In-silico models in antifouling paint technology
Antifouling boya teknolojisinde in-siliko modeller
- Tez No: 774236
- Danışmanlar: PROF. DR. LEVENT ÇAVAŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Chemistry
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 120
Özet
Cansız yüzeylerin canlı organizmalar tarafından kaplanmasına biyofouling denir. Denizel alanda ekosistemin bir gereği olan biyofouling, denizel endüstriler için istenmeyen sonuçlara yol açmaktadır. Akuakültür ağlarının biyofouling oluşturan canlılara sağladığı geniş yaşam alanı, organizmaların bu yüzeye istilasına neden olur. Biyofouling nedeniyle kafes ağlarının gözenekleri kapanır, toplam kütle ve hidrodinamik sürtünme artar ve kafes sistem taşıyıcılarına zarar verir. Biyofouling nedeniyle kapanan ağ gözenekleri, oksijence zengin deniz suyunun kafese geçişini azaltır ve biyolojik atıkların kafesten çıkmasını engeller. Bu çalışmada, antifouling kaplamaların antifouling özelliklerini değerlendirmek için in-siliko tekniklerin tutarlılığı test edilmiştir. Moleküler doklama analizlerinde Balanus amphitrite, Hydroides elegans, Bugula neritina ve Ulva lactuca'nın hedef proteinleri kullanıldı. Kültür balıkçılığı ağlarını kaplamak için ana bağlayıcı olarak rosin, parafin mumu, stiren-akrilik kopolimer ve lanolin kullanılmıştır. Alan testlerinde biyosit olarak econea, diuron ve irgarol kullanılmıştır. Moleküler doklama analiz sonuçlarına göre econea, B. amphitrite, H. elegans, B. neritina ve U. lactuca hedef proteinlerine en yüksek bağlanma afinitesini elde etmiştir (Sırasıyla, -7.0 kcal/mol, -6.0 kcal/mol, -9.2 kcal/mol and -6.7 kcal/mol). Alan testlerinde econea'nın diuron ve irgarol ile karşılaştırıldığında en iyi performansı verdiği gözlemlenmiştir. Sonuç olarak, gözlemlenen yüksek korelasyon sayesinde moleküler doklama algoritmaları, geleneksel antifouling boya teknolojisi geliştirme süreçlerini bir sonraki seviyeye taşıyacaktır
Özet (Çeviri)
The coating of inanimate surfaces by living organisms is called biofouling. Biofouling, which is a necessity of the ecosystem in the marine field, causes undesirable consequences for the marine industries. The wide living space provided by aquaculture nets to biofouling creatures, causes the invasion of the organisms to this surface. Due to the biofouling, the pores of the cage nets are closed, the total mass and the hydrodynamic friction increases and damages the cage system carriers. The net pores, which are closed due to biofouling, reduce the passage of oxygen-rich sea water into the cage and prevent the biological wastes from leaving the cage. In this study, the consistency of in-silico techniques was tested to evaluate the antifouling properties of coatings. The target proteins of Balanus amphitrite, Hydroides elegans, Bugula neritina and Ulva lactuca were used in molecular docking analyses. In order to coat the aquaculture nets, rosin, paraffin wax, styrene-acrylic co-polymer and lanolin were used as main binders. Econea, diuron and irgarol were used as biocides in field experiment. According to the results of molecular docking analysis, econea achieved the highest binding affinities to the targets proteins of B. amphitrite, H. elegans, B. neritina and U. lactuca (-7.0 kcal/mol, -6.0 kcal/mol, -9.2 kcal/mol and -6.7 kcal/mol, respectively). In field tests, it has also been observed that econea gives the best performance compared to diuron and irgarol. In conclusion, due to the high correlation was observed, molecular docking algorithms will take traditional antifouling technology development processes to the next level.
Benzer Tezler
- Bio-industrial active agents from sea cucumbers along Turkish coastlines
Türk kıyılarındaki deniz hıyarlarından biyo-endüstriyel aktif ajanlar
NAZLI MERT
Yüksek Lisans
İngilizce
2014
BiyoteknolojiDokuz Eylül ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LEVENT ÇAVAŞ
- Obtaining underwater adhesive materials and characterization of their adhesive properties to different surfaces by ESR spectroscopy
Sulu ortamda yapışkanlık özelliği gösterebilen malzemelerin elde edilmesi ve farklı yüzeylere olan yapışkanlıklarının ESR spektroskopisi ile çalışılması
İKLİMA KIRPAT
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Polimer Bilim ve Teknolojisiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMalzeme Bilimi ve Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YAŞAR AKDOĞAN
- Fabrication and characterization of nanocomposite flat-sheet polymeric membranes
Polimerik nanokompozit düz plaka membranların üretimi ve karakterizasyonu
MERVE ŞİLE
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiNanobilim ve Nanomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. İSMAİL KOYUNCU
- Comparison of Entropy and Ensemble-based feature selection through network analysis of Alzheimers disease-associated variants
Alzheimer ile ilişkili varyantların ağ analizi üzerinden Entropy ve Ensemble bazlı değişken seçiminin karşılaştırılması
SEVDA RAFATOV
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
BiyoistatistikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiSağlık Bilişimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON
- Organik bileşiklerin akuatik toksisitelerinin in siliko yöntemlerle araştırılması ve tahmini
Investigation and prediction of aquatic toxicity of organic compounds via in silico methods
ELİF MERVE EMİNOĞLU
Doktora
Türkçe
2024
KimyaMarmara ÜniversitesiKimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SAFİYE ERDEM
PROF. DR. MELEK TÜRKER SAÇAN