Geri Dön

Live cell imaging of redox mediated nrf2 activity using transcription factor based biosensors and chemogenetic tools

Transkripsiyon faktorü tabanlı biyosensorler ve kemogenetik araçlar kullanarak redoks bağımlı nrf2 aktivasyonunun canlı hücrelerde görüntülenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 765128
  2. Yazar: BÜŞRA NUR OUF
  3. Danışmanlar: PROF. DR. LEVENT ÖZTÜRK, DR. ÖĞR. ÜYESİ EMRAH EROĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Biochemistry, Bioengineering, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Sabancı Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 67

Özet

Nükleer faktör eritroid 2-ilişkili faktör 2 (Nrf2), (pato)fizyolojik oksidan aracılı tepkileri düzenlemek için çoklu antioksidan tepki elemanına bağlı genlerin ekspresyonunu kontrol eden bir transkripsiyon faktörüdür. Auranofin altın(I) içeren bir ilaçtır ve bu ilacın farmakolojik aktivitesi, Nrf2 aktivasyonunu tetikleyebilmektedir. Bununla birlikte, auranofin aracılı Nrf2 aktivasyonunun altında yatan mekanizma belirsizliğini korumaktadır. Ayrıca auranofinin hücrede ROS üretimini de arttırdığı bilinmektedir. Bu çalışmada ROS üretiminin, özellikle hidrojen peroksitin (H2O2), auranofin aracılı Nrf2 aktivasyonu üzerindeki rolünü araştırdık. Ek olarak bu çalışmamızda, tek hücrelerde ve dokularda ROS seviyelerinin üretilmesine izin veren ve yüksek uzaysal-zamansal çözünürlüğe sahip kemogenetik D-amino asit oksidaz (DAAO) yaklaşımlarından yararlandık ve Nrf2 aktivasyonunu görselleştirmek için pLG4.mCherryNrf2 adlı transkripsiyon faktörü tabanlı biyosensör kullandık. HyPer olarak adlandırılan genetik olarak kodlanmış biyosensörü kullanarak, farklı hücre altı lokallerinde H2O2'yi izledik. Bulgularımız, auranofinin Nrf2 aktivitesini tetiklerken hücre içi H2O2 üretimini indüklediğini, ancak H2O2'nin hücreye dışarıdan verilmesi ve hücre içinde H2O2 üretilmesi durumunda Nrf2 aktivasyonunun değişmediğini gösterdi.

Özet (Çeviri)

Nuclear factor erythroid 2-related factor 2 (Nrf2) controls the expression of multiple antioxidant response element dependent genes to regulate the (patho)physiological oxidant mediated responses. Auranofin is a gold(I) containing drug of which the pharmacological activity is associated with its ability to induce Nrf2 activation. However, the mechanism of auranofin-mediated Nrf2 activation remains unclear. Auranofin also increases ROS production in the cell. We investigated the role of hydrogen peroxide (H2O2) on auranofin-mediated Nrf2 activation. In this study, we exploited chemogenetic D-amino acid oxidase (DAAO) approaches that permit the generation of H2O2 in single cells with high spatio-temporal resolution. we employed transcription factor-based biosensor called pLG4.mCherryNrf2 to visualize Nrf2 activation. By using genetically encoded biosensor HyPer7, we monitored H2O2 in different subcellular locales. Our findings showed that auranofin induces intracellular production of H2O2 while triggering Nrf2 activity, however, bolus administration of exogenous H2O2 or chemogenetically induced endogenous H2O2 generation did not change Nrf2 activation. Our findings draw new picture of oxidative stress dependent Nrf2 activation in cultured cells.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    897625

    Investigation of hydrogen peroxide and nitric oxide signaling utilizing genetically encoded biosensors

    Genetik olarak kodlanmış biyosensörler kullanılarak hidrojen peroksit ve nitrik oksit sinyalizasyonunun incelenmesi

    HAMZA YUSUF ALTUN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2024

    BiyokimyaSabancı Üniversitesi

    Mühendislik ve Doğa Bilimleri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SELİM ÇETİNER

  2. Tez No

    765270

    Total internal reflection holographic microscopy for cell extension imaging

    Holografik tam iç yansıma mikroskobuyla hücre uzantılarının görüntülenmesi

    TOLGA GÜRCAN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyofizikBoğaziçi Üniversitesi

    Fizik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET BURÇİN ÜNLÜ

    YRD. DOÇ. DR. MUHAMMED FATİH TOY

  3. Tez No

    711169

    Manipulating and visualizing the energy metabolism in single cells using chemogenetic tools and genetically encoded biosensors

    Tek hücre bazında enerji metabolizmasının kemogenetik araçlar ve genetik olarak kodlanmış biyosensörler kullanarak manipüle edilmesi ve görüntülenmesi

    ZEYNEP ÇOKLUK

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2021

    BiyokimyaSabancı Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. LEVENT ÖZTÜRK

    DR. EMRAH EROĞLU

  4. Tez No

    577552

    Investigation of the bacterial uptake of fluorescently labeled peptides and motility studies using lab-on-a-chip technology

    Floresanlı peptitlerin hücreye alınma mekanizması ve motilite çalışmalarının çip teknolojisi kullanılarak incelenmesi

    MERVE YÜCE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Kimya MühendisliğiBoğaziçi Üniversitesi

    Kimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞEFİKA KUTLU ÜLGEN

    DOÇ. DR. ELİF ÖZKIRIMLI ÖLMEZ

  5. Tez No

    473215

    Interactions of cancer cells and macrophages on the EGF-EGFR axis: Chemotaxis, haptotaxis or direct contact?

    EGF-EGFR ekseninde kanser hücreleri ve makrofajların etkileşimleri: Kemotaksis, haptotaksis ya da direkt temas?

    SEVGİ ÖNAL

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    Biyoteknolojiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. DEVRİM PESEN OKVUR

    PROF. DR. ESMA VOLGA BULMUŞ ZAREIE

Geri Dön