Çeşitli kaynaklardan izole edilen metisilin dirençli staphylococcus aureus suşlarının virülans faktörleri üzerine daptomisin ve linezolidin sub minimal inhibitör konsantrasyonlarının etkisi
Effect of sub minimal inhibitory concentrations of daptomycin and linezolid on virulence factors of methicillin resistant staphylococcus aureus strains isolated from various sources
- Tez No: 776830
- Danışmanlar: PROF. DR. NURTEN ALTANLAR, PROF. DR. SULHİYE YILDIZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2022
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 94
Özet
Antibiyotikler çevresel ortamlarda veya tedavinin iki dozu arasında vücudun çeşitli bölmelerinde sub-MİK konsantrasyonlarda bulunabilirler. Sub-MİK konsantrasyonlar bakterileri öldürmemesine rağmen bakterinin morfolojisi, enzim ve toksin üretimi, biyofilm oluşumu gibi çeşitli virülans faktörlerine etki edebilir. Çalışmamız Ankara Üniversitesi Hastanelerinden elde ettiğimiz 32 MRSA suşu ile yürütülmüştür. Bu suşların daptomisin ve linezolid antibiyotiklerinin ½ sub-MİK konsantrasyonlarına seri pasajlar ile maruziyeti sonrasında suşlardaki direnç oluşumu, biyofilm oluşturma özelliğindeki değişim incelenmiş ve metisilin direnç geni (mecA), biyofilm ilişkili genler (icaA, icaD), enterotoksin genleri (sea,sed), toksik şok sendromu toksini-1 geni (tst)'nin varlığı konvansiyonel PZR ile araştırılmıştır. Suşlar fenotipik ve genotipik yöntemler ile MRSA olarak doğrulanmıştır. Sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle gerçekleştirilen antibiyotik duyarlılık deneyleri ile suşların daptomisin ve linezolid için 1. MİK değerleri tespit edilmiştir. Seri pasaj deneyleri sonrasında 2. MİK ve 3.MİK değerleri belirlenmiştir. Suşların, daptomisin ve linezolid 1. MİK ve 3. MİK değerleri kar-şılaştırıldığında linezolidde 2-8 kat, daptomisinde 4-32 kat artış olduğu, bu artışların istatistiksel olarak anlamlı bir fark olduğu belirlenmiştir (p0,05). Konvansiyonel PZR yöntemiyle, metisilin direnç geni mecA, suşların %100'ünde, biyofilm ilişkili icaA ve icaD genleri %96,9'unda, enterotoksin genleri sea %100'ünde, sed %6,25'inde, toksik şok sendromu toksini-1 geni tst %6,25'inde tespit edilmiştir. Çalışmamızda suşların daptomisin ve linezolid antibiyotiklerinin ½ sub-MİK konsantrasyonlarına seri pasajlar ile maruziyeti sonrasında MİK değerlerinde artış olduğu belirlenmiştir. 2. seri pasajlar sonrasındaki suşların biyofilm oluşturma özelliğinin suşun ve antibiyotiğin türüne göre değiştiği görülmüştür. Suşlardaki enterotoksin genleri ve toksik şok sendromu toksini-1 geninin çeşitli oranlarda tespit edilmesi, mutlaka toksin üretimini göstermemekle birlikte enterotoksin genlerinin stafilokokal gıda zehirlenmeleri, toksik şok sendromu toksini-1 geninin ise toksik şok sendromu için potansiyel risk oluşturabileceğini düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
Antibiotics may be present in sub-MIC concentrations between two doses of therapy, in various parts of the body or in environmental settings. Although sub-MIC con-centrations do not kill bacteria, they can affect various virulence factors such as bacterial morphology, enzyme and toxin production, biofilm formation. Our study was carried out with 32 MRSA strains obtained from Ankara University Hospitals. After the exposure of these strains to ½ sub-MIC concentrations of daptomycin and linezolid antibiotics with serial passages, the formation of resistance in the strains and the change in biofilm formation properties were investigated and the presence of methicillin resistance gene (mecA), biofilm-related genes (icaA, icaD), enterotoxin genes (sea,sed), toxic shock syndrome toxin-1 gene (tst) were investigated by conventional PCR. The strains were confirmed as MRSA by phenotypic and genotypic methods. The 1. MIC values for daptomycin and linezolid of the strains were determined by antibiotic susceptibility experiments performed by broth microdilution method. After serial passage experiments, 2. MIC and 3. MIC values were determined. When the daptomycin and linezolid 1. MIC and 3. MIC values of the strains were compared, it was determined that there was a 2-8 fold increase in linezolid and 4-32 fold increase in daptomycin, and these increases were statistically significant (p0,05). By conventional PCR method, methicillin resistance gene mecA was detected in 100% of strains, biofilm-related icaA and icaD genes in 96.9%, enterotoxin genes sea in 100%, sed in 6.25%, toxic shock syndrome toxin-1 gene tst in 6.25%. In our study, it was determi-ned that there was an increase in MIC values after exposure of strains to ½ sub-MIC concentrations of daptomycin and linezolid antibiotics with serial passages. It was ob-served that the biofilm forming properties of the strains after the 2. series of passages varied according to the strain and the type of antibiotic. Although the detection of ente-rotoxin genes and toxic shock syndrome toxin-1 gene at various rates in strains does not necessarily indicate toxin production, we think that enterotoxin genes may pose a potential risk for staphylococcal food poisoning and toxic shock syndrome toxin-1 gene for toxic shock syndrome.
Benzer Tezler
- Çeşitli kaynaklardan izole edilen staphylococcus aureus'un bazı virulens özelliklerinin belirlenmesi
Determination of some virulence features of staphylococcus aureus isolated from various sources
PELİN KOÇAK KIZANLIK
Doktora
Türkçe
2019
Besin Hijyeni ve TeknolojisiAydın Adnan Menderes ÜniversitesiBesin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERGÜN ÖMER GÖKSOY
- Çeşitli kaynaklardan izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının pulsed field jel elektroforezi yöntemi ile tiplendirilmesi, metisilin direnci ve bazı genlerin multiplex PCR yöntemi ile belirlenmesi
Typing of Staphylococcus aureus strains isolated from various sources by pulsed field gel electrophoresis method, detection of their methicillin resistance and some genes by multiplex PCR method
ERDOĞAN GÜNEŞ
- Staphylococcus aureus suşlarının PFGE (pulsed field jel elektroforez) tekniğiyle moleküler ilişkilendirilmesi
Molecular association of Staphylococcus aureus strains by PFGE (pulsed field gel electrophoresis) technique
GÖKSEL TEKİNASLAN
- Çeşitli kaynaklardan izole edilen Staphylococcus aureus suşlarının metisilin direncinin farklı yöntemlerle araştırılması
Investigation of methicillin resistance by different methods in Staphylococcus aureus strains which isolated from various sources
ERDOĞAN GÜNEŞ
- İstiridye kaynaklı defensin ve prolince zengin antimikrobiyal peptidlerin pichia pastoris'te rekombinant olarak üretimi
Recombinant production of oyster defensin and proline rich antimicrobial peptides in pichia pastoris
MİNE ERDEM BÜYÜKKİRAZ
Doktora
Türkçe
2019
BiyoteknolojiErciyes ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜLAL KESMEN