Geri Dön

Karaciğer kanser kök hücre belirteçlerini tek hücre RNA dizilimi (SCRNA-SEQ) analizi ile saptama

Detection of liver cancer stem cell markers by single cell RNA sequence (SCRNA-SEQ) analysis

PDF İndir

  1. Tez No: 752923
  2. Yazar: EBRU KOCAKAYA
  3. Danışmanlar: PROF. DR. KAMİL CAN AKÇALI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Moleküler Tıp, Biology, Molecular Medicine
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Disiplinlerarası Kök Hücre ve Yenileyici Tıp Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 80

Özet

2020 yılı verilerine göre en ölümcül üçüncü kanser türü karaciğer kanseridir. Kanser türüne değil, hastaya göre şekillenen kişiselleştirilmiş tedavi planı gibi yaklaşımlarla son yıllarda kanser tedavisinde önemli yol kat edilmiştir. Fakat tümör dokusu heterojendir; bağışıklık sistemi hücreleri, bağ doku hücreleri, kanser hücreleri vb. çok farklı hücre tiplerini içinde barındırır. Bu heterojen tümör dokusunu kanser kök hücresi adı verilen, bölünme yeteneğine sahip hücrelerin meydana getirdiği düşünülmektedir. Bu teoriye kanser kök hücre teorisi denir. Günümüzde kanser kök hücrelerinin tespitinde kullanılan evrensel bir belirteç yoktur; belirteçler kişiden kişiye ve kanser bazında değişiklik gösterir. Bundan yola çıkarak, bu tezde kanserin tedavisi için evrensel belirteç veya belirteçlerin bulunması hedeflenmiştir. Yeni belirteç bulmak için biyoinformatik araçlardan faydalanılacaktır. Her hücrenin gen ifade profiline tek tek ulaşmayı sağlayan Tek Hücre RNA Dizilimi analizi, çok büyük verilerin analizini hızlı bir şekilde yapabilen çok güçlü bir biyoinformatik araçtır. Tek Hücre RNA Dizilimi analizi yapılarak heterojen hücre topluluğu içinden kanser kök hücrelerini saptayıp, yeni aday belirteçler bulunacaktır. Belirlenen aday belirteçler karaciğer kanser hücre hatları ile fibrotik karaciğer hücre hattında karşılaştırılarak valide edilecektir.

Özet (Çeviri)

Liver cancer is the third most deadly cancer type in the world according to the study done in 2020. In recent years, significant progress has been made in cancer treatment with approaches like personalized medicine, which is planned according to the patient, not the type of cancer. However, tumor tissue is heterogenous: it contains various cell types like immune system cells, connective tissue cells, cancer cells, etc. According to the cancer stem cell theory, this heterogeneous tumor tissue is formed by cells with the ability to divide, called cancer stem cells. Currently, there are no universal marker used for the detection of cancer stem cells; the markers vary from person to person and on the type of cancer. So, in this thesis, it is aimed to find a universal marker or markers for the treatment of cancer. Bioinformatic tools will be used to find new markers. Single Cell RNA Sequencing analysis, which provides access to the gene expression profile of each cell individually, is a powerful bioinformatics tool that can quickly analyze large data. By performing Single Cell RNA Sequencing analysis, cancer stem cells will be detected from the heterogeneous cell population and new candidate markers will be identified. Following the identification, gene expression levels of these candidate markers will be validated by comparing them in liver cancer cell lines and fibrotic liver cell line.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    867050

    Assessment of the effects of melatonin on the funtional deficits induced by cellular stress in obese donor derived mesenchymal STEM cells

    Melatonin'in obez donor mezenkimal kök hücrelerinde hücresel strese bağlı olarak oluşan fonksiyon bozuklukları üzerindeki etkilerinin değerlendirilmesi

    ECE GİZEM POLAT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyolojiHacettepe Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FATİMA SUSANNA FAUSTINA AERTS KAYA

  2. Tez No

    468319

    ALDH pozitif CD44 pozitif CD24 negatif MCF-7 meme kanseri hücrelerinin proliferasyonunda rol oynayan genlerin siRNA ile susturulması

    Sirna silencing of the genes playing role in the proliferation of ALDH positive CD44 positive CD24 negative MCF-7 breast cancer cells

    GAMZE ÖNECEK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyoteknolojiSelçuk Üniversitesi

    Nanoteknoloji ve İleri Malzemeler Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAMDİ ŞÜKÜR KILIÇ

  3. Tez No

    406411

    The use of nanoparticle labeling in cellular tracking

    Hücre takibinde nanoparçacık işaretlenmesinin kullanımı

    ECE AKHAN GÜZELCAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. IŞIK YULUĞ

    PROF. DR. KAMİL CAN AKÇALI

  4. Tez No

    833820

    Hepatoselüler kanser nedeniyle karaciğer nakli yapılan hastaların tümör dokularında kanser kök hücre yüzey belirteçlerinin araştırılması ve bu belirteçlerin prognoza etkisinin değerlendirilmesi

    Investigation of cancer stem cell surface markers in tumor tissues of patients who underwent liver transplantation due to hepatocellular cancer and evaluation of the effect of these markers on prognosis

    TUFAN EGELİ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    OnkolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Onkoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. HÜLYA ELLİDOKUZ

  5. Tez No

    848478

    Çip üzerinde karaciğer kanseri platformunda ilaca bağlı karaciğer endotel hasarının incelenmesi

    Investigation of drug-induced liver endothelial damage by using a liver cancer-on-chip platform

    NIGAR GASIMZADE

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiEskişehir Osmangazi Üniversitesi

    Kök Hücre Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. HÜSEYİN AVCI

Geri Dön