ING-3 geninin baş boyun kanserlerinde fonksiyonunun araştırılması
Investigation of the functions of ING3 gene in head and neck cancers
- Tez No: 756179
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ÖMER FARUK KARATAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Moleküler Tıp, Onkoloji, Genetik, Molecular Medicine, Oncology, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Genler-ING, Kafa ve boyun neoplazmları, Larinks, Neoplazmlar, Genes-ING, Head and neck neoplasms, Larynx, Neoplasms
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erzurum Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Agresif bir kanser türü olan baş ve boyun kanserleri dünya genelinde en sık tanısı konan kanserler arasındadır. Dünya genelinde baş ve boyun kanserleri 5 yıllık sağkalım oranları %60'lar civarında olmasına rağmen, ülkemizde bu oran dünya ortalamasının oldukça altındadır. Inhibitor of growth protein (ING) ailesi 5 üyeden oluşmaktadır (ING1-5). ING proteinleri çok sayıda hücresel süreçte önemli roller oynamaktadır. Bu nedenle ING genlerinin ifade değişiklikleri tümör oluşumu ile ilişkilendirilebilir. Bu tezde, ING ailesi üyelerinin ifadelerinin analizi ve baş ve boyun kanserlerinden olan larenks kanserinde ING genlerinin prognostik öneminin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu doğrultuda, larenks tümör ve normal doku çiftlerinde rölatif ING gen ailesi ifadesi mRNA seviyesinde gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak, rölatif ING3 ifadesi protein seviyesinde Western blot analizi kullanılarak değerlendirildi. ING genlerinin ifade seviyeleri, genetik değişiklikleri ve sağkalım verileri online veritabanları kullanılarak araştırıldı ve ING3'ün protein etkileşim ağı STRING web portalı kullanılarak ortaya koyuldu. Baş ve boyun kanserlerinde ING3'ün genetik değişiklik oranının oldukça yüksek olduğu gösterildi. ING3'ün hem mRNA hem de protein seviyesinde larenks kanseri doku örneklerinde normal doku örneklerine kıyasla artan ifadeye sahip olduğu doğrulandı. Yüksek ING3 ifadesinin, baş ve boyun kanseri hastalarının hastalıksız sağ kalımı ile ilişkili olduğu gösterildi. Ayrıca, birlikte ifade analizi, EPC1'in önemli ölçüde ING3 ile ilişkili kritik bir gen olduğunu ortaya koydu. Tez kapsamında elde edilen bulgular, ileri evre larenks kanseri vakalarında ING3'ün yüksek düzeyde ifade edildiği ve onkogenik potansiyel sergileyerek larenks kanser gelişim sürecine önemli derecede katkıda bulunduğunu gösterdi. ING3'ün ileri evre larenks kanser hastaları için hayati prognostik önemi, biyobelirteç olarak kullanılabilme potansiyelini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
Among the most often diagnosed tumors worldwide are aggressive cancer forms that affect the head and neck (HNC). The 5-year survival rate for head and neck malignancies in our country is lower than the global average, despite the fact that it is about 60% worldwide. Inhibitor of growth protein (ING) family, is an important class of gene family, which consists of five genes. ING genes play a role in many biological processes. Therefore, altered expression of genes may be associated with tumorigenesis. In this thesis, we examined the relative mRNA expression of ING genes in laryngeal tumor-normal tissue pairings using quantitative real-time polymerase chain reaction, and the relative protein expression of ING3 using Western Blot analysis. We investigated expressions, genetic alterations, survival data for ING family members using various online tools and established a functional protein interaction network of ING3 using STRING web portal. HNCs have a comparatively higher rate of ING3 genetic alterations. ING3 expression was significantly upregulated in larynx cancer tissue samples at both mRNA and protein level compared with normal tissue samples. Poor disease-free survival in HNC patients was likewise associated with higher expression of ING3. Additionally, co-expression study demonstrated that the important ING3-related gene EPC1 significantly linked with the expression of ING3. The findings show that ING3 is highly expressed in advanced larynx cancer cases and contributes significantly to the laryngeal carcinogenesis by exhibiting oncogenic potential. The crucial predictive importance of ING3 in patients with advanced laryngeal carcinoma demonstrates its potential for application as a biomarker.
Benzer Tezler
- Baş ve boyun kanserli hastalarda LKB1 geninin araştırılması
Investigation of gene LKB1 in head and neck cancer patients
EBRU KENANLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Genetikİstanbul ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TURGUT ULUTİN
- Baş boyun kanserli hastalarda RASSF4 geninin incelenmesi
Investigation of RASSF4 gene in head and neck cancer patients
EMİNE HANDE KARAGEDİK
Doktora
Türkçe
2019
Moleküler Tıpİstanbul ÜniversitesiMoleküler Tıp Ana Bilim Dalı
PROF. DR. HAYRİYE ARZU ERGEN
- 5-fluorourasil toksisitesinin farmakogenetik yönden araştırılması
Investigation of 5-fluorouracil toxicity in respect of pharmacogenetics
NAZAN YÜCE
Yüksek Lisans
Türkçe
2004
Eczacılık ve FarmakolojiAnkara ÜniversitesiFarmasötik Toksikoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. SİNAN SÜZEN
- Balıkçı gemilerin baştan gelen dalgalarda hareketlerinin regrasyon analizi ve incelenmesi
The Study of motions of trawler fishing boats in head sears by regression analysis
MUHSİN AYDIN
- Investigation of the turning performance of a surface combatant with urans
Bir su üstü savaş gemisinin dönme performansının urans kullanılarak incelenmesi
SÜLEYMAN DUMAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Gemi Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGemi İnşaatı ve Gemi Makineleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞAKİR BAL