Geri Dön

Klinik candida ve aspergillus suşlarının antifungal duyarlılık profillerinin matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçuş zamanı kütle spektrometresi ('MALDİ-TOF MS') yöntemi ile değerlendirilmesi

Evaluation of antifungal susceptibility profiles of clinical candida and aspergillus strains by matrix assisted laser desorption/ionization time-of-FLİGHT MASS spectrometry ('MALDİ-TOF MS') method

PDF İndir

  1. Tez No: 749371
  2. Yazar: İLKE TOKER ÖNDER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. SEVTAP ARIKAN AKDAĞLI
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 103

Özet

Dirençli Candida ve Aspergillus türlerinin neden olduğu invaziv mantar enfeksiyonları küresel bir halk sağlığı sorunudur. Antifungallere direncin giderek arttığı göz önüne alındığında antifungal duyarlılık testi (AFDT) giderek daha önemli hale gelmekte ve hızlı sonuç veren yöntemlere ihtiyaç duyulmaktadır. Bu çalışmada, Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikoloji Laboratuvarı'nda hasta örneklerinden izole edilen Candida ve Aspergillus suşlarının tedavide sıklıkla kullanılan azol ve ekinokandin grubu antifungal ilaçlara duyarlılıklarının MALDI-TOF MS yöntemi ile saptanarak elde edilen sonuçların EUCAST referans sıvı mikrodilüsyon yöntemi sonuçları ile karşılaştırılması ve böylece, MALDI-TOF MS yönteminin in vitro antifungal duyarlılık profillerinin saptanmasındaki doğruluğunun ve tekrarlanabilirliğinin tespit edilmesi amaçlanmıştır. 40 Candida glabrata izolatının anidulafungin ve flukonazol, 40 Candida albicans ve 40 Candida parapsilosis izolatının flukonazol, 4 Aspergillus fumigatus izolatının vorikonazol duyarlılıkları test edilmiştir. Candida izolatları“yüksek”ve“sınır değer”olarak iki farklı antifungal konsantrasyonunda ve ilaçsız kontrolde 3 saat inkübe edilmiştir (Anidulafungin: 16, 0.06, 0 mg/L; Flukonazol: 256, 16, 0 mg/L). A. fumigatus izolatları seri vorikonazol konsantrasyonlarında (32-0.03 mg/L) ve ilaçsız kontrolde 15 saat inkübe edilmiştir. Bu konsantrasyonlardan elde edilen MALDI-TOF MS spektrumları ile her izolat için ayrı bileşik korelasyon indeksi (CCI) matrisi oluşturulmuştur. Candida türleri için sınır değerdeki ve en yüksek ilaç konsantrasyonundaki spektrumların korelasyonundan elde edilen CCI değeri ortalaması, sınır değer ve ilaçsız kontrolden elde edilen CCI değeri ortalamasından yüksek olduğunda, suş ilaca duyarlı olarak sınıflandırılmıştır. A. fumigatus için maksimum vorikonazol konsantrasyonu spektrumuyla olan benzerliği, ilaçsız kontrol spektrumuyla benzerliğinden fazla olan ilk spektrumun ilaç konsantrasyonu minimum profili değiştiren konsantrasyon (MPCC) olarak belirlenmiştir. Sınıflandırmalar EUCAST sıvı mikrodilüsyon yöntemine göre elde edilen minimum inhibitör konsantrasyonların duyarlı veya dirençli sınıflandırmalarıyla karşılaştırılmıştır. Genel olarak MS-AFDT ve EUCAST AFDT arasındaki uyum %60 ila %85 arasında değişmiştir ve en yüksek oranda C. glabrata için anidulafungine karşı olmuştur. MS-AFDT testinin tekrarlanabilirliği %45 ila %75 arasında değişmiştir ve C. parapsilosis flukonazol duyarlılık testi en tutarlıdır. 4 A. fumigatus suşu için uyum ve tekrarlanabilirlik tam olarak bulunmuştur. Sonuçlar, daha ileri çalışmalarla metodolojinin iyileştirilmesi ve testin tekrarlanabilirliğinin geliştirilmesiyle birlikte MALDI-TOF MS'nin Candida ve Aspergillus türlerinde tanımlama ve antifungal duyarlılık sınıflaması için aynı anda kullanılabileceğini göstermektedir.

