Geri Dön

Domateste MİR482e-3p ve FRG3 genleri arasındaki etkileşimin CRISPR sistemi aracılığıyla bozularak mutasyon oluşturulması

Creating mutation by disturbing the interaction between MIR482e-3p and FRG3 genes in tomato using the CRISPR system

  1. Tez No: 768345
  2. Yazar: ÖMER İLTER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. YELDA ÖZDEN ÇİFTÇİ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gebze Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 56

Özet

Bitki stres dayanıklılık mekanizmalarının karmaşıklığı nedeniyle sürdürülebilir tarım ürünlerinin geliştirilmesinde geleneksel bitki ıslahı tekniklerinin başarısı sınırlı kalmakta olup, son zamanlarda genom düzeltme teknolojisi ile istenilen gen üzerinde mutasyon oluşturma ve diziye özgü değişiklikler yapılması gibi birçok işleve sahip olan yeni yaklaşımlar geliştirilmektedir. CRISPR; kolay tasarımı, yüksek etkinliği ve esnekliği sayesinde bitki genom düzeltme araçları arasından sıyrılmayı başarmış ve yaygın olarak kullanılmaya başlanmıştır. Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici (FOL) domateste verim düşüklüğüne sebep olan en önemli patojenlerden biridir. FOL ile mücadelede en etkili çözüm hastalığa karşı dirençli çeşit geliştirmektir. Tez kapsamında, hastalığa karşı direnç sağladığı bilinen FRG3 (FOL Resistance Gene 3) geninin ve bu geni regüle eden SlmiR482e-3p gen dizisinin CRISPR aracılığıyla yeniden düzenlenerek, miRNA'nın mRNA'ya olan afinitesinin düşürülmesi yoluyla SlFRG3 geninin ekspresyonunun arttırılması amaçlanmıştır. Yapılan çalışmalar sonucunda SlmiR482e-3p geni üzerinde dizi değişikliği oluşturulmuş olup, bu mutasyonun miRNA'nın FRG3 mRNA'sına olan afinitesini düşürme, ve dolaylı olarak SlFRG3 geninin ekspresyonunu artırma potansiyeli bulunmaktadır.

Özet (Çeviri)

Due to the complexity of plant stress tolerance mechanisms, the success of traditional plant breeding techniques in the development of sustainable agricultural products is limited, and new approaches that have many functions such as making mutations and sequence-specific changes on the desired gene with genome editing technology have been developed recently. CRISPR; Thanks to its easy design, high efficiency and flexibility, has managed to stand out amongst the plant genome editing tools and has been widely used. Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersici (FOL) is one of the most important pathogens causing low yield in tomato. The most effective solution in the fight against FOL is to develop resistant cultivars against the disease. Within the scope of this thesis, it is aimed to increase the expression of the SlFRG3 gene by reducing the affinity of miRNA to mRNA by rearranging the FRG3 (FOL Resistance Gene 3) gene, which is known to provide resistance to the disease, and the SlmiR482e-3p gene sequence that regulates this gene by CRISPR. As a result of the studies, a sequence change was created on the SlmiR482e-3p gene, and this mutation has the potential to decrease the affinity of miRNA to FRG3 mRNA and indirectly increase the expression of the SlFRG3 gene.

Benzer Tezler

  1. Domateste tohum çimlenme ve fide kalitesi üzerine değişen azot ve fosfor dozlarının etkileri

    Effect of different nitrogen and phosphorus doses on seed germination and seedling quality on tomato

    TURGAY KABAY

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    ZiraatYüzüncü Yıl Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. FİKRİ BALTA

  2. Domateste demir eksikliğine dayanıklılığın morfolojik, fizyolojik ve genetiksel açıdan incelenmesi

    Morphological, physiological and genetic studies in tomato under iron (Fe) deficiency conditions

    HAYRİYE YILDIZ DAŞGAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1999

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KAZIM ABAK

    PROF. DR. İSMAİL ÇAKMAK

  3. Domateste sera koşullarında döllenme ve meyve tutumu sorunları ile tozlanmada bombus arılarının etkinliği

    Matters of fertilization and fruit set under greenhouse conditions in tomato and bumblebee efficiency in pollination

    KUBİLAY DERİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    1998

    ZiraatÇukurova Üniversitesi

    Bahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SİNAN ETİ

    PROF. DR. KAZIM ABAK

  4. A plant-mediated RNAi strategy targeting ache1 and SEC23 genes to combat tomato leafminer (tuta absoluta (meyrick)) in tomato

    Domateste, domates güvesiyle (tuta absoluta (meyrıck)) mücadelede ache1 ve SEC23 genlerini hedef alan bitki aracılı rnai stratejisi

    MUNEEB HASSAN HASHMI

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyoteknolojiNiğde Ömer Halisdemir Üniversitesi

    Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    ASSOC. DR. UFUK DEMİREL

    DOÇ. DR. ALLAH BAKHSH