Geri Dön

Testing the activity of biguanide derivatives and some novel molecules against SARS-CoV-2, in silico study

Bıguanide türevleri ve bazı yeni moleküllerin SARS-CoV-2'ye karşı etkinliklerinin siliko çalışmasında test edilmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 745578
  2. Yazar: MOHAMMED EFENDİ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TUĞBA TAŞKIN TOK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Biguanidler, COVID 19, Fitokimyasallar, Moleküler modelleme, SARS virüsü, Biguanides, COVID 19, Phytochemicals, Molecular modeling, SARS virus
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

SARS-CoV-2 proteinleri, ana proteaz (MPro), papain benzeri proteaz (PLPro) ve RNA'ya bağımlı RNA polimeraz (RdRp) dahil olmak üzere bu virüsün replikasyon sürecinden sorumlu ana faktörlerdir. Çalışmamızla, biguanid türevlerinin ve Kamerun bitkilerinden elde edilen bazı fitokimyasalların bu hedeflere karşı etkinliğini araştırmak için moleküler yerleştirme uygulayarak bu proteinlerin rollerini engellemeyi amaçlıyoruz, daha sonra en iyi yerleştirme sonuçlarının komplekslerinin stabilitesini araştırmak için moleküler dinamik simülasyon yöntemi uygulanır. Ayrıca daha iyi sonuçlar elde etmek için biguanid türevlerini in-silico değiştiririz, son adım olarak, iyi yerleştirme sonuçları gösteren modifiye edilmiş bileşiklere Emilim, Dağılım, Metabolizma, Boşaltım ve Toksisite testi (ADMET) uygularız. Çalışmamız sonucunda fenformin RdRp proteinine karşı inhibisyon rolü oynamış, PLPro'ya karşı proguanil kullanılması önerilmiş ve Mpro'ya karşı Pycnanthuquinone B iyi sonuç vermiş, aynı zamanda modifiye edilmiş 10 bileşiğimiz bunlara karşı umut verici sonuçlar vermiştir. hedefler, bu nedenle bu aktiviteyi araştırmak için diğer ilaç geliştirme adımları uygulanabilir.

Özet (Çeviri)

SARS-CoV-2 proteins are the main factors responsible for the replication process of the virus, including main protease (MPro), papain like protease (PLPro) and RNA dependent RNA polymerase (RdRp). Through our study, we aim to inhibit the roles of these proteins, by applying molecular docking to investigate the effectiveness of biguanide derivatives and some phytochemicals extracted from Cameroonian plants against these targets, then a molecular dynamic simulation method was applied to investigate the stability of the complexes of best docking results. Also, in silico we modified biguanide derivatives to get better results, and as the last step, we applied Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion and Toxicity test (ADMET) to these modified compounds which showed good docking results. As a result of our study, phenformin played an inhibition role against RdRp protein, proguanil was recommended for use against PLPro, and Pycnanthuquinone B had a good result against Mpro, at the same time, 10 of our modified compounds gave promise results against these targets, so other drug development steps could be applied to investigate this activity.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    807756

    Üniversite öğrencilerinde fiziksel aktivite durumları ve fiziksel aktivite engelleri üzerinde psikolojik sağlığın aracılık etkisinin yapısal eşitlik modeli ile test edilmesi

    Testing the mediation effect of psychological health on physical activity status and physical activity barriers in university students with structural equation model

    RABİA CEMRE İNCE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    PsikiyatriÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Hemşirelik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. SONGÜL KAMIŞLI

  2. Tez No

    641791

    Spondiloartrit hastalarında fekal kalprotektin testinin hastalık aktivitesi ile ilişkisinin incelenmesi ve bir biyobelirteç olarak kullanılabilirliğinin test edilmesi

    Investigation of the relationship between fecal calprotectin test and disease activity in spondyloarthritis patients and testing its usability as a biomarker

    ERTAN SARSILMAZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    İç HastalıklarıEge Üniversitesi

    İç Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ FİGEN YARGUCU ZİHNİ

  3. Tez No

    1005511

    Car-t hücrelerin allojenik kullanımının araştırılması ve anti kanser etkinliğinin test edilmesi

    Investigation of the allogeneic use of car-t cells and testing of thei̇r anti̇-cancer activity

    TARIK TEYMUR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    BiyolojiÜsküdar Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ CİHAN TAŞTAN

  4. Tez No

    336997

    Hidrojen depolanmasında dimetilamin-boranın dehidrojenlenmesini katalizleyecek nikel nanopartiküllerinin sentezi, tanımlanması ve katalitik aktivitesinin sınanması

    Synthesized Ni (0) nanoparticles catalyst as non-solvent was used in the synthesis, identification and testing of catalytic activity of nickel nanoparticles catalyzed dehydrogenation of the dimethylamine-borane in the hydrogen storage

    HAKAN DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    KimyaBingöl Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. SİBEL DUMAN

  5. Tez No

    60174

    Yüzey dezenfektanlarının bakterisidal etkinliğini belirlemede kapasite, taşıyıcı ve süspansiyon yöntemlerinin karşılaştırmalı değerlendirilmesi

    Comparative evalution of capacity, carrier and suspension methods for testing the bactericidal activity of surface disinfectants

    ÖZGEN ALPAY ÖZBEK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    1997

    MikrobiyolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YUSUF HAKAN ABACIOĞLU

Geri Dön