Özet (Çeviri)

Invasive fungal infections caused by resistant Candida and Aspergillus species are a global public health problem. Considering the increasing resistance to antifungals, antifungal susceptibility tests (AFST) are becoming increasingly important, and rapid methods are needed. The aim of this study is to determine the azole and echinocandin susceptibilities of clinical Candida and Aspergillus strains isolated at Hacettepe University Faculty of Medicine Medical Mycology Laboratory by using MALDI-TOF MS and compare the results with those obtained by the EUCAST reference broth microdilution method for assessment of the accuracy and reproducibility of MALDI-TOF MS for evaluation of in vitro antifungal susceptibility. In this study, the susceptibilities of 40 Candida glabrata isolates for anidulafungin and fluconazole, 40 Candida albicans and 40 Candida parapsilosis isolates for fluconazole and 4 Aspergillus fumigatus isolates for voriconazole were tested. Candida isolates were incubated for 3 hours at two different antifungal concentrations as“maximum”and“breakpoint”and in the drug-free control (Anidulafungin: 16, 0.06, 0 mg/L; Fluconazole: 256, 16, 0 mg/L). A. fumigatus isolates were incubated at serial voriconazole concentrations (32-0.03 mg/L) and in the drug-free control for 15 hours. The MALDI-TOF MS spectra obtained from these concentrations were used to create the composite correlation index (CCI) matrices for each isolate. For Candida species, the strains whose“mean CCI of the breakpoint/maximum concentration”was higher than the“mean CCI of the breakpoint/null concentration”were classified as susceptible. For A. fumigatus, the lowest drug concentration at which the spectrum was more similar to the one observed at the maximum drug concentration than that in the drug-free control was defined as the minimum profile changing concentration (MPCC). Classifications defined by the MS-AFST method were compared with categorizations of susceptible or resistant based on the EUCAST broth microdilution method. Overall, the agreement between MS-AFST and EUCAST AFST ranged from 60% to 85%, with the highest percentage in the C. glabrata and anidulafungin group. The reproducibility of the MS-AFST assay ranged from 45% to 75% and is best for C. parapsilosis and fluconazole group. Full agreement and reproducibility were observed for four A. fumigatus strains. In conclusion, the MALDI-TOF MS method can be used simultaneously for both identification and antifungal susceptibility categorization in Candida and Aspergillus species if further studies are conducted to improve the methodology and the reproducibility of the test.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    201954

    Kaspofunginin Candida glabrata'nın klinik izolatlarına karşı vorikonazol, flukonazol, itrakonazol ve amfoterisin B ile kombinasyonlarinin time-kill metodu, e-test metodu (iki farklı yöntemle) ve disk difüzyon yöntemleriyle in vitro etkilerinin değerlendirilmesi

    The evaluation of in vitro effects by using the method of time-kill, e-test (two different methods) and disk diffusion in dual combination of caspofungin with itraconazole, voriconazole, fluconazole or amphotericin B against clinical isolates of Candida glabrata

    İLKNUR DAĞ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2007

    BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. NURİ KİRAZ

    YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA YAMAÇ

  2. Tez No

    440058

    Solunum yollarından izole edilen pseudomonas, aspergillus ve candida suşlarının virülans faktörlerinin araştırılması

    İnvestigation of the virulence factors of pseudomonas, aspergillus and candida strains i̇solated from respiratory tract

    BEDRİYE NAZLI GENÇ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıMarmara Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞEGÜL KARAHASAN

  3. Tez No

    303344

    Renal transplant hastalarında görülen fungal enfeksiyonların retrospektif olarak incelenmesi

    A Retrospective Evaluation of Fungal Infections in Renal Transplant Recipients

    SEZİN ZORLU ŞAHİN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıUludağ Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİN HALİS AKALIN

  4. Tez No

    409361

    Hematolojik malignite ve kök hücre nakil alıcılarında invaziv fungal enfeksiyon spektrumu ve antifungal kullanım pratikleri

    Epidemiology of invasive fungal infections and antifungal treatment practices in hematological malignancy patients

    YEŞİM YILDIZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıGazi Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESİN ŞENOL

  5. Tez No

    484148

    Sistemik mantar enfeksiyonu şüpheli hastaların klinik örneklerinden çeşitli yöntemlerle mantarların araştırılması

    Investigation of fungi from clinical specimens of patients with suspected systemic fungal infection by various methods

    HAFİZE SAV

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    MikrobiyolojiErciyes Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE NEDRET KOÇ

Geri Dön