Türkiye'de yayılış gösteren Bornmuellera hausskn. (Brassicaceae) türlerinin kloroplast DNA (cpDNA) trnL-intron, trnL-F, trnQ-rps16, rbcL bölgelerine dayalı filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of bornmuelera hausskn. (brassicaceae) species growing in Turkey using chloroplast DNA (cpDNA) trnL-intron, trnL-F, trnQ-rps16, rbcL regions
- Tez No: 747368
- Danışmanlar: DOÇ. DR. EMRE SEVİNDİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Ziraat, Biotechnology, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Bitkisel Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Amaç: Bu çalışmada Anadolu'da yetişen Bornmuellera türlerinin trnL-F, trnL intron, trnQ-rps16 ve rbcL bölgeleri baz alınarak filogenetik analizi yapılmıştır. Materyal ve Yöntem: Çalışma materyalleri Bornmuellera cappadocia, Bornmuellera glabrescens, Bornmuellera kiyakii, Bornmuellera angustifolia türlerinin örneklerini içermektedir. Toplanan örnekler, Flora of Turkey'den teşhis anahtarına bakılarak Doç. Dr. Mehmet Yavuz PAKSOY tarafından teşhis edilmiştir. Bornmuellera türleri laboratuvara getirilmiş, bir kısmı genomik DNA izolasyonu için kullanılmış ve bir kısmı da herbaryum örneği olarak muhafaza edilmiştir. Bulgular: MEGA 6.0 programı hem filogenetik analizlerde hem de genetik uzaklıkların tespitinde kullanılmıştır. trnL-F bölgesi için ortalama nükleotid bileşimi %73.4 (A+T), %26 (G+C) olarak belirlendi. trnL intron için %62,9 (A+T), %37 (G+C), trnQ-rps16 için %70.1 (A+T), %70,1 %29,9 (G+C) ve rbcL için %55.6 (A + T), %44.4 (G+C) içeriği belirlendi. trnL intron bölgesi için en düşük mesafe 0.003, en yüksek mesafe 0.029 olarak bulundu. trnL-F bölgesi için en düşük mesafe 0.012, en yüksek mesafe 0.038 olarak bulundu. trnQ-rps16 bölgesi için en düşük mesafe 0.022, en yüksek mesafe 0.052 olarak bulundu. rbcL bölgesi için en düşük mesafe 0,002, en yüksek mesafe ise 0,005 olarak bulundu. Sonuç: Çalışmadan elde edilen veriler sonucunda Bornmuellera türleri bir grup halinde toplanmıştır. trnL-F ağacında hem 4 Anadolu Bornmuellera türü hem de 4 Balkan Bornmuellera türü aynı grup bulunmuştur. Geçmiş yıllarda yapılan çeşitli filogenetik çalışmalarda Bornmuellera türlerinin tek grup halinde ortaya çıkması çalışmamızı desteklemiştir.
Özet (Çeviri)
Objective: In this study, phylogenetic analysis of Bornmuellera species grown in Anatolia was conducted based on trnL-F, trnL intron, trnQ-rps16 and rbcL regions.. Material and Methods: The study materials included the specimens of Bornmuellera cappadocia, Bornmuellera glabrescens, Bornmuellera kiyakii, Bornmuellera angustifolia species. The collected specimens, by looking at the identification key from Flora of Turkey were identified by Assoc. Dr. Mehmet Yavuz PAKSOY. Bornmuellera species were brought to the laboratory, some of them were used for genomic DNA isolation and some of them were preserved as herbarium specimens. Results: MEGA 6.0 program was used both phylogenetic analyzis and the detection of genetic distances. For the trnL-F region, the mean nucleotide composition was determined as 73.4% (A+T), 26% (G+C). For the trnL intron, 62.9% (A+T), 37% (G+C), for trnQ-rps16, 70.1% (A+T), 70.1% 29.9% (G+C) and for rbcL 55.6% (A + T), %44.4% (G + C) content were determined. The lowest distance for the trnL intron region was found 0.003 while the highest distance was 0.029. The lowest distance for the trnL-F region was found 0.012 while the highest distance was 0.038 The lowest distance for the trnQ-rps16 region was found 0.022 while the highest distance was 0.052. The lowest distance for the rbcL region was found 0.002 while the highest distance was 0.005. Conclusion: As a result of the data obtained of the study, Bornmuellera species were collected in a group. In the trnL-F tree, both 4 Anatolian Bornmuellera species and 4 Balkan Bornmuellera species a same group were found. The emergence of Bornmuellera species in a single group in various phylogenetic studies conducted in the past years supported our study.
Benzer Tezler
- Türkiye'nin kuzeydoğusunda yayılış gösteren Asteraceae'den Psephellus cass. cinsine ait bazı türler üzerinde taksonomik araştırmalar
Taxonomic research on some species of Psephellus genus from Asteraceae distributing in the northeast of Türkiye
ZOHREH YOUSEFI
- Türkiye'de yayılış gösteren Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) ve Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) zehirlerinin karşılaştırmalı proteomik karakterizasyonu, koagülasyon üzerindeki etkilerinin ve sitotoksisitelerinin belirlenmesi
Comparative proteomic characterization of the venom of Macrovipera lebetina (Linnaeus, 1758), Montivipera xanthina (Gray, 1849) and Vipera ammodytes (Linnaeus, 1758) distributed in Turkey and determination of their effects on coagulation and cytotoxicity
NAŞİT İĞCİ
Doktora
Türkçe
2015
BiyokimyaAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FATMA DUYGU ÖZEL DEMİRALP
PROF. DR. BAYRAM GÖÇMEN
- Türkiye'de yayılış gösteren su sıçanı Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populasyonlarının MtDNA (Sitokrom B ve kontrol bölgesi) varyasyonları
MtDNA (Cytochrome B and control region) variations of water vole Arvicola amphibius (Linnaeus, 1758) (Mammalia: Rodentia) populations distributed in Turkey
PERİNÇEK SEÇKİNOZAN ŞEKER
- Türkiye'de yayılış gösteren Ramalina (Ach.) cinsine ait bazı türlerin morfo-anatomik karakterleri ve multilokus moleküler sekans analizleri ile modern revizyonu
Modern revision of the genus Ramalina (Ach.) in Turkey using morpho-anatomical characters and multilocus molecular sequence analyses
BETÜL PATAT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiErciyes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET GÖKHAN HALICI
- Türkiye'de yayılış gösteren dört endemik hyacinthella Schur türünün karyolojik yönden incelenmesi
Karyological investigation of four endemic hyacinthella Schur species distributed in Turkey
SELÇUK KILIÇ