Fetal dönemde kontraktürlerle seyreden sendromların moleküler etiyopatogenezinin yeni nesil dizileme yöntemleri ile araştırılması
Investigation of molecular etiopathogenesis of syndromes with contractures in fetal period by next generation sequencing methods
- Tez No: 743997
- Danışmanlar: DOÇ. DR. GÖZDE YEŞİL SAYIN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Kadın Hastalıkları ve Doğum, Genetik, Moleküler Tıp, Obstetrics and Gynecology, Genetics, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Artrogripoz, Dizi analizi, Etyopatogenez, Fizik muayene, Moleküler yapı, Prenatal teşhis, Arthrogryposis, Sequence analysis, Etiopathogenesis, Physical examination, Molecular structure, Prenatal diagnosis
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Çoklu konjenital kontraktürler (multiple congenital contractures, MCC); diğer adıyla Artrogripozis multipleks konjenita, iki veya daha fazla vücut bölgesinde bulunan konjenital kontraktürleri niteleyen fenotipik bir tanımlamadır. Tüm ekzom dizileme (TED), bu tip genetik ve fenotipik heterojenite gösteren hastalık gruplarının moleküler etiyolojisinin aydınlatılmasında etkin bir yaklaşım haline gelmiştir. Araştırmamızda, letal MCC spektrumunda değerlendirilen olgularda tüm ekzom dizileme (TED) ile moleküler etiyolojinin belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışmamıza 11 aileden 15 etkilenmiş fetus dahil edildi. Array-CGH analizi normal sonuçlanmış 11 indeks olguda TED analizi yapıldı. Bütün varyantlar Sanger sekanslama ile doğrulandıktan sonra ailevi segregasyon analizleri gerçekleştirildi. Sekiz ailede COG6, NEB, RAPSN, KIAA1109, DOK7, HSPG2 ve PSAT1 genlerinde bilinen veya novel nitelikte patojenik/olası patojenik varyantlar saptandı. Etiyopatogenezin aydınlatıldığı üç olguda biallelik VPS13B, DNAH9 ve USH2A değişimlerinin saptanması ile olguların ikinci bir tek gen hastalığından etkilendiği gösterildi. Ayrıca, aynı aileden üç benzer etkilenmiş fetusta USP14 geninde çerçeve kaymasına neden olan homozigot bir varyant saptandı. Olgulardaki fenotipin literatürdeki Usp14-mutant fare modelleri ile benzerliği ve çalışmamız kapsamında yapılan RT-qPZR deneyleri, saptadığımız varyantın yeni bir MCC fenotipi ile ilişkisini güçlü bir şekilde destekledi. Böylelikle TED analizi ile kohortun %81,8'inde moleküler etiyoloji belirlenmiş oldu. Çalışmamız, tamamı fetal olgulardan oluşan ilk MCC kohort çalışmasıdır. Elde edilen veriler ile; letal MCC fenotiplerinde klinik ve moleküler spektrum genişletilmiş, genotip-fenotip korelasyonuna katkıda bulunulmuş ve USP14-ilişkili ilk insan fenotipi tanımlanmıştır.
Özet (Çeviri)
Multiple congenital contractures (MCC), alternatively referred to as arthrogryposis multiplex congenita, is a phenotypic descriptor implying congenital contractures in two or more body areas. Whole exome sequencing (WES) provides an effective approach for elucidating the molecular basis, considering the presence of genetic and phenotypic heterogeneity. We aimed to identify the molecular etiology in fetuses within the lethal MCC spectrum, using WES. 15 patients from 11 families displaying MCC were enrolled. WES analysis was performed in 11 index cases that had normal array-CGH results. Sanger sequencing was performed for validation and segregation of the variants. Eight families were shown to harbor known or novel candidate variants in COG6, NEB, RAPSN, KIAA1109, DOK7, HSPG2, and PSAT1. Three patients manifested with blended phenotypes, harboring additional biallelic variants in VPS13B, DNAH9, and USH2A. Moreover, we identified a frameshift variant in USP14 in three similarly affected fetuses. The resemblance of the fetal findings to the previously reported Usp14-/- mouse models and RT-qPCR performed in our study supported that the variant likely led to a novel human MCC phenotype. Overall, molecular etiology was determined in 81.8% of the cohort using WES analysis. This is the first MCC cohort study conducted entirely on fetuses. Our results provide new insights into the clinical and molecular spectrum of lethal MCC phenotypes, expand the genotype-phenotype correlations, and present the first human phenotype that appears to be attributable to a truncating variant in USP14.
Benzer Tezler
- Hidrojen peroksitin düşük sıcaklıkta sıvı yumurtanın bakteriyolojik kalitesi üzerindeki etkisi
Başlık çevirisi yok
MÜGE KASAPUGİL
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADNAN ÜNLÜTÜRK
- Çanakkale ve çevresi carnivora fosilleri paleontoloji, biyostratigrafi paleoekoloji ve paleocoğrafya
Başlık çevirisi yok
FERAL ARSLAN
- Kokareçlerin hijyenik kalitesi ve belirli pişirme tekniklerinin mikroorganizmalar üzerine etkisi
Başlık çevirisi yok
SERTAÇ CEYLAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Gıda MühendisliğiEge ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DENİZ GÖKTAN
- Değişik kaynaklardan temin edilen etlerin mikrobiyolojik kalite kontrolleri üzerinde araştırma
Başlık çevirisi yok
BENGÜ KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AHMET AKIN
- 1978-1987 yılları arasında izlenen 33 cushing sendromu olgusunun incelenmesi
Başlık çevirisi yok
METİN CANER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Endokrinoloji ve Metabolizma Hastalıklarıİstanbul Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. H. HÜSREV HATEMİ