Acinetobacter baumannii'nin colistin dirençli ve duyarlı suşlarının metabolomik profil karşılaştırması
Metabolomic profile comparison of colistin resistant and susceptible strains of acinetobacter baumannii
- Tez No: 758583
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜRŞİT HASBEK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Sivas Cumhuriyet Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
Acinetobacter baumannii kritik bir hastane patojenidir. Solunum yolu enfeksiyonu, sepsis, idrar yolu ve yara enfeksiyonları gibi birçok ciddi enfeksiyondan sorumludur. Kolistin (CST) dahil olmak üzere mevcut tüm antimikrobiyallere direnç geliştirme yeteneği nedeniyle terapötik seçenekler son derece azdır. Metabolomik yöntem, ilaca dirençli bakteriler hakkında ek bilgi veren düşük moleküler ağırlıklı bileşiklerin ve bunlarla ilgili biyokimyasal yolların gözlemlenmesine yardımcı olabilir. Bu çalışmanın amacı, A. baumannii'nin kolistine duyarlı ve dirençli klinik suşları arasındaki metabolitlerin farklılıkların ekspresyonunu karşılaştırmaktır. Toplam 18 izolat (9 duyarlı suş ve 9 dirençli suş) analiz edildi. Metabolik profil oluşturma, Q-TOF LC/MS kütle spektrometresi (UPLC Q-TOF/MS) kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Veri toplama, sınıflandırma ve tanımlama LC-MS/MS verilerinin elde edilmesi için Agilent MassHunter yazılımı kullanıldı. Veri ön işleme, normalleştirme, görselleştirme ve tepe hizalama, XCMS ve Mass profiler Proffesional yazılımı kullanılarak gerçekleştirildi. Tanımlanan metabolitlerin açıklaması, MetaboAnalyst 5.0 yazılımı KEGG aracılığıyla yapıldı. Metabolik yol analizi için çevrimiçi yazılımlar ve veritabanları kullanılmıştır. Bunlar şunları içerir: PubChem, MetaCyc, ChEBI. Küresel metabolomik profillememiz, test edilen suşlar arasında önemli bir fark gösterdi. Bu çalışma, ilaç direncini anlamak ve/veya A. baumanni'ye karşı yeni tedavilerin keşfi hakkında tamamlayıcı araştırmalar için değerli bir bilgi kaynağı olabilir.
Özet (Çeviri)
Acinetobacter baumannii, a gram-negative bacteria, has emerged as a critical nosocomial pathogen. It is responsible for many serious infections such as pneumonia, sepsis, urinary tract, and wound infections. The therapeutic options are extremely limited because of its ability to develop resistance to all available antimicrobials, including colistin (CST). Metabolomics tools may aid in observing the low molecular weight compounds in biochemical pathways yielding additional information about drug‐resistant bacteria. The objective of this work was to compare the differential expression of metabolites between colistin-susceptible and resistant clinical strains of Acinetobacter baumannii. A total of 18 isolates (9 susceptible strains and 9 resistant strains) were analyzed. Metabolic profiling was performed using the Q-TOF LC/MS mass spectrometer (UPLC Q-TOF/MS). Agilent MassHunter software was used for the acquisition of LC-MS/MS data. Data preprocessing, normalization, visualization, and peak alignment were carried out using XCMS and Mass profiler professional software. Annotation of identified metabolites was performed via MetaboAnalyst 5.0 software and KEGG. Online software and databases were utilized for pathway analysis. They include PubChem, MetaCyc, and ChEBI. Our global metabolomic profiling showed a significant difference between the tested strains. This study can be a valuable source of information for complementary research on drug resistance and/or the development of novel therapeutic interventions to defeat Acinetobacter baumannii 's infections.
Benzer Tezler
- Pediatri kliniği servislerinde yatan ve gram-negatif çomak bakteriyemisi olan hastaların klinik ve epidemiolojik değerlendirilmesi
The clinical and epidemiological evaluation of the patients who have gram-negative bacteremia hospitalized in pediatric clinics.
BAHAR ÇALIŞKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul ÜniversitesiÇocuk Sağlığı Bölümü
PROF. DR. NURAN SALMAN
- Yoğun bakım ünitesinde kültür örneklerinde acinetobacter baumanii üremesi saptanan hastaların antimikrobiyal değerlendirmesi
In this study, antibiogram results of acinetobacterspecies that are identified on 647 patients that have stayed at intensive care units of gaziosmanpaşa university faculty of medicine hospital in between 2011-2018 were evaluated by vitek-2 system. as result of this evaluations, the most sensitive antimicrobial agents against acinetobacter species are colistins with sensivity rate %98,6. the second ones are tigecyclins with sensivity rate % 75,6 .
TUĞBA DOBAÇLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YUNUS BULUT
- Acinetobacter Spp.'e karşı kullanılan kolistin aktivitesine çok düşük frekanslı elektromanyetik alanın etkisi
Effect of extremely low frequency electromagnetic field on colistin activity used against acinetobacter Spp.
PINAR BİLECEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
BiyofizikMarmara ÜniversitesiBiyofizik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÜNSELİ AYŞE GARİP
YRD. DOÇ. DR. MEHMET BURAK AKSU
- Adaptation of acinetobacter baumannii to colistin exposure: In vivo and in vitro experience
Acinetobacter baumannii'nin kolistin maruziyetine uyumu: İn vivo ve in vitro deneyimler
EZGİ ORALKAN
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıKoç ÜniversitesiPROF. DR. FÜSUN CAN
- Acinetobacter baumannii izolatlarında virülans faktörleri ve antimikrobiyal direnç profilleri ile ilişkisi
The relationship between the virulence factors of acinetobacter baumannii isolates and the antimicrobial resistance profiles
NİLÜFER UĞUR ÖZLÜK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2016
MikrobiyolojiBülent Ecevit ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CANAN KÜLAH