Hayvansal orijinli salmonella typhimurium ve salmonella kentucky serotiplerinde antibiyotik direncinin konvansiyonel ve moleküler yöntemlerle saptanması
Determination of antibiotic resistance in salmonella typhimurium and salmonella kentucky serotypes of animal origin using conventional and molecular methods
- Tez No: 753482
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET AKAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Tüm dünyada olduğu gibi ülkemizde de antimikrobiyal direnç, üzerinde önemle durulan konular arasında yerini almaktadır. Antibakteriyel ilaçlara karşı direnç hem insan hem de çiftlik hayvanlarında ciddi bir sorun haline gelmiştir. Bu tez çalışmasının amacı; S. Typhimurium ve S. Kentucky serovarlarında antibiyotik dirençliliğinin konvansiyonel ve mokeküler yöntemler ile belirlenmesi amaçlandı. Bu tez çalışmasında Türkiye'de farklı hayvansal orijinli 60 adet Salmonella Typhimurium ve 90 adet Salmonella Kentucky serovarlarının sefotaksim, seftazidim, kloramfenikol, tetrasiklin, gentamisin, nalidiksik asit, siprofloksasin, sülfonamid, trimetoprim/sülfametoksazol, streptomisin, sefoksitin, meropenem karşı antimikrobiyal duyarlılık testi Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlendi. Salmonella suşlarında sul1, sul2, tetA, tetB, strA, strB, aadA1, aadA2 ve flo antimikrobiyal direnç genleri konvansiyonel PCR yöntemleri ile araştırıldı. S. Kentucky suşları %82,2 streptomisin, %71,1 nalidiksik asit, %67,8 siprofloksasin, %60 ampisilin, %57,8 gentamisin, %56,7 sulfanamid, %50 tetrasikline dirençli olduğu tespit edildi. Buzağı ve süt ineğinden izole edilen S. Kentucky suşlarının hepsi %100 siproflaksine ve nalidiksik asite, %95,8 streptomisin, %95 sulfanamid, %91,6 ampisilin, tetrasiklin ve gentamisine dirençli olduğu tespit edildi. Kanatlı hayvanlarda %78,7 streptomisin, %60,6 nalidiksik asit, %56 siprofloksasin, %48,8 ampisilin, %45 gentamisin, %42 sulfanamid, %34 tetrasikline dirençli olduğu tespit edildi. S. Kentucky suşlarının %62,2'si çoklu antibiyotiğe dirençli olduğu belirlendi. Bu sonuçlar çoklu ilaç direnç profilleri sergileyen ve siprofloksasine dirençli S. Kentucky suşlarının, gıda güvenliği ve halk sağlığı için önemli bir risk oluşturan S. Kentucky ST198-X1 klonuna ait olabileceğini göstermiştir. S. Typhimurium suşlarının antibitiklere direç oranları sırasıyla %33,3 sulfanamid, %25 ampisilin, %20 streptomisin, %11,7 tetrasiklin, %8,3 nalidiksik asit, %6,7 gentamisin, %5 kloramfenikole direnç oranları tespit edildi. S. Typhimurium suşlarında %66,7 oranında siprofloksasine orta derecede duyarlı olduğu belirlendi. Siprofloksasine karşı orta düzeyde duyarlılık oranının yüksek düzeyde olaması, gelecekte bu antibiyotiğe karşı direnç oranının artacağının göstergesi olması bakımından endişe vericidir. S. Kentucky suşlarında direnç genlerinin prevalansı %37,8 sul1, %7,8 sul2, %45,6 tetA, %35,6 strA, %20 strB, %1,1 flo geni tespit edildi ve aadA1, aadA2 ve tetB geni tespit edilmedi. S. Typhimurium suşlarında %6,7 sul2, %5 sul1, %5 flo, %5 aadA2, %3,3 tetB, %3,3 strB, %1,7 strA geni tespit edilirken aadA1 geni tespit edilmedi. Bu çalışmanın sonuçları, halk sağlığı risklerini en aza indirmek için hayvanlarda antimikrobiyal kullanımının etkilerinin izlenmesinin önemini göstermektedir. Antibiyotik kullanımının gıda üreten hayvanlarda daha dikkatli ve bilinçli olunması gerektiği ortaya kondu. Bu çalışmanın bulguları, Türkiye'de Salmonella serovarlarının antimikrobiyal direnç profillerinin izlenmesinin önemini vurgulamaktadır.
