Geri Dön

Korunga (Onobrychis viciifolia Scop.) sentromerik heterokromatin bileşenlerinin biyoinformatik, moleküler ve sitogenetik yöntemlerle analizi

Analysis of centromeric heterochromatin components by bioinformatics, molecular and cytogenetics methods in sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.)

PDF İndir

  1. Tez No: 773901
  2. Yazar: SEVİM DÖNDÜ KARA ÖZTÜRK
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. AHMET LATİF TEK
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoteknoloji, Genetik, Ziraat, Biotechnology, Genetics, Agriculture
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Niğde Ömer Halisdemir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tarımsal Genetik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 214

Özet

Sentromer bölgesi, tekrarlayan DNA elementlerini ve sentromere özgü histon H3 (CENH3) proteinini içermektedir. Sürdürülebilir tarım açısından önemli olan korunga (Onobrychis viciifolia) bitkisi tetraploid (2n=4x=28) yabancı döllenen çok yıllık bir baklagil yem bitkisidir. Bu çalışmada korunga bitkisine özgü beş CENH3 varyantı saptanmıştır ve OvCENH3-α ve OvCENH3-β olmak üzere iki grup altında ifade edilmiştir. Ayrıca sf180, sf169, sf176 ve sfdimer satelit DNA tekrar elementlerinin biyoinformatik, moleküler ve sitogenetik yönden karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Çalışma sonucunda sf180 ve sf169 elementlerinin OvCENH3 proteini ile interaksiyonda olduğu saptanmıştır. Sf176 ve sfdimer elementlerinin ise sentromer, subtelomer ve interstitial bölgelerde sinyaller verdiği gözlemlenmiştir. Bu tez çalışması sonucunda korunga sentromerik heterokromatin bölgesinin şimdiye kadar en kapsamlı ve çok yönlü karakterizasyonu gerçekleştirilmiştir. Tez çalışmasının çıktıları taksonomik çalışmalar ve sentromer mühendisliği aracılığıyla kromozom eliminasyonu temelli haploid bitki elde etme çalışmaları için evrensel ve özgün bir bilgi altyapısı sunmaktadır.

Özet (Çeviri)

The centromere region contains repetitive DNA elements and the centromere-specific histone H3 (CENH3) protein. The sainfoin (Onobrychis viciifolia), which is important for sustainable agriculture, is a tetraploid (2n=4x=28) cross-pollinated perennial legume forage plant. In this study, five CENH3 variants specific to the sainfoin plant were identified and categorized under two groups, OvCENH3-α and OvCENH3-β. In addition, bioinformatics, molecular and cytogenetic characterizations of sf180, sf169, sf176 and sfdimer satellite DNA repeat elements were performed. As a result of this study, it was determined that sf180 and sf169 elements interact with OvCENH3 protein. Sf176 and sfdimer elements were observed to occupy the centromeric, subtelomeric and interstitial regions. As a result of this thesis, the most comprehensive and systematic characterization of the sainfoin heterochromatin region has been performed to date. The outputs of the thesis provide a universal and fundamental information for future taxonomic studies and ways to obtain haploid plants by chromosome elimination via centromere engineering.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    382402

    Farklı korunga (Onobrychis viciifolia Scop.) ekotiplerinin tuza toleransının belirlenmesi ve in vitro mutagenesis tekniği aracılığıyla yeni korunga hatlarının geliştirilmesi

    Determination of salt tolerance of different sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) ecotypes and improvement of new sainfoin lines via in vitro mutagenesis technique

    RAMAZAN BEYAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Temel Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. CENGİZ SANCAK

  2. Tez No

    483519

    Bazı korunga (Onobrychis viciifolia SCOP.) çeşit ve populasyonlarında mikrosatellit belirteçleri kullanılarak genetik çeşitliliğin belirlenmesi

    Determination of genetic diversity in sainfoin (Onobrychis viciifolia SCOP.) variaties and populations using microsatellite markers

    SELMAN ÖZKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    BiyoteknolojiNamık Kemal Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. BEHİYE BANU BİLGEN

  3. Tez No

    175910

    Agrolistik yöntemi ile korunga (Onobrychis viciifolia Scop.) kotiledonlarına b-glukuronidaz (Gus) geni aktarımı

    Transfer of b-glucuronidase (Gus) gene to sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) cotyledons by agrolistic method

    TÜLİN ÖZKAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    BiyokimyaAnkara Üniversitesi

    Disiplinlerarası Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT ÖZGEN

  4. Tez No

    299700

    Farklı kökenli korunga (Onobrychis viciifolia Scop. ve Onobrychis altissima Grossh) popupasyonlarının tarımsal özelliklerinin belirlenmesi

    Determination of agricultural characteristics of different orijinated sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop. and Onobrychis altissima Grossh) populations

    HAKAN CEBECİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    ZiraatAnkara Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HAYRETTİN EKİZ

  5. Tez No

    604119

    Farklı sıra aralıkları ve tohumluk miktarlarının korunga (Onobrychis viciifolia Scop.)'nın gelişimi ve yabancı ot rekabeti üzerine etkileri

    Effects of different row spacing and seed amounts to the development and weed competition of sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.)

    BANUR YILMAZ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    ZiraatÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET GÖKKUŞ

Geri Dön