae) species in Turkey based on chloroplast PSBB-PSBH intergenic spacer sequences

    DURU SANCAR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET EMRE YAPRAK

  5. Tez No

    658069

    Diyarbakır ve civarında karpuz üretim alanlarında karpuz mozaik virüs (Watermelon mosaic potyvirus, WMV)' ünün saptanması, biyolojik ve moleküler karakterizasyonu

    Detection of watermelon mosaic virus (Watermelon mosaic potyvirus, WMV), biological and molecular characterization in Diyarbakir and its surroundings

    DİLAN KONUR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bitki Koruma Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAADETTİN BALOĞLU

Geri Dön