Investigation of the function of vinculin and its isoform in muscle cells
Kas hücrelerinde vinkülin ve izoformunun incelenmesi
- Tez No: 751081
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ZEYNEP ASLIHAN DURER
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Acıbadem Mehmet Ali Aydınlar Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Medikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 76
Özet
Dünya Sağlık Örgütü'ne göre dünyada en çok kardiyak hastalıklardan ölüm gerçekleşmektedir. Türkiye İstatistik Kurumu (TUIK) da ölüm verileri içinde kalp hastalıklarının yüzdesinin gittikçe arttığını belirtmiştir. Kalp hastalıkları 1989'da %40, 1993'te %45, 2009'da %40, 2013'te %39,6 ve 2014 yılında %40,4 ile tüm ölüm nedenleri arasında birincidir. Kardiyomiyopati, kalp hastalıklarının önemli bir bölümünü oluşturan bir kalp kası hastalığıdır. Hem dilate hem de hipertrofik kardiyomiyopatilerle ilişkili genlerden biri, vinkülin proteinini kodlayan VCL'dir. Vinkülin, aktin hücre iskeletinin adezyon reseptörlerine bağlanmasında rol oynayan bir adaptör proteindir. Vinkülin, hücre dışı matristen sitoplazmaya kuvvet iletiminde işlev gören fokal adezyonlarda zenginleşmiş ve yaygın olarak bulunan bir proteindir. Vinkülinin kasa özgü bir izoformu olan metavinkülin, kostamerler, interkalasyonlu diskler ve yoğun plaklar dahil olmak üzere hücre yapışma noktalarında vinkülin ile birlikte bulunur. Metavinkülinin kas hücrelerinde hangi işlevi yerine getirdiği bilinmemesine rağmen, metavinkülin spesifik bölgesindeki nokta mutasyonları kalp hastalıkları ile ilişkilendirilmiştir. Bu çalışmanın amacı, bir kalp kası hücre hattında metavinkülinin aktin hücre iskeletini, fokal adezyonları ve hipertrofi yanıtını nasıl etkilediğini araştırılmasıdır. Bu kapsamda fare embriyonik kalp hücresi olan H9C2 hücre hattında metavinkülin ve vinkülin transfeksiyonu gerçekleştirilmiş ve transfekte hücre morfolojisindeki değişiklikler konfokal mikroskopi ve fokal adezyon analizi ile incelenmiştir. Protein seviyesindeki değişiklikleri tespit etmek için Western blot deneyleri yapılmıştır. Sonuç olarak, H9C2 hücrelerine hipertrofi ve fokal adezyon analiz yöntemleri başarıyla uygulandı ve vinkülin ve metavinkülinin hücre iskeleti organizasyonu üzerindeki etkileri gözlemlendi.
Özet (Çeviri)
According to the World Health Organization, most deaths occur from cardiac diseases in the world. The Turkish Statistical Institute (TUIK) also stated that the percentage of heart diseases in mortality data is increasing gradually. Heart diseases are the first among all causes of death with 40% in 1989, 45% in 1993, 40% in 2009, 39.6% in 2013 and 40.4% in 2014. Cardiomyopathy is a disease of the heart muscle that accounts for a significant portion of heart diseases. One of the genes associated both with dilated and hypertrophic cardiomyopathies is VCL that encode for vinculin protein. Vinculin is an adaptor protein involved in the linkage of actin cytoskeleton to adhesion receptors. Vinculin is a ubiquitous protein enriched in focal adhesions functioning in transmission of force from the extracellular matrix to the cytoplasm. Metavinculin, a muscle-specific isoform of vinculin, is also found with vinculin at cell adhesion points including costameres, intercalated discs, and dense plaques. Point mutations in the metavinculin specific region have been linked to heart disease, despite the fact that it is unknown what function metavinculin performs in muscle cells. The aim of this study was to investigate how metavinculin affects actin cytoskeleton, focal adhesions and hypertrophy response in a cardiac muscle cell line. In this context, metavinculin and vinculin transfection were performed in the H9C2 cell line, which is a mouse embryonic heart cell, and the changes in transfected cell morphology were examined by confocal microscopy and focal adhesion analysis. Western blot experiments were performed to detect changes in protein level. In conclusion, hypertrophy and focal adhesion analysis methods were successfully applied to H9C2 cells and the effects of vinculin and metavinculin on cytoskeletal organization were observed.
Benzer Tezler
- Investigation of the role of LAP1B in transcriptional regulation of muscle cells
LAP1B proteinin kas hücrelerinin transkripsiyon regülasyonundaki rolünün araştırılması
GÜLSÜM KAYMAN KÜREKÇİ
Doktora
Türkçe
2021
Tıbbi BiyolojiHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PERVİN RUKİYE DİNÇER
- Furanın sertoli hücre fonksiyonu üzerine etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of furan on sertoli cell function
YASEMİN ÜLKÜ DİKBASAN
- Investigation of the effect of ATP13A2 (PARK9) frameshift mutation on the protein function
ATP13A2 (PARK9) çerçeve kayması mutasyonunun protein fonksiyonuna etkisinin incelenmesi
KORAY KIRIMTAY
Doktora
İngilizce
2021
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ARZU KARABAY KORKMAZ
- Fisetin ve mirisetin flavonoidlerinin Caernorhabditis elegans' ta yaşam uzunluğu ve stres direncine etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of fisetin and myricetin flavonoids on lifespan and stress resistance in Caernorhabditis elegans
SEREN ÇELİKEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiAkdeniz ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MEHMET AKİF KILIÇ
- Akut stroklu hastalarda otonom sinir sistemi fonksiyonunun immun yanıt ve prognoz ile ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relation between the function of autonomic nervous system and immune response and prognosis of acute stroke patients
BURHANETTİN ÇİĞDEM
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
NörolojiCumhuriyet ÜniversitesiNöroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SUAT TOPAKTAŞ