Özet (Çeviri)
Antimicrobial resistance is one of the most important issues in Turkey, similar to other parts of the world. Resistance to antibacterial drugs has become a serious problem in both humans and farm animals. The aim of this thesis study was to determine the antimicrobial resistance profiles of Salmonella Typhimurium and Salmonella Kentucky serovars using the conventional and molecular method. In this thesis, 60 S. Typhimurium and 90 S. Kentucky serovars of different animal origin in Turkey were evaluated in terms of their antimicrobial susceptibility to cefotaxime, ceftazidime, chloramphenicol, tetracycline, gentamicin, nalidixic acid, ciprofloxacin, sulfonamide, trimethoprim/sulfamethoxazole, streptomycin, cefoxitin, and meropenem using the Kirby-Bauer disk diffusion method. In the Salmonella strains, antimicrobial resistance genes sul1, sul2, tetA, tetB, strA, strB, aadA1, aadA2, and flo were investigated with conventional polymerase chain reaction methods. The S. Kentucky strains were found to be resistant to streptomycin at a rate of 85%, nalidixic acid at 73%, ciprofloxacin at 70.1%, ampicillin at 62%, gentamicin at 59.7%, sulfonamide at 58.6%, and tetracycline at 51.7%. All the S. Kentucky strains isolated from calves and dairy cows were resistant to ciprofloxacin and nalidixic acid, 95.8% were resistant to streptomycin, 95% to sulfonamide, and 91.6% to ampicillin, tetracycline, and gentamicin. In poultry animals, the rate of antimicrobial resistance was determined as 78.7% for streptomycin, 60.6% for nalidixic acid, 56% for ciprofloxacin, 48.8% for ampicillin, 45% for gentamicin, 42% for sulfonamide, and 34% for tetracycline. Of the S. Kentucky strains, 63.3% were resistant to multiple antibiotics. These strains exhibiting multi-drug resistance profiles and resistance to ciprofloxacin suggesting that they may belong to the S. Kentucky ST198-X1 clone, which poses a significant risk to food safety and public health. The resistance rates of the S. Typhimurium strains to antibiotics were determined as follows: 33.3% for sulfonamide, 25% for ampicillin, 20% for streptomycin, 11.6% for tetracycline, 8.3% for nalidixic acid, 6.6% for gentamicin, and 5% for chloramphenicol. S. S. It was determined that 66.6% of the S. Typhimurium strains were moderately susceptible to ciprofloxacin. The high level of moderate susceptibility to ciprofloxacin is a concern since it suggests that the resistance rate against this antibiotic may increase in future. The prevalence of the resistance genes in the S. Kentucky strains was as follows: 37.8% for sul1, 7.8% for sul2, 45.6% for tetA, 35.6% for strA, 20% for strB, and 1.1% for flo. The aadA1, aadA2, and tetB genes were not detected in these strains. Among the S. Typhimurium strains, the prevalence of the sul2, sul1, flo, aadA2, tetB, strB, and strA genes was determined as 6.7%, 5%, 5%, 5%, 3.3%, 3.3%, and 1.7%, respectively, while the aadA1 gene was not detected. The results of this study demonstrate the importance of determining the effects of antimicrobial use in animals to minimize public health risks. It was revealed that antibiotics should be used more carefully and consciously in food producing animals. The findings of this study also highlight the necessity of monitoring the antimicrobial resistance profiles of Salmonella serovars in Turkey.
Benzer Tezler
- Tavuk ve insan orijinli Salmonella enterica subspecies Enterica serovar infantis suşlarında antibiyotik direnç genlerinin polimeraz zincir reaksiyonu yöntemi ile araştırılması
Investigation of antibiotic resistance genes in Salmonella enterica subspecies Enterica serovar infantis strains isolated from chicken and human by polimerase chain reaction method
MESUT AKGEYİK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AKAN
- Hayvansal ve bitkisel orijinli hazır kuru çorbaların ICMSF (International Commision on Microbiological Specification for Foods) ve TSE'nün mikrobiyolojik standartlarına uygunluğunun sınanması
Başlık çevirisi yok
İSA ŞEN
Yüksek Lisans
Türkçe
1992
Halk Sağlığıİstanbul ÜniversitesiHalk Sağlığı Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ÖVAT GÜRAY
- Tavuk yumurtalarında salmonella varlığının yetiştirme tipine göre tespiti
Detection of salmonella presence in chicken eggs according to poultry rearing type
SANİYE DOĞAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiGıda Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜZİN İPLİKÇİOĞLU ARAL
- Kanatlı hayvan ve ürünleri kaynaklı salmonellaların serotiplendirilmesi ve genotiplendirilmesi
Serotyping and genotyping of salmonellae of poultry and poultry product origin
ZAFER ATA
Doktora
Türkçe
2016
Besin Hijyeni ve TeknolojisiUludağ ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYŞE GÜL EYİGÖR
- Diyarbakır'da satışa sunulan taze çökelek peynirlerinin mikrobiyolojik kalitesi üzerine bir araştırma
Microbiological quality of Çökelek cheeses as a fresh consuming in Diyarbakır
AYŞE NİLAY ÖNGANER