Geri Dön

In-silico models in antifouling paint technology

Antifouling boya teknolojisinde in-siliko modeller

  1. Tez No: 774236
  2. Yazar: CENGİZHAN DAĞ
  3. Danışmanlar: PROF. DR. LEVENT ÇAVAŞ
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2022
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 120

Özet

Cansız yüzeylerin canlı organizmalar tarafından kaplanmasına biyofouling denir. Denizel alanda ekosistemin bir gereği olan biyofouling, denizel endüstriler için istenmeyen sonuçlara yol açmaktadır. Akuakültür ağlarının biyofouling oluşturan canlılara sağladığı geniş yaşam alanı, organizmaların bu yüzeye istilasına neden olur. Biyofouling nedeniyle kafes ağlarının gözenekleri kapanır, toplam kütle ve hidrodinamik sürtünme artar ve kafes sistem taşıyıcılarına zarar verir. Biyofouling nedeniyle kapanan ağ gözenekleri, oksijence zengin deniz suyunun kafese geçişini azaltır ve biyolojik atıkların kafesten çıkmasını engeller. Bu çalışmada, antifouling kaplamaların antifouling özelliklerini değerlendirmek için in-siliko tekniklerin tutarlılığı test edilmiştir. Moleküler doklama analizlerinde Balanus amphitrite, Hydroides elegans, Bugula neritina ve Ulva lactuca'nın hedef proteinleri kullanıldı. Kültür balıkçılığı ağlarını kaplamak için ana bağlayıcı olarak rosin, parafin mumu, stiren-akrilik kopolimer ve lanolin kullanılmıştır. Alan testlerinde biyosit olarak econea, diuron ve irgarol kullanılmıştır. Moleküler doklama analiz sonuçlarına göre econea, B. amphitrite, H. elegans, B. neritina ve U. lactuca hedef proteinlerine en yüksek bağlanma afinitesini elde etmiştir (Sırasıyla, -7.0 kcal/mol, -6.0 kcal/mol, -9.2 kcal/mol and -6.7 kcal/mol). Alan testlerinde econea'nın diuron ve irgarol ile karşılaştırıldığında en iyi performansı verdiği gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, gözlemlenen yüksek korelasyon sayesinde moleküler doklama algoritmaları, geleneksel antifouling boya teknolojisi geliştirme süreçlerini bir sonraki seviyeye taşıyacaktır

Özet (Çeviri)

The coating of inanimate surfaces by living organisms is called biofouling. Biofouling, which is a necessity of the ecosystem in the marine field, causes undesirable consequences for the marine industries. The wide living space provided by aquaculture nets to biofouling creatures, causes the invasion of the organisms to this surface. Due to the biofouling, the pores of the cage nets are closed, the total mass and the hydrodynamic friction increases and damages the cage system carriers. The net pores, which are closed due to biofouling, reduce the passage of oxygen-rich sea water into the cage and prevent the biological wastes from leaving the cage. In this study, the consistency of in-silico techniques was tested to evaluate the antifouling properties of coatings. The target proteins of Balanus amphitrite, Hydroides elegans, Bugula neritina and Ulva lactuca were used in molecular docking analyses. In order to coat the aquaculture nets, rosin, paraffin wax, styrene-acrylic co-polymer and lanolin were used as main binders. Econea, diuron and irgarol were used as biocides in field experiment. According to the results of molecular docking analysis, econea achieved the highest binding affinities to the targets proteins of B. amphitrite, H. elegans, B. neritina and U. lactuca (-7.0 kcal/mol, -6.0 kcal/mol, -9.2 kcal/mol and -6.7 kcal/mol, respectively). In field tests, it has also been observed that econea gives the best performance compared to diuron and irgarol. In conclusion, due to the high correlation was observed, molecular docking algorithms will take traditional antifouling technology development processes to the next level.

Benzer Tezler

  1. Bio-industrial active agents from sea cucumbers along Turkish coastlines

    Türk kıyılarındaki deniz hıyarlarından biyo-endüstriyel aktif ajanlar

    NAZLI MERT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyoteknolojiDokuz Eylül Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. LEVENT ÇAVAŞ

  2. Obtaining underwater adhesive materials and characterization of their adhesive properties to different surfaces by ESR spectroscopy

    Sulu ortamda yapışkanlık özelliği gösterebilen malzemelerin elde edilmesi ve farklı yüzeylere olan yapışkanlıklarının ESR spektroskopisi ile çalışılması

    İKLİMA KIRPAT

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    Polimer Bilim ve Teknolojisiİzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü

    Malzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. YAŞAR AKDOĞAN

  3. Fabrication and characterization of nanocomposite flat-sheet polymeric membranes

    Polimerik nanokompozit düz plaka membranların üretimi ve karakterizasyonu

    MERVE ŞİLE

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Nanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İSMAİL KOYUNCU

  4. Comparison of Entropy and Ensemble-based feature selection through network analysis of Alzheimers disease-associated variants

    Alzheimer ile ilişkili varyantların ağ analizi üzerinden Entropy ve Ensemble bazlı değişken seçiminin karşılaştırılması

    SEVDA RAFATOV

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    BiyoistatistikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Sağlık Bilişimi Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON

  5. Organik bileşiklerin akuatik toksisitelerinin in siliko yöntemlerle araştırılması ve tahmini

    Investigation and prediction of aquatic toxicity of organic compounds via in silico methods

    ELİF MERVE EMİNOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    KimyaMarmara Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SAFİYE ERDEM

    PROF. DR. MELEK TÜRKER SAÇAN